Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G054400.1
Synonym Sb02g004550, PKP1, PKP-ALPHA
Functional annotation pyruvate kinase, putative, expressed
UniProt C5XB26
Pfam PF02887 PF00224
Panther DB PTHR11817 PTHR11817:SF14
NCBI CDD KOG2323; Pyruvate kinase
KEGG Orthology K00873; PK, pyruvate kinase
Gene Ontology GO:0006096; glycolytic process GO:0004743pyruvate kinase activity GO:0000287magnesium ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G22960 : Pyruvate kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g08340.1 : pyruvate kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045180 , Zm00025a008562
Brachypodium KQK20587
Barley HORVU2Hr1G050140.1 , HORVU2Hr1G050140.3 , HORVU2Hr1G050140.4 , HORVU2Hr1G050140.5 , HORVU2Hr1G050140.6 , HORVU2Hr1G050140.7 , HORVU2Hr1G050140.8 , HORVU2Hr1G050140.2
Wheat TraesCS2A02G240200 , TraesCS2D02G237900 , TraesCS2B02G257800
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G054400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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11 Sobic.010G179300 - -
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13 Sobic.009G031800 - -
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K12486: stromal membrane-associated protein
15 Sobic.006G262501 - -
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18 Sobic.009G012500 RPA1C - Putative single-stranded DNA binding complex subunit 1, expressed K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
19 Sobic.004G291200 - -
20 Sobic.001G027500 haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G054400 Sobic002G054400 Sobic005G045700 Sobic005G045700 Sobic002G054400--Sobic005G045700 Sobic008G191850 Sobic008G191850 Sobic002G054400--Sobic008G191850 Sobic002G366300 Sobic002G366300 Sobic002G054400--Sobic002G366300 Sobic009G012600 Sobic009G012600 Sobic002G054400--Sobic009G012600 Sobic008G165300 Sobic008G165300 Sobic002G054400--Sobic008G165300 Sobic004G123200 Sobic004G123200 Sobic002G054400--Sobic004G123200 Sobic002G266300 Sobic002G266300 Sobic002G054400--Sobic002G266300 Sobic004G290100 Sobic004G290100 Sobic002G054400--Sobic004G290100 Sobic008G178566 Sobic008G178566 Sobic002G054400--Sobic008G178566 Sobic002G127900 Sobic002G127900 Sobic005G045700--Sobic002G127900 Sobic007G053100 Sobic007G053100 Sobic005G045700--Sobic007G053100 Sobic005G045700--Sobic002G266300 Sobic005G045700--Sobic002G054400 Sobic003G368901 Sobic003G368901 Sobic005G045700--Sobic003G368901 Sobic001G125300 Sobic001G125300 Sobic005G045700--Sobic001G125300 Sobic005G045700--Sobic009G012600 Sobic005G045700--Sobic008G191850 Sobic006G262501 Sobic006G262501 Sobic005G045700--Sobic006G262501 Sobic008G191850--Sobic002G266300 Sobic004G066500 Sobic004G066500 Sobic008G191850--Sobic004G066500 Sobic005G021000 Sobic005G021000 Sobic008G191850--Sobic005G021000 Sobic001G534200 Sobic001G534200 Sobic008G191850--Sobic001G534200 Sobic002G010000 Sobic002G010000 Sobic008G191850--Sobic002G010000 Sobic006G217800 Sobic006G217800 Sobic008G191850--Sobic006G217800 Sobic001G336200 Sobic001G336200 Sobic008G191850--Sobic001G336200 Sobic004G347500 Sobic004G347500 Sobic008G191850--Sobic004G347500 Sobic008G191850--Sobic007G053100 Sobic010G179300 Sobic010G179300 Sobic002G366300--Sobic010G179300 Sobic001G125400 Sobic001G125400 Sobic002G366300--Sobic001G125400 Sobic005G147600 Sobic005G147600 Sobic002G366300--Sobic005G147600 Sobic007G025600 Sobic007G025600 Sobic002G366300--Sobic007G025600 Sobic006G083900 Sobic006G083900 Sobic002G366300--Sobic006G083900 Sobic006G167700 Sobic006G167700 Sobic002G366300--Sobic006G167700 Sobic009G103800 Sobic009G103800 Sobic002G366300--Sobic009G103800 Sobic002G184700 Sobic002G184700 Sobic002G366300--Sobic002G184700 Sobic002G366300--Sobic001G534200 Sobic007G050800 Sobic007G050800 Sobic009G012600--Sobic007G050800 Sobic009G012600--Sobic005G045700 Sobic006G226000 Sobic006G226000 Sobic009G012600--Sobic006G226000 Sobic007G192200 Sobic007G192200 Sobic009G012600--Sobic007G192200 Sobic009G002200 Sobic009G002200 Sobic009G012600--Sobic009G002200 Sobic005G036200 Sobic005G036200 Sobic009G012600--Sobic005G036200 Sobic010G037901 Sobic010G037901 Sobic009G012600--Sobic010G037901 Sobic009G012600--Sobic006G262501 Sobic009G012600--Sobic008G191850 Sobic008G165300--Sobic001G125400 Sobic008G018100 Sobic008G018100 Sobic008G165300--Sobic008G018100 Sobic008G165300--Sobic006G083900 Sobic008G165300--Sobic002G127900 Sobic008G165300--Sobic010G179300 Sobic001G393101 Sobic001G393101 Sobic008G165300--Sobic001G393101 Sobic008G165300--Sobic002G266300 Sobic008G165300--Sobic006G217800 Sobic003G434300 Sobic003G434300 Sobic008G165300--Sobic003G434300 Sobic002G055800 Sobic002G055800 Sobic004G123200--Sobic002G055800 Sobic009G012500 Sobic009G012500 Sobic004G123200--Sobic009G012500 Sobic004G222150 Sobic004G222150 Sobic004G123200--Sobic004G222150 Sobic004G123200--Sobic006G083900 Sobic004G123200--Sobic006G226000 Sobic002G256900 Sobic002G256900 Sobic004G123200--Sobic002G256900 Sobic004G123200--Sobic006G217800 Sobic004G123200--Sobic002G266300 Sobic004G123200--Sobic001G393101 Sobic002G266300--Sobic006G217800 Sobic002G266300--Sobic005G021000 Sobic002G266300--Sobic001G534200 Sobic001G254800 Sobic001G254800 Sobic002G266300--Sobic001G254800 Sobic002G266300--Sobic001G125400 Sobic009G025500 Sobic009G025500 Sobic002G266300--Sobic009G025500 Sobic002G266300--Sobic007G053100 Sobic003G398200 Sobic003G398200 Sobic002G266300--Sobic003G398200 Sobic006G208000 Sobic006G208000 Sobic002G266300--Sobic006G208000 Sobic001G342900 Sobic001G342900 Sobic004G290100--Sobic001G342900 Sobic004G290100--Sobic002G054400 Sobic004G290200 Sobic004G290200 Sobic004G290100--Sobic004G290200 Sobic001G125500 Sobic001G125500 Sobic004G290100--Sobic001G125500 Sobic004G290100--Sobic005G045700 Sobic007G122700 Sobic007G122700 Sobic004G290100--Sobic007G122700 Sobic003G427200 Sobic003G427200 Sobic004G290100--Sobic003G427200 Sobic008G046000 Sobic008G046000 Sobic004G290100--Sobic008G046000 Sobic002G383700 Sobic002G383700 Sobic004G290100--Sobic002G383700 Sobic008G178533 Sobic008G178533 Sobic008G178566--Sobic008G178533 Sobic008G178566--Sobic009G012500 Sobic007G160400 Sobic007G160400 Sobic008G178566--Sobic007G160400 Sobic008G178566--Sobic006G226000 Sobic004G291200 Sobic004G291200 Sobic008G178566--Sobic004G291200 Sobic008G178566--Sobic004G123200 Sobic008G178566--Sobic010G179300 Sobic008G178566--Sobic006G083900 Sobic008G178566--Sobic001G534200
Octagon: transcription factors


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