Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G290100.1
Synonym PHGPX, LSC803, ATGPX6, GPX6
Functional annotation glutathione peroxidase, putative, expressed
UniProt A0A194YS45
Pfam PF00255
Panther DB PTHR11592 PTHR11592:SF42
NCBI CDD KOG1651; Glutathione peroxidase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006979; response to oxidative stress GO:0004602glutathione peroxidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G11600 : glutathione peroxidase 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g44500.1 : glutathione peroxidase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032236
Brachypodium KQK00667
Barley HORVU6Hr1G063830.10 , HORVU6Hr1G063830.2 , HORVU6Hr1G063830.3 , HORVU6Hr1G063830.1 , HORVU6Hr1G063830.6 , HORVU6Hr1G063830.8 , HORVU6Hr1G063830.9
Wheat TraesCS6D02G228800 , TraesCS6A02G246400 , TraesCS6B02G278100
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.004G290100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G342900 ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial precursor, putative, expressed K18587: ubiquinone biosynthesis protein COQ9
2 Sobic.002G054400 pyruvate kinase, putative, expressed K00873: PK, pyruvate kinase
3 Sobic.004G290200 glutathione peroxidase, putative, expressed -
4 Sobic.001G125500 ethylene-insensitive protein, putative, expressed K14513: ethylene-insensitive protein 2
5 Sobic.005G045700 PHD-finger family protein, expressed -
6 Sobic.007G122700 expressed protein -
7 Sobic.003G427200 uridine 5-monophosphate synthase, putative, expressed K13421: uridine monophosphate synthetase
K12486: stromal membrane-associated protein
8 Sobic.008G046000 expressed protein -
9 Sobic.002G383700 4-alpha-glucanotransferase, chloroplast precursor, putative, expressed K00705: 4-alpha-glucanotransferase
10 Sobic.002G127900 ELMO/CED-12 family protein, putative, expressed K08869: ADCK, aarF domain-containing kinase
11 Sobic.006G212900 expressed protein K12606: RCD1, CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9
12 Sobic.003G166500 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
13 Sobic.001G434700 phosphomevalonate kinase, putative, expressed K00938: E2.7.4.2, phosphomevalonate kinase
14 Sobic.008G043600 exo70 exocyst complex subunit, putative, expressed K07195: EXOC7, exocyst complex component 7
15 Sobic.003G256800 RNA polymerase III subunit RPC82 family protein, putative, expressed K03023: RPC3, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3
16 Sobic.003G433300 DNA mismatch repair protein Mlh1, putative, expressed K08734: DNA mismatch repair protein MLH1
17 Sobic.005G212201 - -
18 Sobic.003G023200 DNA repair protein Rad51, putative, expressed K10870: RAD51L2, RAD51-like protein 2
19 Sobic.001G120600 - -
20 Sobic.002G363800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G290100 Sobic004G290100 Sobic001G342900 Sobic001G342900 Sobic004G290100--Sobic001G342900 Sobic002G054400 Sobic002G054400 Sobic004G290100--Sobic002G054400 Sobic004G290200 Sobic004G290200 Sobic004G290100--Sobic004G290200 Sobic001G125500 Sobic001G125500 Sobic004G290100--Sobic001G125500 Sobic005G045700 Sobic005G045700 Sobic004G290100--Sobic005G045700 Sobic007G122700 Sobic007G122700 Sobic004G290100--Sobic007G122700 Sobic003G427200 Sobic003G427200 Sobic004G290100--Sobic003G427200 Sobic008G046000 Sobic008G046000 Sobic004G290100--Sobic008G046000 Sobic002G383700 Sobic002G383700 Sobic004G290100--Sobic002G383700 Sobic006G250800 Sobic006G250800 Sobic001G342900--Sobic006G250800 Sobic009G116900 Sobic009G116900 Sobic001G342900--Sobic009G116900 Sobic001G404900 Sobic001G404900 Sobic001G342900--Sobic001G404900 Sobic001G342900--Sobic004G290100 Sobic002G306100 Sobic002G306100 Sobic001G342900--Sobic002G306100 Sobic003G193500 Sobic003G193500 Sobic001G342900--Sobic003G193500 Sobic009G128500 Sobic009G128500 Sobic001G342900--Sobic009G128500 Sobic007G087000 Sobic007G087000 Sobic001G342900--Sobic007G087000 Sobic003G235100 Sobic003G235100 Sobic001G342900--Sobic003G235100 Sobic002G054400--Sobic005G045700 Sobic008G191850 Sobic008G191850 Sobic002G054400--Sobic008G191850 Sobic002G366300 Sobic002G366300 Sobic002G054400--Sobic002G366300 Sobic009G012600 Sobic009G012600 Sobic002G054400--Sobic009G012600 Sobic008G165300 Sobic008G165300 Sobic002G054400--Sobic008G165300 Sobic004G123200 Sobic004G123200 Sobic002G054400--Sobic004G123200 Sobic002G266300 Sobic002G266300 Sobic002G054400--Sobic002G266300 Sobic002G054400--Sobic004G290100 Sobic008G178566 Sobic008G178566 Sobic002G054400--Sobic008G178566 Sobic004G290200--Sobic004G290100 Sobic004G290200--Sobic001G125500 Sobic001G434700 Sobic001G434700 Sobic004G290200--Sobic001G434700 Sobic004G290200--Sobic001G342900 Sobic008G037700 Sobic008G037700 Sobic004G290200--Sobic008G037700 Sobic003G166500 Sobic003G166500 Sobic004G290200--Sobic003G166500 Sobic008G097600 Sobic008G097600 Sobic004G290200--Sobic008G097600 Sobic004G037200 Sobic004G037200 Sobic004G290200--Sobic004G037200 Sobic010G155600 Sobic010G155600 Sobic004G290200--Sobic010G155600 Sobic003G230600 Sobic003G230600 Sobic001G125500--Sobic003G230600 Sobic002G363800 Sobic002G363800 Sobic001G125500--Sobic002G363800 Sobic001G125500--Sobic009G128500 Sobic003G256800 Sobic003G256800 Sobic001G125500--Sobic003G256800 Sobic001G308400 Sobic001G308400 Sobic001G125500--Sobic001G308400 Sobic006G245900 Sobic006G245900 Sobic001G125500--Sobic006G245900 Sobic002G381900 Sobic002G381900 Sobic001G125500--Sobic002G381900 Sobic002G241600 Sobic002G241600 Sobic001G125500--Sobic002G241600 Sobic002G296400 Sobic002G296400 Sobic001G125500--Sobic002G296400 Sobic002G127900 Sobic002G127900 Sobic005G045700--Sobic002G127900 Sobic007G053100 Sobic007G053100 Sobic005G045700--Sobic007G053100 Sobic005G045700--Sobic002G266300 Sobic005G045700--Sobic002G054400 Sobic003G368901 Sobic003G368901 Sobic005G045700--Sobic003G368901 Sobic001G125300 Sobic001G125300 Sobic005G045700--Sobic001G125300 Sobic005G045700--Sobic009G012600 Sobic005G045700--Sobic008G191850 Sobic006G262501 Sobic006G262501 Sobic005G045700--Sobic006G262501 Sobic003G005500 Sobic003G005500 Sobic007G122700--Sobic003G005500 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic007G122700--Sobic009G163400 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic007G122700--Sobic008G141900 Sobic003G045450 Sobic003G045450 Sobic007G122700--Sobic003G045450 Sobic001G010500 Sobic001G010500 Sobic007G122700--Sobic001G010500 Sobic004G276000 Sobic004G276000 Sobic007G122700--Sobic004G276000 Sobic001G376501 Sobic001G376501 Sobic007G122700--Sobic001G376501 Sobic008G046200 Sobic008G046200 Sobic007G122700--Sobic008G046200 Sobic006G119900 Sobic006G119900 Sobic007G122700--Sobic006G119900 Sobic004G291200 Sobic004G291200 Sobic003G427200--Sobic004G291200 Sobic003G427200--Sobic002G266300 Sobic010G024600 Sobic010G024600 Sobic003G427200--Sobic010G024600 Sobic004G033200 Sobic004G033200 Sobic003G427200--Sobic004G033200 Sobic009G241900 Sobic009G241900 Sobic003G427200--Sobic009G241900 Sobic010G211200 Sobic010G211200 Sobic003G427200--Sobic010G211200 Sobic001G508200 Sobic001G508200 Sobic003G427200--Sobic001G508200 Sobic003G427200--Sobic007G053100 Sobic003G427200--Sobic004G123200 Sobic008G046000--Sobic008G141900 Sobic005G212201 Sobic005G212201 Sobic008G046000--Sobic005G212201 Sobic002G064800 Sobic002G064800 Sobic008G046000--Sobic002G064800 Sobic008G046000--Sobic004G276000 Sobic008G046000--Sobic001G376501 Sobic008G046000--Sobic010G211200 Sobic008G046000--Sobic003G045450 Sobic008G191700 Sobic008G191700 Sobic008G046000--Sobic008G191700 Sobic008G046000--Sobic009G163400 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic002G383700--Sobic003G275400 Sobic001G499500 Sobic001G499500 Sobic002G383700--Sobic001G499500 Sobic002G383700--Sobic009G163400 Sobic002G383700--Sobic008G141900 Sobic002G383700--Sobic001G376501 Sobic001G485500 Sobic001G485500 Sobic002G383700--Sobic001G485500 Sobic009G168200 Sobic009G168200 Sobic002G383700--Sobic009G168200 Sobic008G121501 Sobic008G121501 Sobic002G383700--Sobic008G121501 Sobic001G053350 Sobic001G053350 Sobic002G383700--Sobic001G053350
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.