Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G098050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W336
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G080600 protein with a conserved N-terminal region, putative, expressed -
2 Sobic.002G305800 expansin precursor, putative, expressed -
3 Sobic.006G251100 powdery mildew resistant protein 5, putative, expressed -
4 Sobic.003G226400 similar to Late embryogenesis-abundant protein Lea14-A-like(PubMedID : 29862293)@late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G078750 - -
6 Sobic.002G236800 - -
7 Sobic.002G100766 - -
8 Sobic.008G080700 CAMK_CAMK_like.46 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
9 Sobic.007G051200 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K00968: choline-phosphate cytidylyltransferase
10 Sobic.001G249100 expressed protein -
11 Sobic.003G379100 expressed protein -
12 Sobic.008G190300 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
13 Sobic.003G166001 - -
14 Sobic.002G122500 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G089800 reticulon domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G165900 csAtPR5, putative, expressed -
17 Sobic.004G163900 SNARE domain containing protein, putative, expressed K18211: synaptosomal-associated protein 25
18 Sobic.002G006700 expressed protein -
19 Sobic.006G037100 expressed protein -
20 Sobic.002G210700 pectinesterase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G098050 Sobic002G098050 Sobic004G080600 Sobic004G080600 Sobic002G098050--Sobic004G080600 Sobic002G305800 Sobic002G305800 Sobic002G098050--Sobic002G305800 Sobic006G251100 Sobic006G251100 Sobic002G098050--Sobic006G251100 Sobic003G226400 Sobic003G226400 Sobic002G098050--Sobic003G226400 Sobic004G078750 Sobic004G078750 Sobic002G098050--Sobic004G078750 Sobic002G236800 Sobic002G236800 Sobic002G098050--Sobic002G236800 Sobic002G100766 Sobic002G100766 Sobic002G098050--Sobic002G100766 Sobic008G080700 Sobic008G080700 Sobic002G098050--Sobic008G080700 Sobic007G051200 Sobic007G051200 Sobic002G098050--Sobic007G051200 Sobic004G080600--Sobic002G305800 Sobic004G080600--Sobic008G080700 Sobic004G080600--Sobic006G251100 Sobic004G080600--Sobic002G236800 Sobic004G080600--Sobic003G226400 Sobic004G080600--Sobic004G078750 Sobic004G080600--Sobic007G051200 Sobic004G080600--Sobic002G100766 Sobic002G122500 Sobic002G122500 Sobic004G080600--Sobic002G122500 Sobic002G305800--Sobic008G080700 Sobic002G305800--Sobic002G122500 Sobic002G305800--Sobic004G080600 Sobic002G305800--Sobic006G251100 Sobic004G163900 Sobic004G163900 Sobic002G305800--Sobic004G163900 Sobic002G305800--Sobic007G051200 Sobic002G305800--Sobic002G236800 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic002G305800--Sobic008G131300 Sobic003G166001 Sobic003G166001 Sobic002G305800--Sobic003G166001 Sobic006G251100--Sobic007G051200 Sobic006G251100--Sobic002G305800 Sobic006G251100--Sobic002G236800 Sobic006G251100--Sobic003G226400 Sobic006G251100--Sobic004G078750 Sobic006G251100--Sobic004G080600 Sobic006G251100--Sobic002G100766 Sobic006G251100--Sobic008G080700 Sobic003G379100 Sobic003G379100 Sobic006G251100--Sobic003G379100 Sobic003G226400--Sobic004G078750 Sobic003G226400--Sobic002G100766 Sobic003G226400--Sobic002G236800 Sobic003G226400--Sobic003G379100 Sobic008G190300 Sobic008G190300 Sobic003G226400--Sobic008G190300 Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic003G226400--Sobic009G089800 Sobic001G249100 Sobic001G249100 Sobic003G226400--Sobic001G249100 Sobic002G165900 Sobic002G165900 Sobic003G226400--Sobic002G165900 Sobic002G006700 Sobic002G006700 Sobic003G226400--Sobic002G006700 Sobic004G078750--Sobic002G100766 Sobic004G078750--Sobic003G226400 Sobic004G078750--Sobic002G236800 Sobic004G078750--Sobic008G190300 Sobic004G078750--Sobic003G379100 Sobic004G078750--Sobic009G089800 Sobic004G078750--Sobic001G249100 Sobic004G078750--Sobic002G165900 Sobic004G078750--Sobic002G006700 Sobic002G236800--Sobic004G078750 Sobic002G236800--Sobic002G100766 Sobic002G236800--Sobic003G226400 Sobic002G236800--Sobic003G379100 Sobic002G236800--Sobic001G249100 Sobic002G236800--Sobic008G190300 Sobic002G236800--Sobic009G089800 Sobic002G236800--Sobic002G006700 Sobic002G236800--Sobic006G251100 Sobic002G100766--Sobic004G078750 Sobic002G100766--Sobic003G226400 Sobic002G100766--Sobic008G190300 Sobic002G100766--Sobic002G236800 Sobic002G100766--Sobic003G379100 Sobic002G100766--Sobic009G089800 Sobic002G100766--Sobic001G249100 Sobic002G100766--Sobic002G165900 Sobic002G100766--Sobic002G006700 Sobic008G080700--Sobic002G305800 Sobic008G080700--Sobic003G166001 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic008G080700--Sobic006G037100 Sobic008G080700--Sobic002G122500 Sobic008G080700--Sobic004G080600 Sobic008G080700--Sobic008G131300 Sobic008G080700--Sobic004G163900 Sobic006G098900 Sobic006G098900 Sobic008G080700--Sobic006G098900 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic008G080700--Sobic003G400700 Sobic007G051200--Sobic006G251100 Sobic007G051200--Sobic002G305800 Sobic007G051200--Sobic008G080700 Sobic007G051200--Sobic002G236800 Sobic007G051200--Sobic004G080600 Sobic007G051200--Sobic003G226400 Sobic007G051200--Sobic004G078750 Sobic007G051200--Sobic002G100766 Sobic007G051200--Sobic002G122500
Octagon: transcription factors


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