Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G148000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QBF9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G319350 - -
2 Sobic.004G122300 - -
3 Sobic.009G067600 - -
4 Sobic.008G003300 - -
5 Sobic.008G089800 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
6 Sobic.003G418733 - -
7 Sobic.001G309800 - -
8 Sobic.002G118101 - -
9 Sobic.001G261750 - -
10 Sobic.001G261750 - -
11 Sobic.001G261750 - -
12 Sobic.001G261750 - -
13 Sobic.001G261750 - -
14 Sobic.002G058200 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed -
15 Sobic.008G028533 - -
16 Sobic.004G188000 histone H3, putative, expressed K11253: histone H3
17 Sobic.001G494600 expressed protein -
18 Sobic.010G078500 - -
19 Sobic.006G004400 Similer to the candidate causal gene ZmCCT for Flowerin time QTL(PubMedID : 19822732)@CCT motif family protein, expressed -
20 Sobic.001G227900 -(PubMedID : 21930910)@-(PubMedID : 24884377)@two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family


Gene co-expression network
sample Sobic002G148000 Sobic002G148000 Sobic001G319350 Sobic001G319350 Sobic002G148000--Sobic001G319350 Sobic004G122300 Sobic004G122300 Sobic002G148000--Sobic004G122300 Sobic009G067600 Sobic009G067600 Sobic002G148000--Sobic009G067600 Sobic008G003300 Sobic008G003300 Sobic002G148000--Sobic008G003300 Sobic008G089800 Sobic008G089800 Sobic002G148000--Sobic008G089800 Sobic003G418733 Sobic003G418733 Sobic002G148000--Sobic003G418733 Sobic001G309800 Sobic001G309800 Sobic002G148000--Sobic001G309800 Sobic002G118101 Sobic002G118101 Sobic002G148000--Sobic002G118101 Sobic001G261750 Sobic001G261750 Sobic002G148000--Sobic001G261750 Sobic001G319350--Sobic001G261750 Sobic002G093600 Sobic002G093600 Sobic001G319350--Sobic002G093600 Sobic001G494600 Sobic001G494600 Sobic001G319350--Sobic001G494600 Sobic008G028533 Sobic008G028533 Sobic001G319350--Sobic008G028533 Sobic002G391700 Sobic002G391700 Sobic001G319350--Sobic002G391700 Sobic003G170400 Sobic003G170400 Sobic004G122300--Sobic003G170400 Sobic004G122300--Sobic002G148000 Sobic003G388500 Sobic003G388500 Sobic004G122300--Sobic003G388500 Sobic004G188000 Sobic004G188000 Sobic004G122300--Sobic004G188000 Sobic004G185400 Sobic004G185400 Sobic004G122300--Sobic004G185400 Sobic003G285300 Sobic003G285300 Sobic004G122300--Sobic003G285300 Sobic006G007800 Sobic006G007800 Sobic004G122300--Sobic006G007800 Sobic004G122100 Sobic004G122100 Sobic004G122300--Sobic004G122100 Sobic009G012900 Sobic009G012900 Sobic004G122300--Sobic009G012900 Sobic006G125400 Sobic006G125400 Sobic009G067600--Sobic006G125400 Sobic009G197700 Sobic009G197700 Sobic009G067600--Sobic009G197700 Sobic006G146100 Sobic006G146100 Sobic009G067600--Sobic006G146100 Sobic007G060000 Sobic007G060000 Sobic009G067600--Sobic007G060000 Sobic001G235500 Sobic001G235500 Sobic009G067600--Sobic001G235500 Sobic002G028800 Sobic002G028800 Sobic009G067600--Sobic002G028800 SobicK008450 SobicK008450 Sobic009G067600--SobicK008450 Sobic009G067600--Sobic002G148000 Sobic007G220000 Sobic007G220000 Sobic009G067600--Sobic007G220000 Sobic008G003300--Sobic008G089800 Sobic008G003300--Sobic003G418733 Sobic006G060601 Sobic006G060601 Sobic008G003300--Sobic006G060601 Sobic008G003300--Sobic002G118101 Sobic001G000300 Sobic001G000300 Sobic008G003300--Sobic001G000300 Sobic003G080800 Sobic003G080800 Sobic008G003300--Sobic003G080800 Sobic003G164950 Sobic003G164950 Sobic008G003300--Sobic003G164950 Sobic001G053200 Sobic001G053200 Sobic008G003300--Sobic001G053200 Sobic003G069875 Sobic003G069875 Sobic008G003300--Sobic003G069875 Sobic008G089800--Sobic003G164950 Sobic002G103100 Sobic002G103100 Sobic008G089800--Sobic002G103100 Sobic008G089800--Sobic002G118101 Sobic008G089800--Sobic001G053200 Sobic001G236700 Sobic001G236700 Sobic008G089800--Sobic001G236700 Sobic007G061100 Sobic007G061100 Sobic008G089800--Sobic007G061100 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic008G089800--Sobic007G090403 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic008G089800--Sobic007G010700 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic008G089800--Sobic005G053200 Sobic003G418733--Sobic002G103100 Sobic003G418733--Sobic008G089800 Sobic003G418733--Sobic003G164950 Sobic001G317300 Sobic001G317300 Sobic003G418733--Sobic001G317300 Sobic003G418733--Sobic008G003300 Sobic002G022100 Sobic002G022100 Sobic003G418733--Sobic002G022100 Sobic003G418733--Sobic006G060601 Sobic010G078500 Sobic010G078500 Sobic003G418733--Sobic010G078500 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic003G418733--Sobic007G202300 Sobic002G398200 Sobic002G398200 Sobic001G309800--Sobic002G398200 Sobic005G159801 Sobic005G159801 Sobic001G309800--Sobic005G159801 Sobic005G163866 Sobic005G163866 Sobic001G309800--Sobic005G163866 Sobic003G439900 Sobic003G439900 Sobic001G309800--Sobic003G439900 Sobic004G096801 Sobic004G096801 Sobic001G309800--Sobic004G096801 Sobic010G004701 Sobic010G004701 Sobic001G309800--Sobic010G004701 Sobic001G309800--Sobic004G122100 Sobic001G262200 Sobic001G262200 Sobic001G309800--Sobic001G262200 Sobic001G309800--Sobic003G418733 Sobic002G118101--Sobic001G053200 Sobic002G321800 Sobic002G321800 Sobic002G118101--Sobic002G321800 Sobic002G118101--Sobic008G089800 Sobic008G027200 Sobic008G027200 Sobic002G118101--Sobic008G027200 Sobic004G044900 Sobic004G044900 Sobic002G118101--Sobic004G044900 Sobic007G084300 Sobic007G084300 Sobic002G118101--Sobic007G084300 Sobic002G118101--Sobic003G080800 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic002G118101--Sobic002G017500 Sobic001G413000 Sobic001G413000 Sobic002G118101--Sobic001G413000 Sobic001G261750--Sobic001G261750 Sobic001G261750--Sobic001G494600 Sobic001G261750--Sobic002G093600 Sobic001G261750--Sobic008G028533 Sobic008G145200 Sobic008G145200 Sobic001G261750--Sobic008G145200 Sobic006G007300 Sobic006G007300 Sobic001G261750--Sobic006G007300
Octagon: transcription factors


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