Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G171001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W4J0
Pfam PF00501
Panther DB PTHR24096 PTHR24096:SF253
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008152; metabolic process GO:0003824catalytic activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G19010 : AMP-dependent synthetase and ligase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g42800.1 : AMP-binding enzyme, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a003561
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G171101 - -
2 Sobic.004G124601 - -
3 Sobic.007G095300 cbbY protein-related, putative, expressed -
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12 Sobic.002G212500 expressed protein -
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14 Sobic.002G117500 sterol 3-beta-glucosyltransferase, putative, expressed K05841: sterol 3beta-glucosyltransferase
15 Sobic.002G124600 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
16 Sobic.002G169400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
17 Sobic.003G180600 - -
18 Sobic.004G239700 - -
19 Sobic.006G234601 - -
20 Sobic.002G137850 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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