Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G234601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RFA0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g01320.1 : chromo domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G111400 - -
2 Sobic.002G124600 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
3 Sobic.003G057233 - -
4 Sobic.002G379750 - -
5 Sobic.006G050700 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
6 Sobic.003G155100 suppressor of Mek, putative, expressed K17491: SMEK, protein phosphatase 4 regulatory subunit 3
7 Sobic.006G133900 NIN, putative, expressed -
8 Sobic.001G534700 plus-3 domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.010G132600 selenoprotein O, putative, expressed -
10 Sobic.010G206900 transcription initiation factor TFIID subunit 1, putative, expressed K03125: transcription initiation factor TFIID subunit 1
11 Sobic.003G029500 zinc finger, C3HC4 type family protein, expressed -
12 Sobic.003G220100 - -
13 Sobic.008G130100 protein kinase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.006G219600 SIT4 phosphatase-associated protein domain containing protein, expressed K15501: PPP6R3, serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3
15 Sobic.004G356700 oligopeptidase, putative, expressed K01414: oligopeptidase A
16 Sobic.001G298900 agenet domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G198200 expressed protein K03128: transcription initiation factor TFIID subunit 2
18 Sobic.009G161550 - -
19 Sobic.001G365900 PWWP domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G388100 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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