Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G174400.2,Sobic.002G174400.1
Synonym Sb02g022300, CB5LP, B5#5, ATCB5LP
Functional annotation cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain containing protein, expressed
UniProt C5XAG1 , A0A1B6QBY5
Pfam PF00173
Panther DB PTHR19359 PTHR19359:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G60660 : cytochrome B5-like protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g16520.1 : cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT64411
Barley HORVU5Hr1G056140.9 , HORVU5Hr1G056140.8 , HORVU5Hr1G056140.2 , HORVU5Hr1G056140.4 , HORVU5Hr1G056140.7
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G518050 - -
2 Sobic.003G055400 expressed protein -
3 Sobic.002G104600 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G332933 - -
5 Sobic.001G411500 expressed protein -
6 Sobic.003G154200 serine carboxypeptidase, putative, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
7 Sobic.005G156450 - -
8 Sobic.002G403700 condensin complex subunit 1, putative, expressed K06677: YCS4, CNAP1, condensin complex subunit 1
9 Sobic.003G249500 expressed protein -
10 Sobic.002G190400 ZOS9-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
11 Sobic.007G107800 expressed protein -
12 Sobic.006G108500 dynein light chain type 1 domain containing protein, expressed -
13 Sobic.003G224900 - -
14 Sobic.008G123000 kinesin-4, putative, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
15 Sobic.001G488300 - -
16 Sobic.009G087480 - -
17 Sobic.004G268600 nodulin, putative, expressed -
18 Sobic.006G231900 SPRY-domain containing protein, putative, expressed K15047: HNRNPUL1, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 1
19 Sobic.008G024900 expressed protein -
20 Sobic.010G267300 thaumatin, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G174400 Sobic002G174400 Sobic001G518050 Sobic001G518050 Sobic002G174400--Sobic001G518050 Sobic003G055400 Sobic003G055400 Sobic002G174400--Sobic003G055400 Sobic002G104600 Sobic002G104600 Sobic002G174400--Sobic002G104600 Sobic001G332933 Sobic001G332933 Sobic002G174400--Sobic001G332933 Sobic001G411500 Sobic001G411500 Sobic002G174400--Sobic001G411500 Sobic003G154200 Sobic003G154200 Sobic002G174400--Sobic003G154200 Sobic005G156450 Sobic005G156450 Sobic002G174400--Sobic005G156450 Sobic002G403700 Sobic002G403700 Sobic002G174400--Sobic002G403700 Sobic003G249500 Sobic003G249500 Sobic002G174400--Sobic003G249500 Sobic010G267300 Sobic010G267300 Sobic001G518050--Sobic010G267300 Sobic004G268600 Sobic004G268600 Sobic001G518050--Sobic004G268600 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic001G518050--Sobic001G128000 Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic001G518050--Sobic002G180732 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic001G518050--Sobic003G160433 Sobic003G337200 Sobic003G337200 Sobic001G518050--Sobic003G337200 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic001G518050--Sobic002G390200 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic001G518050--Sobic003G160300 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic001G518050--Sobic007G085900 Sobic006G108500 Sobic006G108500 Sobic003G055400--Sobic006G108500 Sobic003G055400--Sobic003G249500 Sobic003G055400--Sobic002G104600 Sobic003G055400--Sobic002G403700 Sobic008G033800 Sobic008G033800 Sobic003G055400--Sobic008G033800 Sobic001G293900 Sobic001G293900 Sobic003G055400--Sobic001G293900 Sobic003G119750 Sobic003G119750 Sobic003G055400--Sobic003G119750 Sobic001G454700 Sobic001G454700 Sobic003G055400--Sobic001G454700 Sobic004G104200 Sobic004G104200 Sobic003G055400--Sobic004G104200 Sobic007G164101 Sobic007G164101 Sobic002G104600--Sobic007G164101 Sobic008G035633 Sobic008G035633 Sobic002G104600--Sobic008G035633 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic002G104600--Sobic006G017266 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic002G104600--Sobic005G093600 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic002G104600--Sobic006G147350 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic002G104600--Sobic003G128575 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic002G104600--Sobic006G020350 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic002G104600--Sobic010G173600 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic002G104600--Sobic003G255850 Sobic001G332933--Sobic005G156450 Sobic007G107800 Sobic007G107800 Sobic001G332933--Sobic007G107800 Sobic003G047400 Sobic003G047400 Sobic001G332933--Sobic003G047400 Sobic002G276500 Sobic002G276500 Sobic001G332933--Sobic002G276500 Sobic003G204750 Sobic003G204750 Sobic001G332933--Sobic003G204750 Sobic009G087480 Sobic009G087480 Sobic001G332933--Sobic009G087480 Sobic003G290200 Sobic003G290200 Sobic001G332933--Sobic003G290200 Sobic007G070100 Sobic007G070100 Sobic001G332933--Sobic007G070100 Sobic006G183500 Sobic006G183500 Sobic001G332933--Sobic006G183500 Sobic001G411500--Sobic007G107800 Sobic001G411500--Sobic004G268600 Sobic001G411500--Sobic004G104200 Sobic004G208301 Sobic004G208301 Sobic001G411500--Sobic004G208301 Sobic001G411500--Sobic003G119750 Sobic001G411500--Sobic001G128000 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic001G411500--Sobic009G192200 Sobic001G411500--Sobic007G085900 Sobic001G411500--Sobic003G337200 Sobic003G154200--Sobic010G173600 Sobic003G154200--Sobic006G147350 Sobic003G154200--Sobic005G093600 Sobic003G154200--Sobic003G128575 Sobic003G154200--Sobic006G017266 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic003G154200--Sobic001G249900 Sobic003G154200--Sobic006G020350 Sobic003G154200--Sobic002G104600 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic003G154200--Sobic009G069450 Sobic005G156450--Sobic001G332933 Sobic005G156450--Sobic003G204750 Sobic005G156450--Sobic009G087480 Sobic005G156450--Sobic002G276500 Sobic001G488300 Sobic001G488300 Sobic005G156450--Sobic001G488300 Sobic001G027900 Sobic001G027900 Sobic005G156450--Sobic001G027900 Sobic008G024900 Sobic008G024900 Sobic005G156450--Sobic008G024900 Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic005G156450--Sobic010G103400 Sobic006G027200 Sobic006G027200 Sobic005G156450--Sobic006G027200 Sobic002G403700--Sobic003G055400 Sobic002G403700--Sobic002G104600 Sobic006G063800 Sobic006G063800 Sobic002G403700--Sobic006G063800 Sobic003G409500 Sobic003G409500 Sobic002G403700--Sobic003G409500 Sobic002G403700--Sobic006G108500 Sobic005G100500 Sobic005G100500 Sobic002G403700--Sobic005G100500 Sobic002G403700--Sobic001G454700 Sobic001G105000 Sobic001G105000 Sobic002G403700--Sobic001G105000 Sobic002G403700--Sobic001G518050 Sobic002G373900 Sobic002G373900 Sobic003G249500--Sobic002G373900 Sobic001G029500 Sobic001G029500 Sobic003G249500--Sobic001G029500 Sobic004G191901 Sobic004G191901 Sobic003G249500--Sobic004G191901 Sobic003G249500--Sobic001G128000 Sobic006G233800 Sobic006G233800 Sobic003G249500--Sobic006G233800 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic003G249500--Sobic003G160400 Sobic003G249500--Sobic010G267300 Sobic003G249500--Sobic008G033800 Sobic003G249500--Sobic003G119750
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.