Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G055400.2
Synonym Sb03g004740
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XNI5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g07320.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023310 , Zm00025a035696
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G108500 dynein light chain type 1 domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G249500 expressed protein -
3 Sobic.002G104600 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
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5 Sobic.008G033800 ABCG protein(PubMedID : 21265893)@pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
6 Sobic.001G293900 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
7 Sobic.003G119750 - -
8 Sobic.001G454700 expressed protein -
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10 Sobic.001G138100 - -
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12 Sobic.006G192600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat protein PPR868-14, putative, expressed -
13 Sobic.001G450900 UNE2, putative, expressed -
14 Sobic.008G157700 BURP domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G169400 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03046: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
16 Sobic.005G167100 - -
17 Sobic.006G005550 - -
18 Sobic.003G337200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat-containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G128000 expressed protein -
20 Sobic.003G172400 conserved hypothetical protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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