Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G403700.1,Sobic.002G403700.2
Synonym
Functional annotation condensin complex subunit 1, putative, expressed
UniProt A0A1W0W7V5 , A0A1W0W7R6
Pfam PF12765 PF12922 PF12717
Panther DB PTHR14222 PTHR14222:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology K06677; YCS4, CNAP1, condensin complex subunit 1
Gene Ontology GO:0007076; mitotic chromosome condensation


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G57060 : binding
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g46540.1 : condensin complex subunit 1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049035
Brachypodium KQK14850 , KQK14849
Barley HORVU2Hr1G022720.4 , HORVU2Hr1G022720.7 , HORVU2Hr1G022720.6 , HORVU2Hr1G022720.1 , HORVU2Hr1G022720.3 , HORVU2Hr1G022720.2 , HORVU2Hr1G022720.8
Wheat TraesCS2D02G132100 , TraesCS2A02G129900 , TraesCS2B02G152100
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Gene co-expression network
sample Sobic002G403700 Sobic002G403700 Sobic003G055400 Sobic003G055400 Sobic002G403700--Sobic003G055400 Sobic002G104600 Sobic002G104600 Sobic002G403700--Sobic002G104600 Sobic006G063800 Sobic006G063800 Sobic002G403700--Sobic006G063800 Sobic003G409500 Sobic003G409500 Sobic002G403700--Sobic003G409500 Sobic006G108500 Sobic006G108500 Sobic002G403700--Sobic006G108500 Sobic005G100500 Sobic005G100500 Sobic002G403700--Sobic005G100500 Sobic001G454700 Sobic001G454700 Sobic002G403700--Sobic001G454700 Sobic001G105000 Sobic001G105000 Sobic002G403700--Sobic001G105000 Sobic001G518050 Sobic001G518050 Sobic002G403700--Sobic001G518050 Sobic003G055400--Sobic006G108500 Sobic003G249500 Sobic003G249500 Sobic003G055400--Sobic003G249500 Sobic003G055400--Sobic002G104600 Sobic003G055400--Sobic002G403700 Sobic008G033800 Sobic008G033800 Sobic003G055400--Sobic008G033800 Sobic001G293900 Sobic001G293900 Sobic003G055400--Sobic001G293900 Sobic003G119750 Sobic003G119750 Sobic003G055400--Sobic003G119750 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Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic001G518050--Sobic007G085900
Octagon: transcription factors


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