Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G176300.3,Sobic.002G176300.4,Sobic.002G176300.2
Synonym Sb02g022520
Functional annotation RING finger protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0W4S7 , A0A1W0W4M7 , A0A1W0W4U2
Pfam PF13639
Panther DB PTHR22763
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding GO:0008270zinc ion binding GO:0008270zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G58720 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g17610.1 : RING finger protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013788
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G176300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.002G256250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G176300 Sobic002G176300 Sobic007G085400 Sobic007G085400 Sobic002G176300--Sobic007G085400 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic002G176300--Sobic001G420150 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic002G176300--Sobic001G093400 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic002G176300--Sobic007G116300 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic002G176300--Sobic004G276600 Sobic008G086700 Sobic008G086700 Sobic002G176300--Sobic008G086700 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic002G176300--Sobic004G134400 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic002G176300--Sobic004G274300 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic002G176300--Sobic001G255866 Sobic007G085400--Sobic001G093400 Sobic007G085400--Sobic001G420150 Sobic007G085400--Sobic004G134400 Sobic007G085400--Sobic004G276600 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic007G085400--Sobic008G093300 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic007G085400--Sobic003G169700 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic007G085400--Sobic004G133201 Sobic007G085400--Sobic004G274300 Sobic002G337400 Sobic002G337400 Sobic007G085400--Sobic002G337400 Sobic001G420150--Sobic007G116300 Sobic001G420150--Sobic001G093400 Sobic001G420150--Sobic004G276600 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic001G420150--Sobic001G423200 Sobic001G420150--Sobic001G255866 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic001G420150--Sobic007G090433 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic001G420150--Sobic004G129400 Sobic001G420150--Sobic004G133201 Sobic001G420150--Sobic003G169700 Sobic001G093400--Sobic007G116300 Sobic001G093400--Sobic001G420150 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic001G093400--Sobic009G260550 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic001G093400--Sobic009G257000 Sobic001G093400--Sobic001G255866 Sobic001G093400--Sobic003G169700 Sobic001G093400--Sobic007G090433 Sobic001G093400--Sobic004G276600 Sobic001G093400--Sobic001G423200 Sobic007G116300--Sobic001G420150 Sobic007G116300--Sobic001G093400 Sobic007G116300--Sobic001G255866 Sobic007G116300--Sobic007G090433 Sobic007G116300--Sobic001G423200 Sobic007G116300--Sobic004G276600 Sobic007G116300--Sobic009G260550 Sobic007G116300--Sobic004G129400 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic007G116300--Sobic006G059150 Sobic004G276600--Sobic001G420150 Sobic004G276600--Sobic007G090433 Sobic004G276600--Sobic007G116300 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic004G276600--Sobic005G154600 Sobic004G276600--Sobic001G093400 Sobic004G276600--Sobic001G255866 Sobic004G276600--Sobic004G133201 Sobic004G276600--Sobic001G423200 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic004G276600--Sobic006G261650 Sobic006G048400 Sobic006G048400 Sobic008G086700--Sobic006G048400 Sobic003G139700 Sobic003G139700 Sobic008G086700--Sobic003G139700 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic008G086700--Sobic009G210250 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic008G086700--Sobic002G009000 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic008G086700--Sobic008G132500 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic008G086700--Sobic001G250750 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic008G086700--Sobic006G072701 Sobic008G086700--Sobic002G176300 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic008G086700--Sobic010G136700 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic004G134400--Sobic009G079600 Sobic004G134400--Sobic004G274300 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic004G134400--Sobic007G127200 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic004G134400--Sobic003G187600 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic004G134400--Sobic010G247750 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic004G134400--Sobic003G260500 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic004G134400--Sobic001G323101 Sobic004G134400--Sobic004G133201 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic004G134400--Sobic007G132650 Sobic004G274300--Sobic004G134400 Sobic004G274300--Sobic009G079600 Sobic004G274300--Sobic003G187600 Sobic004G274300--Sobic003G260500 Sobic004G274300--Sobic004G133201 Sobic004G274300--Sobic007G132650 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic004G274300--Sobic006G107766 Sobic004G274300--Sobic007G127200 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic004G274300--Sobic003G394701 Sobic001G255866--Sobic007G090433 Sobic001G255866--Sobic009G257000 Sobic001G255866--Sobic001G420150 Sobic001G255866--Sobic003G394701 Sobic001G255866--Sobic001G423200 Sobic001G255866--Sobic007G116300 Sobic001G255866--Sobic001G093400 Sobic001G255866--Sobic006G107766 Sobic001G255866--Sobic004G133201
Octagon: transcription factors


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