Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G230000.1
Synonym Sb02g026920
Functional annotation basic helix-loop-helix, putative, expressed
UniProt C5X2Y6
Pfam PF00010
Panther DB PTHR12565 PTHR12565:SF176
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G56770 : basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g28900.1 : basic helix-loop-helix, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014096 , Zm00025a047308
Brachypodium PNT64740 , KQJ98671
Barley HORVU5Hr1G069580.4 , HORVU5Hr1G069580.3 , HORVU5Hr1G069580.2 , HORVU5Hr1G069580.1
Wheat TraesCS2A02G472300 , TraesCS5A02G245600 , TraesCS5B02G243000 , TraesCS2B02G494900 , TraesCS5D02G252300
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic002G230000 Sobic002G230000 Sobic008G159601 Sobic008G159601 Sobic002G230000--Sobic008G159601 Sobic008G013500 Sobic008G013500 Sobic002G230000--Sobic008G013500 Sobic001G472301 Sobic001G472301 Sobic002G230000--Sobic001G472301 Sobic003G120600 Sobic003G120600 Sobic002G230000--Sobic003G120600 Sobic007G153100 Sobic007G153100 Sobic002G230000--Sobic007G153100 Sobic001G320300 Sobic001G320300 Sobic002G230000--Sobic001G320300 Sobic001G511600 Sobic001G511600 Sobic002G230000--Sobic001G511600 Sobic004G234400 Sobic004G234400 Sobic002G230000--Sobic004G234400 Sobic003G004900 Sobic003G004900 Sobic002G230000--Sobic003G004900 Sobic008G159601--Sobic008G013500 Sobic008G159601--Sobic001G472301 Sobic008G159601--Sobic007G153100 Sobic008G159601--Sobic001G511600 Sobic002G179200 Sobic002G179200 Sobic008G159601--Sobic002G179200 Sobic006G092300 Sobic006G092300 Sobic008G159601--Sobic006G092300 Sobic008G159601--Sobic004G234400 Sobic008G159601--Sobic003G004900 Sobic008G159601--Sobic003G120600 Sobic008G013500--Sobic001G472301 Sobic008G013500--Sobic007G153100 Sobic008G013500--Sobic001G511600 Sobic008G013500--Sobic004G234400 Sobic008G013500--Sobic008G159601 Sobic008G013500--Sobic002G179200 Sobic005G090000 Sobic005G090000 Sobic008G013500--Sobic005G090000 Sobic003G011700 Sobic003G011700 Sobic008G013500--Sobic003G011700 Sobic001G102600 Sobic001G102600 Sobic008G013500--Sobic001G102600 Sobic001G472301--Sobic001G511600 Sobic001G472301--Sobic008G013500 Sobic001G472301--Sobic007G153100 Sobic001G472301--Sobic005G090000 Sobic001G472301--Sobic001G102600 Sobic001G472301--Sobic003G011700 Sobic001G472400 Sobic001G472400 Sobic001G472301--Sobic001G472400 Sobic001G472301--Sobic002G179200 Sobic010G189366 Sobic010G189366 Sobic001G472301--Sobic010G189366 Sobic007G125400 Sobic007G125400 Sobic003G120600--Sobic007G125400 Sobic003G120600--Sobic003G004900 Sobic008G004200 Sobic008G004200 Sobic003G120600--Sobic008G004200 Sobic003G120600--Sobic002G179200 Sobic001G438500 Sobic001G438500 Sobic003G120600--Sobic001G438500 Sobic001G179400 Sobic001G179400 Sobic003G120600--Sobic001G179400 Sobic003G120600--Sobic006G092300 Sobic010G065700 Sobic010G065700 Sobic003G120600--Sobic010G065700 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic003G120600--Sobic008G012600 Sobic007G153100--Sobic001G511600 Sobic007G153100--Sobic001G472301 Sobic006G137000 Sobic006G137000 Sobic007G153100--Sobic006G137000 Sobic007G153100--Sobic001G102600 Sobic007G153100--Sobic008G013500 Sobic007G153100--Sobic003G004900 Sobic007G153100--Sobic002G179200 Sobic007G153100--Sobic003G011700 Sobic007G153100--Sobic010G189366 Sobic006G097100 Sobic006G097100 Sobic001G320300--Sobic006G097100 Sobic006G187300 Sobic006G187300 Sobic001G320300--Sobic006G187300 Sobic001G320300--Sobic006G137000 Sobic001G320300--Sobic003G004900 Sobic001G215000 Sobic001G215000 Sobic001G320300--Sobic001G215000 Sobic005G010600 Sobic005G010600 Sobic001G320300--Sobic005G010600 Sobic005G054800 Sobic005G054800 Sobic001G320300--Sobic005G054800 Sobic001G320300--Sobic007G153100 Sobic004G041700 Sobic004G041700 Sobic001G320300--Sobic004G041700 Sobic001G511600--Sobic001G102600 Sobic001G511600--Sobic001G472301 Sobic001G511600--Sobic003G011700 Sobic001G511600--Sobic001G472400 Sobic001G511600--Sobic010G189366 Sobic001G511600--Sobic005G090000 Sobic004G349150 Sobic004G349150 Sobic001G511600--Sobic004G349150 Sobic004G202800 Sobic004G202800 Sobic001G511600--Sobic004G202800 Sobic001G511600--Sobic003G004900 Sobic004G234400--Sobic008G013500 Sobic004G234400--Sobic001G472301 Sobic004G234400--Sobic007G153100 Sobic004G234400--Sobic008G159601 Sobic004G234400--Sobic001G511600 Sobic003G090700 Sobic003G090700 Sobic004G234400--Sobic003G090700 Sobic008G154900 Sobic008G154900 Sobic004G234400--Sobic008G154900 Sobic004G234400--Sobic002G179200 Sobic007G049500 Sobic007G049500 Sobic004G234400--Sobic007G049500 Sobic007G180700 Sobic007G180700 Sobic003G004900--Sobic007G180700 Sobic006G267400 Sobic006G267400 Sobic003G004900--Sobic006G267400 Sobic003G004900--Sobic001G102600 Sobic003G004900--Sobic010G189366 Sobic002G173300 Sobic002G173300 Sobic003G004900--Sobic002G173300 Sobic003G004900--Sobic004G349150 Sobic004G001700 Sobic004G001700 Sobic003G004900--Sobic004G001700 Sobic006G098300 Sobic006G098300 Sobic003G004900--Sobic006G098300 Sobic003G004900--Sobic006G137000
Octagon: transcription factors


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