Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G284500.1
Synonym CHX2, Sb02g031690, ATCHX2
Functional annotation transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed
UniProt A0A1W0W681
Pfam PF00999
Panther DB PTHR32468 PTHR32468:SF19
NCBI CDD KOG1650; Predicted K+/H+-antiporter
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane GO:0015299solute:proton antiporter activity GO:0006812cation transport


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G79400 : cation/H+ exchanger 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g37300.1 : transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047992
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G085610.1 , HORVU5Hr1G085610.2
Wheat TraesCSU02G072200 , TraesCS5B02G339000 , TraesCS5D02G346300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G160900 signal recognition particle 54 kDa protein, putative, expressed K03106: SRP54, signal recognition particle subunit SRP54
2 Sobic.005G098100 - -
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19 Sobic.001G120800 - -
20 Sobic.003G131900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G284500 Sobic002G284500 Sobic001G160900 Sobic001G160900 Sobic002G284500--Sobic001G160900 Sobic005G098100 Sobic005G098100 Sobic002G284500--Sobic005G098100 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic002G284500--Sobic008G131300 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic002G284500--Sobic002G102600 Sobic002G160200 Sobic002G160200 Sobic002G284500--Sobic002G160200 Sobic002G083100 Sobic002G083100 Sobic002G284500--Sobic002G083100 Sobic007G204800 Sobic007G204800 Sobic002G284500--Sobic007G204800 Sobic005G001200 Sobic005G001200 Sobic002G284500--Sobic005G001200 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic002G284500--Sobic003G400700 Sobic001G160900--Sobic007G204800 Sobic001G160900--Sobic002G160200 Sobic004G338900 Sobic004G338900 Sobic001G160900--Sobic004G338900 Sobic001G160900--Sobic002G102600 Sobic005G125200 Sobic005G125200 Sobic001G160900--Sobic005G125200 Sobic006G099200 Sobic006G099200 Sobic001G160900--Sobic006G099200 Sobic003G192200 Sobic003G192200 Sobic001G160900--Sobic003G192200 Sobic001G120800 Sobic001G120800 Sobic001G160900--Sobic001G120800 Sobic010G257900 Sobic010G257900 Sobic001G160900--Sobic010G257900 Sobic005G098100--Sobic003G400700 Sobic001G433500 Sobic001G433500 Sobic005G098100--Sobic001G433500 Sobic005G098100--Sobic002G102600 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic005G098100--Sobic006G037100 Sobic003G166001 Sobic003G166001 Sobic005G098100--Sobic003G166001 Sobic006G098900 Sobic006G098900 Sobic005G098100--Sobic006G098900 Sobic003G287800 Sobic003G287800 Sobic005G098100--Sobic003G287800 Sobic008G080700 Sobic008G080700 Sobic005G098100--Sobic008G080700 Sobic005G098100--Sobic008G131300 Sobic002G122500 Sobic002G122500 Sobic008G131300--Sobic002G122500 Sobic008G131300--Sobic008G080700 Sobic008G131300--Sobic006G037100 Sobic008G129800 Sobic008G129800 Sobic008G131300--Sobic008G129800 Sobic002G305800 Sobic002G305800 Sobic008G131300--Sobic002G305800 Sobic004G163900 Sobic004G163900 Sobic008G131300--Sobic004G163900 Sobic008G131300--Sobic003G166001 Sobic008G131300--Sobic003G400700 Sobic003G322000 Sobic003G322000 Sobic008G131300--Sobic003G322000 Sobic002G102600--Sobic005G098100 Sobic002G102600--Sobic002G160200 Sobic002G102600--Sobic003G400700 Sobic002G102600--Sobic001G433500 Sobic002G102600--Sobic006G037100 Sobic002G102600--Sobic005G001200 Sobic002G102600--Sobic003G287800 Sobic003G131900 Sobic003G131900 Sobic002G102600--Sobic003G131900 Sobic002G102600--Sobic007G204800 Sobic002G160200--Sobic002G102600 Sobic002G160200--Sobic007G204800 Sobic002G160200--Sobic004G338900 Sobic002G160200--Sobic005G098100 Sobic002G160200--Sobic003G400700 Sobic002G160200--Sobic001G160900 Sobic002G160200--Sobic005G001200 Sobic002G160200--Sobic006G037100 Sobic002G160200--Sobic008G129800 Sobic002G083100--Sobic004G338900 Sobic002G083100--Sobic002G160200 Sobic002G083100--Sobic007G204800 Sobic002G083100--Sobic002G102600 Sobic002G083100--Sobic005G001200 Sobic002G083100--Sobic006G099200 Sobic002G083100--Sobic001G160900 Sobic005G027250 Sobic005G027250 Sobic002G083100--Sobic005G027250 Sobic002G083100--Sobic003G287800 Sobic007G204800--Sobic002G160200 Sobic007G204800--Sobic004G338900 Sobic007G204800--Sobic006G099200 Sobic007G204800--Sobic001G160900 Sobic007G204800--Sobic001G120800 Sobic007G204800--Sobic002G102600 Sobic007G204800--Sobic010G257900 Sobic007G204800--Sobic005G027250 Sobic007G204800--Sobic002G083100 Sobic010G126300 Sobic010G126300 Sobic005G001200--Sobic010G126300 Sobic005G001200--Sobic003G287800 Sobic005G001200--Sobic002G102600 Sobic005G001200--Sobic005G098100 Sobic005G001200--Sobic003G400700 Sobic002G322500 Sobic002G322500 Sobic005G001200--Sobic002G322500 Sobic005G001200--Sobic001G433500 Sobic005G001200--Sobic006G037100 Sobic005G001200--Sobic002G160200 Sobic003G400700--Sobic001G433500 Sobic003G400700--Sobic006G037100 Sobic003G400700--Sobic005G098100 Sobic003G400700--Sobic003G166001 Sobic003G400700--Sobic008G080700 Sobic003G400700--Sobic006G098900 Sobic003G400700--Sobic002G102600 Sobic003G400700--Sobic008G131300 Sobic003G400700--Sobic002G122500
Octagon: transcription factors


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