Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G295600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QE49
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047890
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G213100 zinc finger, C3HC4 type family protein, expressed -
2 Sobic.009G095640 - -
3 Sobic.005G054501 - -
4 Sobic.003G193600 expressed protein -
5 Sobic.004G079600 - -
6 Sobic.001G135900 transferase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.007G051200 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K00968: choline-phosphate cytidylyltransferase
8 Sobic.002G165900 csAtPR5, putative, expressed -
9 Sobic.006G251100 powdery mildew resistant protein 5, putative, expressed -
10 Sobic.010G257700 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
11 Sobic.003G379100 expressed protein -
12 Sobic.004G080600 protein with a conserved N-terminal region, putative, expressed -
13 Sobic.007G133100 - -
14 Sobic.009G089800 reticulon domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.003G226400 similar to Late embryogenesis-abundant protein Lea14-A-like(PubMedID : 29862293)@late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G236800 - -
17 Sobic.004G078750 - -
18 Sobic.002G100766 - -
19 Sobic.001G249100 expressed protein -
20 Sobic.002G305800 expansin precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G295600 Sobic002G295600 Sobic002G213100 Sobic002G213100 Sobic002G295600--Sobic002G213100 Sobic009G095640 Sobic009G095640 Sobic002G295600--Sobic009G095640 Sobic005G054501 Sobic005G054501 Sobic002G295600--Sobic005G054501 Sobic003G193600 Sobic003G193600 Sobic002G295600--Sobic003G193600 Sobic004G079600 Sobic004G079600 Sobic002G295600--Sobic004G079600 Sobic001G135900 Sobic001G135900 Sobic002G295600--Sobic001G135900 Sobic007G051200 Sobic007G051200 Sobic002G295600--Sobic007G051200 Sobic002G165900 Sobic002G165900 Sobic002G295600--Sobic002G165900 Sobic006G251100 Sobic006G251100 Sobic002G295600--Sobic006G251100 Sobic002G213100--Sobic001G135900 Sobic002G213100--Sobic003G193600 Sobic002G213100--Sobic009G095640 Sobic002G213100--Sobic004G079600 Sobic002G213100--Sobic005G054501 Sobic002G213100--Sobic002G295600 Sobic002G213100--Sobic007G051200 Sobic005G125200 Sobic005G125200 Sobic002G213100--Sobic005G125200 Sobic002G213100--Sobic006G251100 Sobic009G095640--Sobic005G054501 Sobic010G257700 Sobic010G257700 Sobic009G095640--Sobic010G257700 Sobic009G095640--Sobic002G165900 Sobic007G133100 Sobic007G133100 Sobic009G095640--Sobic007G133100 Sobic010G246132 Sobic010G246132 Sobic009G095640--Sobic010G246132 Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic009G095640--Sobic009G089800 Sobic006G244100 Sobic006G244100 Sobic009G095640--Sobic006G244100 Sobic003G379100 Sobic003G379100 Sobic009G095640--Sobic003G379100 Sobic009G095640--Sobic003G193600 Sobic005G054501--Sobic002G165900 Sobic005G054501--Sobic010G257700 Sobic005G054501--Sobic009G089800 Sobic005G054501--Sobic009G095640 Sobic005G054501--Sobic003G379100 Sobic008G190300 Sobic008G190300 Sobic005G054501--Sobic008G190300 Sobic002G100766 Sobic002G100766 Sobic005G054501--Sobic002G100766 Sobic004G078750 Sobic004G078750 Sobic005G054501--Sobic004G078750 Sobic003G226400 Sobic003G226400 Sobic005G054501--Sobic003G226400 Sobic003G193600--Sobic007G051200 Sobic008G129800 Sobic008G129800 Sobic003G193600--Sobic008G129800 Sobic003G193600--Sobic004G079600 Sobic002G122500 Sobic002G122500 Sobic003G193600--Sobic002G122500 Sobic003G193600--Sobic006G251100 Sobic002G305800 Sobic002G305800 Sobic003G193600--Sobic002G305800 Sobic004G163900 Sobic004G163900 Sobic003G193600--Sobic004G163900 Sobic008G080700 Sobic008G080700 Sobic003G193600--Sobic008G080700 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic003G193600--Sobic008G131300 Sobic003G166001 Sobic003G166001 Sobic004G079600--Sobic003G166001 Sobic004G079600--Sobic007G051200 Sobic004G079600--Sobic003G193600 Sobic004G079600--Sobic008G080700 Sobic006G098900 Sobic006G098900 Sobic004G079600--Sobic006G098900 Sobic004G079600--Sobic006G251100 Sobic004G079600--Sobic002G305800 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic004G079600--Sobic006G037100 Sobic004G080600 Sobic004G080600 Sobic004G079600--Sobic004G080600 Sobic001G135900--Sobic002G213100 Sobic001G135900--Sobic003G193600 Sobic001G135900--Sobic004G079600 Sobic001G135900--Sobic009G095640 Sobic001G135900--Sobic005G125200 Sobic003G192200 Sobic003G192200 Sobic001G135900--Sobic003G192200 Sobic001G135900--Sobic002G295600 Sobic001G135900--Sobic005G054501 Sobic001G135900--Sobic007G051200 Sobic007G051200--Sobic006G251100 Sobic007G051200--Sobic002G305800 Sobic007G051200--Sobic008G080700 Sobic002G236800 Sobic002G236800 Sobic007G051200--Sobic002G236800 Sobic007G051200--Sobic004G080600 Sobic007G051200--Sobic003G226400 Sobic007G051200--Sobic004G078750 Sobic007G051200--Sobic002G100766 Sobic007G051200--Sobic002G122500 Sobic002G165900--Sobic009G089800 Sobic002G165900--Sobic003G379100 Sobic002G165900--Sobic008G190300 Sobic002G165900--Sobic003G226400 Sobic002G165900--Sobic002G100766 Sobic002G165900--Sobic004G078750 Sobic002G210700 Sobic002G210700 Sobic002G165900--Sobic002G210700 Sobic002G006700 Sobic002G006700 Sobic002G165900--Sobic002G006700 Sobic001G249100 Sobic001G249100 Sobic002G165900--Sobic001G249100 Sobic006G251100--Sobic007G051200 Sobic006G251100--Sobic002G305800 Sobic006G251100--Sobic002G236800 Sobic006G251100--Sobic003G226400 Sobic006G251100--Sobic004G078750 Sobic006G251100--Sobic004G080600 Sobic006G251100--Sobic002G100766 Sobic006G251100--Sobic008G080700 Sobic006G251100--Sobic003G379100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.