Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G308800.2,Sobic.002G308800.5,Sobic.002G308800.1,Sobic.002G308800.3,Sobic.002G308800.4
Synonym Sb02g033870
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W6K2 , A0A1W0W6F4 , A0A1W0W6E2 , C5X991 , A0A1B6QED1
Pfam -
Panther DB PTHR33644 PTHR33644:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G12940 : 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g31440.3,LOC_Os07g31440.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014718
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2B02G252300 , TraesCS2D02G235000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G079000 - -
2 Sobic.008G001500 signal recognition particle receptor subunit beta, putative, expressed K12272: SRPRB, signal recognition particle receptor subunit beta
3 Sobic.006G148600 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR18 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
4 Sobic.003G406120 - -
5 Sobic.003G124400 - -
6 Sobic.006G108766 - -
7 Sobic.004G207350 - -
8 Sobic.003G375500 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G001600 - -
10 Sobic.009G223100 IPP transferase, putative, expressed K10760: adenylate dimethylallyltransferase (cytokinin synthase)
11 Sobic.001G072400 - -
12 Sobic.003G016950 - -
13 Sobic.003G401700 - -
14 Sobic.005G137500 - -
15 Sobic.004G193350 - -
16 Sobic.001G239000 expressed protein -
17 Sobic.005G150501 - -
18 Sobic.007G208700 OsWAK90 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
19 Sobic.010G187950 - -
20 Sobic.010G183350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G308800 Sobic002G308800 Sobic001G079000 Sobic001G079000 Sobic002G308800--Sobic001G079000 Sobic008G001500 Sobic008G001500 Sobic002G308800--Sobic008G001500 Sobic006G148600 Sobic006G148600 Sobic002G308800--Sobic006G148600 Sobic003G406120 Sobic003G406120 Sobic002G308800--Sobic003G406120 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic002G308800--Sobic003G124400 Sobic006G108766 Sobic006G108766 Sobic002G308800--Sobic006G108766 Sobic004G207350 Sobic004G207350 Sobic002G308800--Sobic004G207350 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic002G308800--Sobic003G375500 Sobic008G001600 Sobic008G001600 Sobic002G308800--Sobic008G001600 Sobic001G079000--Sobic003G124400 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic001G079000--Sobic001G239000 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic001G079000--Sobic009G026600 Sobic005G150501 Sobic005G150501 Sobic001G079000--Sobic005G150501 Sobic001G079000--Sobic003G375500 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic001G079000--Sobic005G027350 Sobic008G037300 Sobic008G037300 Sobic001G079000--Sobic008G037300 Sobic003G401700 Sobic003G401700 Sobic001G079000--Sobic003G401700 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic001G079000--Sobic005G068000 Sobic008G001500--Sobic008G001600 Sobic008G001500--Sobic006G108766 Sobic001G198300 Sobic001G198300 Sobic008G001500--Sobic001G198300 Sobic008G001500--Sobic003G406120 Sobic006G257550 Sobic006G257550 Sobic008G001500--Sobic006G257550 Sobic006G238900 Sobic006G238900 Sobic008G001500--Sobic006G238900 Sobic008G001500--Sobic001G079000 Sobic004G037401 Sobic004G037401 Sobic008G001500--Sobic004G037401 Sobic008G001500--Sobic002G308800 Sobic003G016950 Sobic003G016950 Sobic006G148600--Sobic003G016950 Sobic006G148600--Sobic003G401700 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic006G148600--Sobic004G193350 Sobic001G422432 Sobic001G422432 Sobic006G148600--Sobic001G422432 Sobic002G157050 Sobic002G157050 Sobic006G148600--Sobic002G157050 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic006G148600--Sobic001G016050 Sobic006G177500 Sobic006G177500 Sobic006G148600--Sobic006G177500 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic006G148600--Sobic001G400601 Sobic002G297100 Sobic002G297100 Sobic006G148600--Sobic002G297100 Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic003G406120--Sobic005G230900 Sobic003G406120--Sobic006G108766 Sobic003G406120--Sobic008G001600 Sobic003G406120--Sobic004G207350 Sobic003G406120--Sobic006G238900 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic003G406120--Sobic001G084133 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic003G406120--Sobic002G365300 Sobic003G406120--Sobic004G037401 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic003G406120--Sobic004G089801 Sobic003G124400--Sobic005G068000 Sobic003G124400--Sobic001G079000 Sobic003G124400--Sobic001G239000 Sobic003G124400--Sobic003G375500 Sobic003G124400--Sobic008G037300 Sobic003G124400--Sobic005G027350 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic003G124400--Sobic010G183350 Sobic003G124400--Sobic009G026600 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic003G124400--Sobic003G312800 Sobic006G108766--Sobic006G238900 Sobic006G108766--Sobic003G406120 Sobic006G108766--Sobic008G001600 Sobic006G108766--Sobic008G001500 Sobic007G155950 Sobic007G155950 Sobic006G108766--Sobic007G155950 Sobic006G108766--Sobic005G230900 Sobic006G108766--Sobic004G037401 Sobic003G040300 Sobic003G040300 Sobic006G108766--Sobic003G040300 Sobic006G108766--Sobic004G207350 Sobic004G207350--Sobic004G037401 Sobic004G207350--Sobic003G406120 Sobic009G022600 Sobic009G022600 Sobic004G207350--Sobic009G022600 Sobic004G207350--Sobic005G230900 Sobic004G207350--Sobic006G108766 Sobic001G421450 Sobic001G421450 Sobic004G207350--Sobic001G421450 Sobic007G137201 Sobic007G137201 Sobic004G207350--Sobic007G137201 Sobic003G149700 Sobic003G149700 Sobic004G207350--Sobic003G149700 Sobic004G207350--Sobic001G084133 Sobic003G375500--Sobic005G027350 Sobic003G375500--Sobic010G183350 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic003G375500--Sobic009G074800 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic003G375500--Sobic002G067900 Sobic003G375500--Sobic003G124400 Sobic003G375500--Sobic003G401700 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic003G375500--Sobic001G250750 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic003G375500--Sobic003G232600 Sobic003G375500--Sobic009G026600 Sobic008G001600--Sobic006G257550 Sobic008G001600--Sobic003G406120 Sobic002G235000 Sobic002G235000 Sobic008G001600--Sobic002G235000 Sobic008G001600--Sobic008G001500 Sobic010G028366 Sobic010G028366 Sobic008G001600--Sobic010G028366 Sobic008G001600--Sobic006G108766 Sobic001G472900 Sobic001G472900 Sobic008G001600--Sobic001G472900 Sobic001G523050 Sobic001G523050 Sobic008G001600--Sobic001G523050 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic008G001600--Sobic003G076300
Octagon: transcription factors


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