Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G357200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5XCH1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G201933 - -
2 Sobic.006G206600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tyrosine phosphatase, putative, expressed -
3 Sobic.002G191900 OsFBX325 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G088300 expressed protein -
5 Sobic.003G271100 expressed protein -
6 Sobic.005G028500 expressed protein -
7 Sobic.005G078600 OsFBX411 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G139050 - -
9 Sobic.006G219400 - -
10 Sobic.009G131032 - -
11 Sobic.009G255000 tyrosine protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.010G002301 - -
13 Sobic.004G078200 - -
14 Sobic.007G028300 - -
15 Sobic.010G203400 - -
16 Sobic.007G113566 - -
17 Sobic.009G218700 pentatricopeptide, putative, expressed -
18 Sobic.006G112000 expressed protein -
19 Sobic.009G177100 DELLA protein GAI, putative, expressed -
20 Sobic.005G100500 RNA polymerase subunit, putative, expressed K03020: RPC19, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2


Gene co-expression network
sample Sobic002G357200 Sobic002G357200 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic002G357200--Sobic001G201933 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic002G357200--Sobic006G206600 Sobic002G191900 Sobic002G191900 Sobic002G357200--Sobic002G191900 Sobic002G088300 Sobic002G088300 Sobic002G357200--Sobic002G088300 Sobic003G271100 Sobic003G271100 Sobic002G357200--Sobic003G271100 Sobic005G028500 Sobic005G028500 Sobic002G357200--Sobic005G028500 Sobic005G078600 Sobic005G078600 Sobic002G357200--Sobic005G078600 Sobic003G139050 Sobic003G139050 Sobic002G357200--Sobic003G139050 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic002G357200--Sobic006G219400 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic001G201933--Sobic010G002301 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic001G201933--Sobic003G139600 Sobic001G201933--Sobic002G191900 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic001G201933--Sobic007G113566 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic001G201933--Sobic001G465600 Sobic004G162100 Sobic004G162100 Sobic001G201933--Sobic004G162100 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic001G201933--Sobic004G078200 Sobic001G201933--Sobic006G219400 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic001G201933--Sobic004G157050 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic006G206600--Sobic007G028300 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic006G206600--Sobic006G100150 Sobic006G206600--Sobic004G078200 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic006G206600--Sobic004G303900 Sobic009G218700 Sobic009G218700 Sobic006G206600--Sobic009G218700 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic006G206600--Sobic006G135701 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic006G206600--Sobic001G118050 Sobic006G206600--Sobic002G088300 Sobic006G206600--Sobic007G113566 Sobic002G191900--Sobic001G201933 Sobic002G191900--Sobic010G002301 Sobic002G191900--Sobic001G465600 Sobic002G191900--Sobic006G219400 Sobic002G191900--Sobic003G139600 Sobic002G191900--Sobic005G028500 Sobic002G191900--Sobic003G271100 Sobic002G191900--Sobic007G113566 Sobic002G191900--Sobic004G157050 Sobic003G340200 Sobic003G340200 Sobic002G088300--Sobic003G340200 Sobic002G088300--Sobic007G028300 Sobic002G025200 Sobic002G025200 Sobic002G088300--Sobic002G025200 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic002G088300--Sobic005G166200 Sobic009G131032 Sobic009G131032 Sobic002G088300--Sobic009G131032 Sobic002G419550 Sobic002G419550 Sobic002G088300--Sobic002G419550 Sobic002G088300--Sobic006G206600 Sobic002G088300--Sobic001G201933 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic002G088300--Sobic001G397550 Sobic003G271100--Sobic005G028500 Sobic003G271100--Sobic006G219400 Sobic003G271100--Sobic004G078200 Sobic003G271100--Sobic002G191900 Sobic003G271100--Sobic009G131032 Sobic003G271100--Sobic007G028300 Sobic003G271100--Sobic002G088300 Sobic003G271100--Sobic001G201933 Sobic006G074600 Sobic006G074600 Sobic003G271100--Sobic006G074600 Sobic005G028500--Sobic004G078200 Sobic005G028500--Sobic006G219400 Sobic005G028500--Sobic003G271100 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic005G028500--Sobic009G192200 Sobic009G255000 Sobic009G255000 Sobic005G028500--Sobic009G255000 Sobic005G028500--Sobic007G113566 Sobic005G028500--Sobic002G191900 Sobic005G028500--Sobic001G465600 Sobic005G028500--Sobic010G002301 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic005G078600--Sobic003G257650 Sobic010G203400 Sobic010G203400 Sobic005G078600--Sobic010G203400 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic005G078600--Sobic010G228800 Sobic006G241500 Sobic006G241500 Sobic005G078600--Sobic006G241500 Sobic003G327950 Sobic003G327950 Sobic005G078600--Sobic003G327950 Sobic001G089850 Sobic001G089850 Sobic005G078600--Sobic001G089850 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic005G078600--Sobic004G224733 Sobic005G078600--Sobic001G201933 Sobic010G226100 Sobic010G226100 Sobic005G078600--Sobic010G226100 Sobic003G139050--Sobic005G028500 Sobic003G139050--Sobic004G078200 Sobic003G139050--Sobic007G028300 Sobic003G139050--Sobic006G100150 Sobic001G144001 Sobic001G144001 Sobic003G139050--Sobic001G144001 Sobic003G139050--Sobic004G303900 Sobic003G139050--Sobic003G271100 Sobic003G139050--Sobic001G201933 Sobic003G139050--Sobic002G088300 Sobic006G219400--Sobic004G078200 Sobic006G219400--Sobic005G028500 Sobic006G219400--Sobic001G465600 Sobic006G219400--Sobic002G191900 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic006G219400--Sobic001G331650 Sobic006G219400--Sobic004G224733 Sobic006G219400--Sobic003G139600 Sobic006G219400--Sobic003G271100 Sobic006G219400--Sobic006G074600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.