Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G413300.1
Synonym Sb02g042590
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X4Z1
Pfam -
Panther DB PTHR35759
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G27710 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g47570.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015412
Brachypodium KQK14695 , KQK14694 , KQK14697 , KQK14696
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G218500 lecithine cholesterol acyltransferase, putative, expressed K00679: phospholipid:diacylglycerol acyltransferase
2 Sobic.008G001900 mitochondrial substrate carrier family protein, putative, expressed -
3 Sobic.004G079800 outer membrane protein, OMP85 family protein, expressed K07277: SAM50, TOB55, outer membrane protein insertion porin family
4 Sobic.005G084800 expressed protein -
5 Sobic.007G005400 chaperone protein dnaJ, putative, expressed K03686: molecular chaperone DnaJ
6 Sobic.006G128300 DUF565 domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G040900 CPuORF14 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed K03262: translation initiation factor 5
8 Sobic.003G085100 MYB family transcription factor, putative, expressed -
9 Sobic.006G038500 tRNA-dihydrouridine synthase, putative, expressed K05539: tRNA-dihydrouridine synthase A
10 Sobic.006G031800 - -
11 Sobic.001G025400 fumarylacetoacetase, putative, expressed K01557: acylpyruvate hydrolase
12 Sobic.003G217700 - -
13 Sobic.003G011300 expressed protein K12617: PATL1, DNA topoisomerase 2-associated protein PAT1
14 Sobic.010G032900 transketolase, putative, expressed K01662: 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase
15 Sobic.003G355900 prenylated rab acceptor, putative, expressed -
16 Sobic.001G495200 Glutathione reductases(PubMedID : 23783412)@glutathione reductase, putative, expressed K00383: GSR, glutathione reductase (NADPH)
17 Sobic.002G091600 methyltransferase, putative, expressed -
18 Sobic.002G131200 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G085600 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G163800 neutral/alkaline invertase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G413300 Sobic002G413300 Sobic002G218500 Sobic002G218500 Sobic002G413300--Sobic002G218500 Sobic008G001900 Sobic008G001900 Sobic002G413300--Sobic008G001900 Sobic004G079800 Sobic004G079800 Sobic002G413300--Sobic004G079800 Sobic005G084800 Sobic005G084800 Sobic002G413300--Sobic005G084800 Sobic007G005400 Sobic007G005400 Sobic002G413300--Sobic007G005400 Sobic006G128300 Sobic006G128300 Sobic002G413300--Sobic006G128300 Sobic004G040900 Sobic004G040900 Sobic002G413300--Sobic004G040900 Sobic003G085100 Sobic003G085100 Sobic002G413300--Sobic003G085100 Sobic006G038500 Sobic006G038500 Sobic002G413300--Sobic006G038500 Sobic002G218500--Sobic006G128300 Sobic006G031800 Sobic006G031800 Sobic002G218500--Sobic006G031800 Sobic002G218500--Sobic006G038500 Sobic001G043800 Sobic001G043800 Sobic002G218500--Sobic001G043800 Sobic002G431300 Sobic002G431300 Sobic002G218500--Sobic002G431300 Sobic007G029700 Sobic007G029700 Sobic002G218500--Sobic007G029700 Sobic001G516901 Sobic001G516901 Sobic002G218500--Sobic001G516901 Sobic002G218500--Sobic004G079800 Sobic002G218500--Sobic005G084800 Sobic005G001700 Sobic005G001700 Sobic008G001900--Sobic005G001700 Sobic001G073900 Sobic001G073900 Sobic008G001900--Sobic001G073900 Sobic004G235600 Sobic004G235600 Sobic008G001900--Sobic004G235600 Sobic008G001900--Sobic003G085100 Sobic003G332700 Sobic003G332700 Sobic008G001900--Sobic003G332700 Sobic004G054400 Sobic004G054400 Sobic008G001900--Sobic004G054400 Sobic005G063000 Sobic005G063000 Sobic008G001900--Sobic005G063000 Sobic005G204200 Sobic005G204200 Sobic008G001900--Sobic005G204200 Sobic001G465700 Sobic001G465700 Sobic008G001900--Sobic001G465700 Sobic004G079800--Sobic006G128300 Sobic001G495200 Sobic001G495200 Sobic004G079800--Sobic001G495200 Sobic009G092900 Sobic009G092900 Sobic004G079800--Sobic009G092900 Sobic001G025400 Sobic001G025400 Sobic004G079800--Sobic001G025400 Sobic003G150800 Sobic003G150800 Sobic004G079800--Sobic003G150800 Sobic001G198400 Sobic001G198400 Sobic004G079800--Sobic001G198400 Sobic002G274200 Sobic002G274200 Sobic004G079800--Sobic002G274200 Sobic004G079800--Sobic006G038500 Sobic004G079800--Sobic003G085100 Sobic004G238200 Sobic004G238200 Sobic005G084800--Sobic004G238200 Sobic004G163800 Sobic004G163800 Sobic005G084800--Sobic004G163800 Sobic005G199400 Sobic005G199400 Sobic005G084800--Sobic005G199400 Sobic003G355900 Sobic003G355900 Sobic005G084800--Sobic003G355900 Sobic003G369400 Sobic003G369400 Sobic005G084800--Sobic003G369400 Sobic005G084500 Sobic005G084500 Sobic005G084800--Sobic005G084500 Sobic003G176000 Sobic003G176000 Sobic005G084800--Sobic003G176000 Sobic005G084800--Sobic002G218500 Sobic010G236300 Sobic010G236300 Sobic005G084800--Sobic010G236300 Sobic007G005400--Sobic003G085100 Sobic002G118200 Sobic002G118200 Sobic007G005400--Sobic002G118200 Sobic007G005400--Sobic005G084500 Sobic007G005400--Sobic004G238200 Sobic007G005400--Sobic003G150800 Sobic003G287900 Sobic003G287900 Sobic007G005400--Sobic003G287900 Sobic005G231100 Sobic005G231100 Sobic007G005400--Sobic005G231100 Sobic004G337400 Sobic004G337400 Sobic007G005400--Sobic004G337400 Sobic007G185700 Sobic007G185700 Sobic007G005400--Sobic007G185700 Sobic006G128300--Sobic002G218500 Sobic006G128300--Sobic004G079800 Sobic006G128300--Sobic006G038500 Sobic006G128300--Sobic002G431300 Sobic002G347600 Sobic002G347600 Sobic006G128300--Sobic002G347600 Sobic002G042500 Sobic002G042500 Sobic006G128300--Sobic002G042500 Sobic006G128300--Sobic008G001900 Sobic001G126300 Sobic001G126300 Sobic006G128300--Sobic001G126300 Sobic006G128300--Sobic006G031800 Sobic002G359400 Sobic002G359400 Sobic004G040900--Sobic002G359400 Sobic002G294800 Sobic002G294800 Sobic004G040900--Sobic002G294800 Sobic010G013200 Sobic010G013200 Sobic004G040900--Sobic010G013200 Sobic001G402500 Sobic001G402500 Sobic004G040900--Sobic001G402500 Sobic008G070800 Sobic008G070800 Sobic004G040900--Sobic008G070800 Sobic001G120500 Sobic001G120500 Sobic004G040900--Sobic001G120500 Sobic008G183700 Sobic008G183700 Sobic004G040900--Sobic008G183700 Sobic004G296400 Sobic004G296400 Sobic004G040900--Sobic004G296400 Sobic004G040900--Sobic003G355900 Sobic003G085100--Sobic003G150800 Sobic003G085100--Sobic007G005400 Sobic005G111550 Sobic005G111550 Sobic003G085100--Sobic005G111550 Sobic003G160800 Sobic003G160800 Sobic003G085100--Sobic003G160800 Sobic003G085100--Sobic005G063000 Sobic003G233700 Sobic003G233700 Sobic003G085100--Sobic003G233700 Sobic001G001300 Sobic001G001300 Sobic003G085100--Sobic001G001300 Sobic003G085100--Sobic003G287900 Sobic003G085100--Sobic008G001900 Sobic006G038500--Sobic002G347600 Sobic006G038500--Sobic001G465700 Sobic004G120100 Sobic004G120100 Sobic006G038500--Sobic004G120100 Sobic006G038500--Sobic001G126300 Sobic003G141100 Sobic003G141100 Sobic006G038500--Sobic003G141100 Sobic006G038500--Sobic006G128300 Sobic006G038500--Sobic001G516901 Sobic003G232700 Sobic003G232700 Sobic006G038500--Sobic003G232700 Sobic006G038500--Sobic003G160800
Octagon: transcription factors


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