Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G013900.2,Sobic.003G013900.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VVF8 , A0A1W0VVD4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022876
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G095700 glutamate decarboxylase, putative, expressed K01580: E4.1.1.15, gadB, gadA, glutamate decarboxylase
2 Sobic.010G187700 GRAM and C2 domains containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G071096 - -
4 Sobic.009G177300 monocopper oxidase, putative, expressed -
5 Sobic.009G087200 AGC_PVPK_like_kin82y.12 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
6 Sobic.008G124301 - -
7 Sobic.007G091400 diacylglycerol kinase catalytic domain family protein, expressed K00901: dgkA, diacylglycerol kinase (ATP)
8 Sobic.002G066100 - -
9 Sobic.001G473700 OsSCP11 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
10 Sobic.002G351500 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
11 Sobic.009G216400 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G027300 RALFL17 - Rapid ALkalinization Factor RALF family protein precursor, expressed -
13 Sobic.008G048200 ATEXO70C2, putative, expressed -
14 Sobic.001G103100 DNA binding protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G318300 endoglucanase, putative, expressed K01179: endoglucanase
16 Sobic.004G294200 ZOS2-13 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
17 Sobic.004G070600 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G147700 pectinesterase inhibitor domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.010G230200 myb-like DNA-binding domain containing protein, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
20 Sobic.006G026200 gamma-thionin family domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G013900 Sobic003G013900 Sobic006G095700 Sobic006G095700 Sobic003G013900--Sobic006G095700 Sobic010G187700 Sobic010G187700 Sobic003G013900--Sobic010G187700 Sobic006G071096 Sobic006G071096 Sobic003G013900--Sobic006G071096 Sobic009G177300 Sobic009G177300 Sobic003G013900--Sobic009G177300 Sobic009G087200 Sobic009G087200 Sobic003G013900--Sobic009G087200 Sobic008G124301 Sobic008G124301 Sobic003G013900--Sobic008G124301 Sobic007G091400 Sobic007G091400 Sobic003G013900--Sobic007G091400 Sobic002G066100 Sobic002G066100 Sobic003G013900--Sobic002G066100 Sobic001G473700 Sobic001G473700 Sobic003G013900--Sobic001G473700 Sobic002G283000 Sobic002G283000 Sobic006G095700--Sobic002G283000 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic006G095700--Sobic004G137200 Sobic001G540000 Sobic001G540000 Sobic006G095700--Sobic001G540000 Sobic004G025600 Sobic004G025600 Sobic006G095700--Sobic004G025600 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic006G095700--Sobic002G091200 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic006G095700--Sobic002G106800 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic006G095700--Sobic003G173800 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic006G095700--Sobic009G098900 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic006G095700--Sobic005G010000 Sobic010G187700--Sobic002G066100 Sobic010G187700--Sobic009G177300 Sobic004G294200 Sobic004G294200 Sobic010G187700--Sobic004G294200 Sobic010G187700--Sobic008G124301 Sobic010G187700--Sobic006G071096 Sobic002G351500 Sobic002G351500 Sobic010G187700--Sobic002G351500 Sobic006G237700 Sobic006G237700 Sobic010G187700--Sobic006G237700 Sobic003G164700 Sobic003G164700 Sobic010G187700--Sobic003G164700 Sobic002G197900 Sobic002G197900 Sobic010G187700--Sobic002G197900 Sobic006G071096--Sobic001G473700 Sobic006G071096--Sobic009G177300 Sobic003G027300 Sobic003G027300 Sobic006G071096--Sobic003G027300 Sobic006G071096--Sobic009G087200 Sobic009G216400 Sobic009G216400 Sobic006G071096--Sobic009G216400 Sobic004G318300 Sobic004G318300 Sobic006G071096--Sobic004G318300 Sobic006G071096--Sobic002G351500 Sobic010G230200 Sobic010G230200 Sobic006G071096--Sobic010G230200 Sobic006G071096--Sobic002G066100 Sobic009G177300--Sobic002G351500 Sobic009G177300--Sobic009G216400 Sobic009G177300--Sobic006G071096 Sobic009G177300--Sobic004G294200 Sobic003G178000 Sobic003G178000 Sobic009G177300--Sobic003G178000 Sobic009G177300--Sobic002G066100 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic009G177300--Sobic003G061700 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic009G177300--Sobic007G100800 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic009G177300--Sobic008G186900 Sobic009G087200--Sobic003G027300 Sobic009G087200--Sobic004G318300 Sobic009G087200--Sobic001G473700 Sobic009G087200--Sobic010G230200 Sobic009G087200--Sobic006G071096 Sobic005G031700 Sobic005G031700 Sobic009G087200--Sobic005G031700 Sobic009G087200--Sobic009G177300 Sobic008G043400 Sobic008G043400 Sobic009G087200--Sobic008G043400 Sobic009G087200--Sobic009G216400 Sobic008G124301--Sobic004G294200 Sobic008G134600 Sobic008G134600 Sobic008G124301--Sobic008G134600 Sobic008G124301--Sobic003G164700 Sobic008G124301--Sobic002G197900 Sobic008G124301--Sobic002G066100 Sobic003G317600 Sobic003G317600 Sobic008G124301--Sobic003G317600 Sobic007G175800 Sobic007G175800 Sobic008G124301--Sobic007G175800 Sobic008G119501 Sobic008G119501 Sobic008G124301--Sobic008G119501 Sobic008G124301--Sobic006G237700 Sobic004G070600 Sobic004G070600 Sobic007G091400--Sobic004G070600 Sobic009G102700 Sobic009G102700 Sobic007G091400--Sobic009G102700 Sobic010G252600 Sobic010G252600 Sobic007G091400--Sobic010G252600 Sobic002G254700 Sobic002G254700 Sobic007G091400--Sobic002G254700 Sobic001G528700 Sobic001G528700 Sobic007G091400--Sobic001G528700 Sobic002G295800 Sobic002G295800 Sobic007G091400--Sobic002G295800 Sobic001G452500 Sobic001G452500 Sobic007G091400--Sobic001G452500 Sobic009G105100 Sobic009G105100 Sobic007G091400--Sobic009G105100 Sobic006G026200 Sobic006G026200 Sobic007G091400--Sobic006G026200 Sobic002G066100--Sobic004G294200 Sobic002G066100--Sobic009G177300 Sobic002G066100--Sobic003G164700 Sobic002G066100--Sobic008G124301 Sobic002G066100--Sobic002G351500 Sobic002G066100--Sobic002G197900 Sobic002G066100--Sobic009G216400 Sobic002G066100--Sobic003G178000 Sobic002G066100--Sobic006G071096 Sobic001G473700--Sobic006G071096 Sobic001G473700--Sobic009G087200 Sobic001G473700--Sobic003G027300 Sobic001G473700--Sobic009G177300 Sobic001G473700--Sobic004G318300 Sobic001G473700--Sobic009G216400 Sobic001G473700--Sobic010G230200 Sobic001G473700--Sobic002G351500 Sobic006G219700 Sobic006G219700 Sobic001G473700--Sobic006G219700
Octagon: transcription factors


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