Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G073750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q1T8
Pfam PF12442
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g05170.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G020900 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR31 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
2 Sobic.008G123801 - -
3 Sobic.001G034900 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@actin-depolymerizing factor, putative, expressed K05765: cofilin
4 Sobic.009G154700 Ferredoxin-6(PubMedID : 26186930)@2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain containing protein, expressed K02639: ferredoxin
5 Sobic.002G067700 expressed protein -
6 Sobic.005G169000 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed -
7 Sobic.002G024650 - -
8 Sobic.010G006000 expressed protein -
9 Sobic.002G416900 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
10 Sobic.003G176350 - -
11 Sobic.007G015800 - -
12 Sobic.004G180301 - -
13 Sobic.001G049700 UDP-rhamnose rhamnosyltransferase, putative, expressed -
14 Sobic.001G121850 - -
15 Sobic.001G121850 - -
16 Sobic.001G121850 - -
17 Sobic.001G121850 - -
18 Sobic.001G121850 - -
19 Sobic.001G121850 - -
20 Sobic.001G121850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G073750 Sobic003G073750 Sobic007G020900 Sobic007G020900 Sobic003G073750--Sobic007G020900 Sobic008G123801 Sobic008G123801 Sobic003G073750--Sobic008G123801 Sobic001G034900 Sobic001G034900 Sobic003G073750--Sobic001G034900 Sobic009G154700 Sobic009G154700 Sobic003G073750--Sobic009G154700 Sobic002G067700 Sobic002G067700 Sobic003G073750--Sobic002G067700 Sobic005G169000 Sobic005G169000 Sobic003G073750--Sobic005G169000 Sobic002G024650 Sobic002G024650 Sobic003G073750--Sobic002G024650 Sobic010G006000 Sobic010G006000 Sobic003G073750--Sobic010G006000 Sobic002G416900 Sobic002G416900 Sobic003G073750--Sobic002G416900 Sobic007G020900--Sobic009G154700 Sobic003G176350 Sobic003G176350 Sobic007G020900--Sobic003G176350 Sobic007G020900--Sobic003G073750 Sobic010G006100 Sobic010G006100 Sobic007G020900--Sobic010G006100 Sobic007G020900--Sobic010G006000 Sobic002G361800 Sobic002G361800 Sobic007G020900--Sobic002G361800 Sobic003G360100 Sobic003G360100 Sobic007G020900--Sobic003G360100 Sobic003G228600 Sobic003G228600 Sobic007G020900--Sobic003G228600 Sobic003G426100 Sobic003G426100 Sobic007G020900--Sobic003G426100 Sobic001G121850 Sobic001G121850 Sobic008G123801--Sobic001G121850 Sobic008G123801--Sobic002G024650 Sobic001G034900--Sobic003G073750 Sobic002G389100 Sobic002G389100 Sobic001G034900--Sobic002G389100 Sobic009G158500 Sobic009G158500 Sobic001G034900--Sobic009G158500 Sobic010G221800 Sobic010G221800 Sobic001G034900--Sobic010G221800 Sobic010G070750 Sobic010G070750 Sobic001G034900--Sobic010G070750 Sobic002G210401 Sobic002G210401 Sobic001G034900--Sobic002G210401 Sobic001G508400 Sobic001G508400 Sobic001G034900--Sobic001G508400 Sobic002G318100 Sobic002G318100 Sobic001G034900--Sobic002G318100 Sobic006G012800 Sobic006G012800 Sobic001G034900--Sobic006G012800 Sobic003G062600 Sobic003G062600 Sobic009G154700--Sobic003G062600 Sobic007G176000 Sobic007G176000 Sobic009G154700--Sobic007G176000 Sobic004G349125 Sobic004G349125 Sobic009G154700--Sobic004G349125 Sobic009G154700--Sobic002G361800 Sobic008G106700 Sobic008G106700 Sobic009G154700--Sobic008G106700 Sobic006G203700 Sobic006G203700 Sobic009G154700--Sobic006G203700 Sobic004G217800 Sobic004G217800 Sobic009G154700--Sobic004G217800 Sobic006G044100 Sobic006G044100 Sobic009G154700--Sobic006G044100 Sobic009G154700--Sobic003G228600 Sobic002G067700--Sobic008G123801 Sobic002G067700--Sobic001G121850 Sobic005G169000--Sobic003G426100 Sobic005G164300 Sobic005G164300 Sobic005G169000--Sobic005G164300 Sobic005G045500 Sobic005G045500 Sobic005G169000--Sobic005G045500 Sobic006G206900 Sobic006G206900 Sobic005G169000--Sobic006G206900 Sobic010G102300 Sobic010G102300 Sobic005G169000--Sobic010G102300 Sobic004G180301 Sobic004G180301 Sobic005G169000--Sobic004G180301 Sobic010G035700 Sobic010G035700 Sobic005G169000--Sobic010G035700 Sobic007G067300 Sobic007G067300 Sobic005G169000--Sobic007G067300 Sobic007G066932 Sobic007G066932 Sobic005G169000--Sobic007G066932 Sobic002G024650--Sobic001G121850 Sobic002G024650--Sobic005G045500 Sobic010G006000--Sobic003G176350 Sobic001G049700 Sobic001G049700 Sobic010G006000--Sobic001G049700 Sobic010G006000--Sobic010G035700 Sobic006G275300 Sobic006G275300 Sobic010G006000--Sobic006G275300 Sobic010G006000--Sobic003G426100 Sobic010G006000--Sobic004G180301 Sobic005G033900 Sobic005G033900 Sobic010G006000--Sobic005G033900 Sobic010G006000--Sobic007G066932 Sobic002G310500 Sobic002G310500 Sobic010G006000--Sobic002G310500 Sobic010G106500 Sobic010G106500 Sobic002G416900--Sobic010G106500 Sobic009G106400 Sobic009G106400 Sobic002G416900--Sobic009G106400 Sobic003G016100 Sobic003G016100 Sobic002G416900--Sobic003G016100 Sobic010G271200 Sobic010G271200 Sobic002G416900--Sobic010G271200 Sobic010G067400 Sobic010G067400 Sobic002G416900--Sobic010G067400 Sobic003G360600 Sobic003G360600 Sobic002G416900--Sobic003G360600 Sobic009G187200 Sobic009G187200 Sobic002G416900--Sobic009G187200 Sobic001G318000 Sobic001G318000 Sobic002G416900--Sobic001G318000 Sobic002G416900--Sobic004G349125
Octagon: transcription factors


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