Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G020900.1
Synonym Sb07g001830, SbSAUR53, small auxin up RNA
Functional annotation "domain confirmed by Pfam database, expression not supported" (PubMedID : 20499123)
OsSAUR31 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed
UniProt C5YMF2
Pfam PF02519
Panther DB PTHR31374 PTHR31374:SF54
NCBI CDD -
KEGG Orthology K14488; SAUR family protein
Gene Ontology GO:0009733; response to auxin


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G21210 : SAUR-like auxin-responsive protein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g02520.1 : OsSAUR31 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030231
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G154700 Ferredoxin-6(PubMedID : 26186930)@2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain containing protein, expressed K02639: ferredoxin
2 Sobic.003G176350 - -
3 Sobic.003G073750 - -
4 Sobic.010G006100 expressed protein -
5 Sobic.010G006000 expressed protein -
6 Sobic.002G361800 expressed protein -
7 Sobic.003G360100 expressed protein -
8 Sobic.003G228600 cytochrome P450 72A1, putative, expressed -
9 Sobic.003G426100 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
10 Sobic.005G156500 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed K08237: hydroquinone glucosyltransferase
11 Sobic.007G066932 - -
12 Sobic.003G430600 OsCML19 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed K13448: calcium-binding protein CML
13 Sobic.005G169000 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed -
14 Sobic.007G067350 - -
15 Sobic.004G349125 - -
16 Sobic.001G319700 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
17 Sobic.004G217800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ammonium transporter protein, putative, expressed K03320: amt, AMT, ammonium transporter, Amt family
18 Sobic.009G108300 inhibitor I family protein, putative, expressed -
19 Sobic.010G035700 expressed protein -
20 Sobic.002G101900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G020900 Sobic007G020900 Sobic009G154700 Sobic009G154700 Sobic007G020900--Sobic009G154700 Sobic003G176350 Sobic003G176350 Sobic007G020900--Sobic003G176350 Sobic003G073750 Sobic003G073750 Sobic007G020900--Sobic003G073750 Sobic010G006100 Sobic010G006100 Sobic007G020900--Sobic010G006100 Sobic010G006000 Sobic010G006000 Sobic007G020900--Sobic010G006000 Sobic002G361800 Sobic002G361800 Sobic007G020900--Sobic002G361800 Sobic003G360100 Sobic003G360100 Sobic007G020900--Sobic003G360100 Sobic003G228600 Sobic003G228600 Sobic007G020900--Sobic003G228600 Sobic003G426100 Sobic003G426100 Sobic007G020900--Sobic003G426100 Sobic003G062600 Sobic003G062600 Sobic009G154700--Sobic003G062600 Sobic007G176000 Sobic007G176000 Sobic009G154700--Sobic007G176000 Sobic004G349125 Sobic004G349125 Sobic009G154700--Sobic004G349125 Sobic009G154700--Sobic002G361800 Sobic008G106700 Sobic008G106700 Sobic009G154700--Sobic008G106700 Sobic006G203700 Sobic006G203700 Sobic009G154700--Sobic006G203700 Sobic004G217800 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Sobic003G426100--Sobic007G135201 Sobic007G067600 Sobic007G067600 Sobic003G426100--Sobic007G067600
Octagon: transcription factors


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