Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G101900.1,Sobic.002G101900.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QAC4 , A0A1B6QAA4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G038300 embryogenesis transmembrane protein, putative, expressed -
2 Sobic.007G025000 expressed protein -
3 Sobic.005G107800 chalcone synthase, putative, expressed -
4 Sobic.003G360100 expressed protein -
5 Sobic.007G047500 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
6 Sobic.007G030501 - -
7 Sobic.009G033300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
8 Sobic.005G202200 integral membrane protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G384700 pectinacetylesterase domain containing protein, expressed -
10 Sobic.009G016300 ZOS5-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
11 Sobic.004G009500 transporter, major facilitator family, putative, expressed K02575: NRT, narK, nrtP, MFS transporter, NNP family, nitrate/nitrite transporter
12 Sobic.007G054600 serine-rich protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G361800 expressed protein -
14 Sobic.005G045600 O-methyltransferase, putative, expressed -
15 Sobic.009G170700 bet v I allergen family protein, putative, expressed K14496: abscisic acid receptor PYR/PYL family
16 Sobic.003G368600 terpene synthase, putative, expressed -
17 Sobic.001G360400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
18 Sobic.002G042200 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
19 Sobic.006G122800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@dirigent, putative, expressed -
20 Sobic.004G316500 tentative name(PubMedID : 31536532)@nuclear transcription factor Y subunit, putative, expressed K08064: NFYA, nuclear transcription factor Y, alpha


Gene co-expression network
sample Sobic002G101900 Sobic002G101900 Sobic005G038300 Sobic005G038300 Sobic002G101900--Sobic005G038300 Sobic007G025000 Sobic007G025000 Sobic002G101900--Sobic007G025000 Sobic005G107800 Sobic005G107800 Sobic002G101900--Sobic005G107800 Sobic003G360100 Sobic003G360100 Sobic002G101900--Sobic003G360100 Sobic007G047500 Sobic007G047500 Sobic002G101900--Sobic007G047500 Sobic007G030501 Sobic007G030501 Sobic002G101900--Sobic007G030501 Sobic009G033300 Sobic009G033300 Sobic002G101900--Sobic009G033300 Sobic005G202200 Sobic005G202200 Sobic002G101900--Sobic005G202200 Sobic003G384700 Sobic003G384700 Sobic002G101900--Sobic003G384700 Sobic005G038300--Sobic002G101900 Sobic004G009500 Sobic004G009500 Sobic005G038300--Sobic004G009500 Sobic005G038300--Sobic007G025000 Sobic007G057400 Sobic007G057400 Sobic005G038300--Sobic007G057400 Sobic008G181000 Sobic008G181000 Sobic005G038300--Sobic008G181000 Sobic005G080400 Sobic005G080400 Sobic005G038300--Sobic005G080400 Sobic005G038300--Sobic003G360100 Sobic002G228800 Sobic002G228800 Sobic005G038300--Sobic002G228800 Sobic005G038300--Sobic003G384700 Sobic007G025000--Sobic005G202200 Sobic007G025000--Sobic005G038300 Sobic007G025000--Sobic002G101900 Sobic001G301300 Sobic001G301300 Sobic007G025000--Sobic001G301300 Sobic007G025000--Sobic004G009500 Sobic007G025000--Sobic003G384700 Sobic007G025000--Sobic007G047500 Sobic006G122800 Sobic006G122800 Sobic007G025000--Sobic006G122800 Sobic007G025000--Sobic008G181000 Sobic003G368600 Sobic003G368600 Sobic005G107800--Sobic003G368600 Sobic006G197100 Sobic006G197100 Sobic005G107800--Sobic006G197100 Sobic005G107800--Sobic007G030501 Sobic004G348400 Sobic004G348400 Sobic005G107800--Sobic004G348400 Sobic001G500000 Sobic001G500000 Sobic005G107800--Sobic001G500000 Sobic002G287100 Sobic002G287100 Sobic005G107800--Sobic002G287100 Sobic001G481400 Sobic001G481400 Sobic005G107800--Sobic001G481400 Sobic003G062600 Sobic003G062600 Sobic005G107800--Sobic003G062600 Sobic003G011600 Sobic003G011600 Sobic005G107800--Sobic003G011600 Sobic003G360100--Sobic007G030501 Sobic005G061200 Sobic005G061200 Sobic003G360100--Sobic005G061200 Sobic003G360100--Sobic006G197100 Sobic003G360100--Sobic005G107800 Sobic007G176000 Sobic007G176000 Sobic003G360100--Sobic007G176000 Sobic002G320800 Sobic002G320800 Sobic003G360100--Sobic002G320800 Sobic002G042200 Sobic002G042200 Sobic003G360100--Sobic002G042200 Sobic003G360100--Sobic005G038300 Sobic003G360100--Sobic004G009500 Sobic001G360400 Sobic001G360400 Sobic007G047500--Sobic001G360400 Sobic010G070300 Sobic010G070300 Sobic007G047500--Sobic010G070300 Sobic010G113100 Sobic010G113100 Sobic007G047500--Sobic010G113100 Sobic007G047500--Sobic007G030501 Sobic004G212600 Sobic004G212600 Sobic007G047500--Sobic004G212600 Sobic010G206800 Sobic010G206800 Sobic007G047500--Sobic010G206800 Sobic003G351600 Sobic003G351600 Sobic007G047500--Sobic003G351600 Sobic010G204200 Sobic010G204200 Sobic007G047500--Sobic010G204200 Sobic007G021900 Sobic007G021900 Sobic007G047500--Sobic007G021900 Sobic007G176100 Sobic007G176100 Sobic007G030501--Sobic007G176100 Sobic007G030501--Sobic007G176000 Sobic007G030501--Sobic006G197100 Sobic007G030501--Sobic003G368600 Sobic004G349125 Sobic004G349125 Sobic007G030501--Sobic004G349125 Sobic004G139300 Sobic004G139300 Sobic007G030501--Sobic004G139300 Sobic002G261300 Sobic002G261300 Sobic007G030501--Sobic002G261300 Sobic010G252500 Sobic010G252500 Sobic007G030501--Sobic010G252500 Sobic007G030501--Sobic002G042200 Sobic009G033300--Sobic002G287100 Sobic006G249300 Sobic006G249300 Sobic009G033300--Sobic006G249300 Sobic009G033300--Sobic001G500000 Sobic008G186100 Sobic008G186100 Sobic009G033300--Sobic008G186100 Sobic002G250000 Sobic002G250000 Sobic009G033300--Sobic002G250000 Sobic004G100700 Sobic004G100700 Sobic009G033300--Sobic004G100700 Sobic001G476500 Sobic001G476500 Sobic009G033300--Sobic001G476500 Sobic009G170700 Sobic009G170700 Sobic009G033300--Sobic009G170700 Sobic001G139100 Sobic001G139100 Sobic009G033300--Sobic001G139100 Sobic005G202200--Sobic007G025000 Sobic005G202200--Sobic001G301300 Sobic005G202200--Sobic007G047500 Sobic009G076300 Sobic009G076300 Sobic005G202200--Sobic009G076300 Sobic004G333000 Sobic004G333000 Sobic005G202200--Sobic004G333000 Sobic008G164450 Sobic008G164450 Sobic005G202200--Sobic008G164450 Sobic001G482000 Sobic001G482000 Sobic005G202200--Sobic001G482000 Sobic004G164300 Sobic004G164300 Sobic005G202200--Sobic004G164300 Sobic002G053700 Sobic002G053700 Sobic005G202200--Sobic002G053700 Sobic003G384700--Sobic006G122800 Sobic003G157600 Sobic003G157600 Sobic003G384700--Sobic003G157600 Sobic005G063400 Sobic005G063400 Sobic003G384700--Sobic005G063400 Sobic001G147900 Sobic001G147900 Sobic003G384700--Sobic001G147900 Sobic003G384700--Sobic002G042200 Sobic010G161800 Sobic010G161800 Sobic003G384700--Sobic010G161800 Sobic003G384700--Sobic005G080400 Sobic003G384700--Sobic003G351600 Sobic005G203200 Sobic005G203200 Sobic003G384700--Sobic005G203200
Octagon: transcription factors


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