Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G147900.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q396
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g40990.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028578
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G103000 expressed protein -
2 Sobic.003G188900 expressed protein -
3 Sobic.004G078400 leucine-rich repeat receptor protein kinase EXS precursor, putative, expressed -
4 Sobic.001G502300 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G528000 SNARE domain containing protein, putative, expressed K08503: syntaxin of plants SYP5
6 Sobic.001G509000 cell division control protein 48 homolog E, putative, expressed -
7 Sobic.001G267400 - -
8 Sobic.001G267950 - -
9 Sobic.004G131350 - -
10 Sobic.007G006350 - -
11 Sobic.004G281750 - -
12 Sobic.008G153900 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
13 Sobic.005G199500 OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
14 Sobic.002G213050 - -
15 Sobic.003G049100 prolyl 4-hydroxylase, putative, expressed K00472: prolyl 4-hydroxylase
16 Sobic.007G075200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@bifunctional purine biosynthesis protein purH, putative, expressed K00602: phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase / IMP cyclohydrolase
17 Sobic.002G054901 - -
18 Sobic.010G091366 - -
19 Sobic.006G262001 - -
20 Sobic.006G236100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G147900 Sobic003G147900 Sobic010G103000 Sobic010G103000 Sobic003G147900--Sobic010G103000 Sobic003G188900 Sobic003G188900 Sobic003G147900--Sobic003G188900 Sobic004G078400 Sobic004G078400 Sobic003G147900--Sobic004G078400 Sobic001G502300 Sobic001G502300 Sobic003G147900--Sobic001G502300 Sobic001G528000 Sobic001G528000 Sobic003G147900--Sobic001G528000 Sobic001G509000 Sobic001G509000 Sobic003G147900--Sobic001G509000 Sobic001G267400 Sobic001G267400 Sobic003G147900--Sobic001G267400 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic003G147900--Sobic001G267950 Sobic004G131350 Sobic004G131350 Sobic003G147900--Sobic004G131350 Sobic007G075200 Sobic007G075200 Sobic010G103000--Sobic007G075200 Sobic006G261000 Sobic006G261000 Sobic010G103000--Sobic006G261000 Sobic002G213050 Sobic002G213050 Sobic010G103000--Sobic002G213050 Sobic010G103000--Sobic001G528000 Sobic010G103000--Sobic004G078400 Sobic003G049100 Sobic003G049100 Sobic010G103000--Sobic003G049100 Sobic010G103000--Sobic003G188900 Sobic006G053500 Sobic006G053500 Sobic010G103000--Sobic006G053500 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic010G103000--Sobic005G199500 Sobic003G188900--Sobic010G103000 Sobic003G188900--Sobic004G078400 Sobic001G112300 Sobic001G112300 Sobic003G188900--Sobic001G112300 Sobic003G188900--Sobic002G213050 Sobic004G089600 Sobic004G089600 Sobic003G188900--Sobic004G089600 Sobic007G069750 Sobic007G069750 Sobic003G188900--Sobic007G069750 Sobic006G155400 Sobic006G155400 Sobic003G188900--Sobic006G155400 Sobic007G202000 Sobic007G202000 Sobic003G188900--Sobic007G202000 Sobic006G123600 Sobic006G123600 Sobic003G188900--Sobic006G123600 Sobic004G078400--Sobic010G103000 Sobic010G129900 Sobic010G129900 Sobic004G078400--Sobic010G129900 Sobic004G078400--Sobic003G188900 Sobic004G078400--Sobic007G069750 Sobic004G078400--Sobic005G199500 Sobic004G078400--Sobic001G112300 Sobic004G078400--Sobic002G213050 Sobic001G221750 Sobic001G221750 Sobic004G078400--Sobic001G221750 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic004G078400--Sobic004G055400 Sobic003G141550 Sobic003G141550 Sobic001G502300--Sobic003G141550 Sobic002G302400 Sobic002G302400 Sobic001G502300--Sobic002G302400 Sobic008G148700 Sobic008G148700 Sobic001G502300--Sobic008G148700 Sobic003G058400 Sobic003G058400 Sobic001G502300--Sobic003G058400 Sobic005G082950 Sobic005G082950 Sobic001G502300--Sobic005G082950 Sobic001G272300 Sobic001G272300 Sobic001G502300--Sobic001G272300 Sobic001G528000--Sobic001G267950 Sobic001G528000--Sobic005G199500 Sobic001G528000--Sobic007G075200 Sobic001G528000--Sobic006G261000 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic001G528000--Sobic006G018500 Sobic001G528000--Sobic003G049100 Sobic007G005800 Sobic007G005800 Sobic001G528000--Sobic007G005800 Sobic001G497750 Sobic001G497750 Sobic001G528000--Sobic001G497750 Sobic001G493300 Sobic001G493300 Sobic001G528000--Sobic001G493300 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic001G509000--Sobic003G372950 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic001G509000--Sobic003G064000 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic001G509000--Sobic004G286450 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic001G509000--Sobic005G057600 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic001G509000--Sobic001G062200 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic001G509000--Sobic008G154200 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic001G509000--Sobic007G059800 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic001G509000--Sobic004G201200 Sobic008G166000 Sobic008G166000 Sobic001G509000--Sobic008G166000 Sobic007G006350 Sobic007G006350 Sobic001G267400--Sobic007G006350 Sobic004G082200 Sobic004G082200 Sobic001G267400--Sobic004G082200 Sobic007G154901 Sobic007G154901 Sobic001G267400--Sobic007G154901 Sobic001G255500 Sobic001G255500 Sobic001G267400--Sobic001G255500 Sobic001G267400--Sobic001G272300 Sobic001G267950--Sobic005G199500 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic001G267950--Sobic002G069601 Sobic001G267950--Sobic006G018500 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic001G267950--Sobic003G353050 Sobic001G267950--Sobic007G075200 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic001G267950--Sobic003G318400 Sobic009G214700 Sobic009G214700 Sobic001G267950--Sobic009G214700 Sobic008G192200 Sobic008G192200 Sobic001G267950--Sobic008G192200 Sobic001G267950--Sobic003G049100 Sobic008G153900 Sobic008G153900 Sobic004G131350--Sobic008G153900 Sobic004G131350--Sobic006G053500 Sobic010G091366 Sobic010G091366 Sobic004G131350--Sobic010G091366 Sobic001G318366 Sobic001G318366 Sobic004G131350--Sobic001G318366 Sobic004G131350--Sobic004G082200 Sobic007G141001 Sobic007G141001 Sobic004G131350--Sobic007G141001 Sobic004G338400 Sobic004G338400 Sobic004G131350--Sobic004G338400 Sobic001G041450 Sobic001G041450 Sobic004G131350--Sobic001G041450 Sobic005G156800 Sobic005G156800 Sobic004G131350--Sobic005G156800
Octagon: transcription factors


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