Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G191400.1
Synonym Sb03g025530
Functional annotation DUF538 domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5XNN8
Pfam PF04398
Panther DB PTHR31676 PTHR31676:SF16
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G08890 : Protein of unknown function, DUF538
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g38500.1 : DUF538 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028421
Brachypodium KQK08355
Barley HORVU3Hr1G048630.3 , HORVU3Hr1G048630.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G172000 - -
2 Sobic.010G191900 two-component response regulator, putative, expressed -
3 Sobic.008G168932 - -
4 Sobic.004G289900 expressed protein K15193: SPTY2D1, protein SPT2
5 Sobic.004G024800 microtubule associated protein, putative, expressed K16732: protein regulator of cytokinesis 1
6 Sobic.001G539880 - -
7 Sobic.005G185750 - -
8 Sobic.010G257800 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
9 Sobic.008G097800 CAMK_CAMK_like.47 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
10 Sobic.005G035200 - -
11 Sobic.007G221932 - -
12 Sobic.002G128700 expressed protein -
13 Sobic.007G148233 - -
14 Sobic.002G145400 octicosapeptide/Phox/Bem1p, putative, expressed -
15 Sobic.008G011901 - K00889: 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase
16 Sobic.004G336401 - -
17 Sobic.007G080100 DNA binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G195400 - -
19 Sobic.005G035250 - -
20 Sobic.009G091000 TKL_IRAK_CrRLK1L-1.11 - The CrRLK1L-1 subfamily has homology to the CrRLK1L homolog, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G191400 Sobic003G191400 Sobic005G172000 Sobic005G172000 Sobic003G191400--Sobic005G172000 Sobic010G191900 Sobic010G191900 Sobic003G191400--Sobic010G191900 Sobic008G168932 Sobic008G168932 Sobic003G191400--Sobic008G168932 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic003G191400--Sobic004G289900 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic003G191400--Sobic004G024800 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic003G191400--Sobic001G539880 Sobic005G185750 Sobic005G185750 Sobic003G191400--Sobic005G185750 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic003G191400--Sobic010G257800 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic003G191400--Sobic008G097800 Sobic005G172000--Sobic003G191400 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic005G172000--Sobic002G128700 Sobic005G172000--Sobic010G257800 Sobic010G190500 Sobic010G190500 Sobic005G172000--Sobic010G190500 Sobic006G173400 Sobic006G173400 Sobic005G172000--Sobic006G173400 Sobic010G271600 Sobic010G271600 Sobic005G172000--Sobic010G271600 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic005G172000--Sobic005G009700 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic005G172000--Sobic001G539820 Sobic008G102850 Sobic008G102850 Sobic005G172000--Sobic008G102850 Sobic010G191900--Sobic003G191400 Sobic008G181900 Sobic008G181900 Sobic010G191900--Sobic008G181900 Sobic001G539600 Sobic001G539600 Sobic010G191900--Sobic001G539600 Sobic004G222400 Sobic004G222400 Sobic010G191900--Sobic004G222400 Sobic010G141001 Sobic010G141001 Sobic010G191900--Sobic010G141001 Sobic003G255400 Sobic003G255400 Sobic010G191900--Sobic003G255400 Sobic010G276200 Sobic010G276200 Sobic010G191900--Sobic010G276200 Sobic003G329600 Sobic003G329600 Sobic010G191900--Sobic003G329600 Sobic010G176400 Sobic010G176400 Sobic010G191900--Sobic010G176400 Sobic008G168932--Sobic004G289900 Sobic008G168932--Sobic005G185750 Sobic005G068500 Sobic005G068500 Sobic008G168932--Sobic005G068500 Sobic008G099000 Sobic008G099000 Sobic008G168932--Sobic008G099000 Sobic008G168932--Sobic008G181900 Sobic008G168932--Sobic004G024800 Sobic002G323000 Sobic002G323000 Sobic008G168932--Sobic002G323000 Sobic006G044800 Sobic006G044800 Sobic008G168932--Sobic006G044800 Sobic008G168932--Sobic004G222400 Sobic004G289900--Sobic008G168932 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic004G289900--Sobic001G513400 Sobic004G289900--Sobic005G185750 Sobic004G289900--Sobic005G068500 Sobic001G036200 Sobic001G036200 Sobic004G289900--Sobic001G036200 Sobic004G289900--Sobic008G099000 Sobic004G289900--Sobic004G024800 Sobic004G289900--Sobic006G044800 Sobic004G289900--Sobic010G257800 Sobic004G024800--Sobic001G539880 Sobic005G035200 Sobic005G035200 Sobic004G024800--Sobic005G035200 Sobic007G080100 Sobic007G080100 Sobic004G024800--Sobic007G080100 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic004G024800--Sobic003G195400 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic004G024800--Sobic007G148233 Sobic008G011901 Sobic008G011901 Sobic004G024800--Sobic008G011901 Sobic002G145400 Sobic002G145400 Sobic004G024800--Sobic002G145400 Sobic007G221932 Sobic007G221932 Sobic004G024800--Sobic007G221932 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic004G024800--Sobic005G035250 Sobic001G539880--Sobic007G148233 Sobic001G539880--Sobic003G195400 Sobic001G539880--Sobic004G024800 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic001G539880--Sobic002G225800 Sobic001G539880--Sobic005G035250 Sobic001G539880--Sobic005G035200 Sobic001G539880--Sobic007G080100 Sobic001G539880--Sobic002G128700 Sobic001G539880--Sobic002G145400 Sobic005G185750--Sobic008G168932 Sobic005G185750--Sobic004G289900 Sobic005G185750--Sobic006G044800 Sobic005G185750--Sobic001G513400 Sobic005G185750--Sobic005G068500 Sobic005G185750--Sobic010G257800 Sobic005G185750--Sobic008G181900 Sobic005G185750--Sobic008G099000 Sobic005G185750--Sobic004G024800 Sobic010G257800--Sobic010G271600 Sobic010G257800--Sobic006G173400 Sobic010G257800--Sobic002G128700 Sobic004G187400 Sobic004G187400 Sobic010G257800--Sobic004G187400 Sobic009G098400 Sobic009G098400 Sobic010G257800--Sobic009G098400 Sobic010G257800--Sobic008G102850 Sobic010G257800--Sobic010G190500 Sobic009G253700 Sobic009G253700 Sobic010G257800--Sobic009G253700 Sobic005G214700 Sobic005G214700 Sobic010G257800--Sobic005G214700 Sobic008G097800--Sobic007G221932 Sobic004G336401 Sobic004G336401 Sobic008G097800--Sobic004G336401 Sobic009G091000 Sobic009G091000 Sobic008G097800--Sobic009G091000 Sobic009G252000 Sobic009G252000 Sobic008G097800--Sobic009G252000 Sobic010G254100 Sobic010G254100 Sobic008G097800--Sobic010G254100 Sobic010G034300 Sobic010G034300 Sobic008G097800--Sobic010G034300 Sobic008G097800--Sobic005G035200 Sobic008G097800--Sobic002G145400 Sobic008G097800--Sobic004G024800
Octagon: transcription factors


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