Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G172000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PT28 , A0A120GUX4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G191400 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G128700 expressed protein -
3 Sobic.010G257800 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
4 Sobic.010G190500 - -
5 Sobic.006G173400 actin-depolymerizing factor, putative, expressed K05765: cofilin
6 Sobic.010G271600 exo70 exocyst complex subunit family protein, putative, expressed -
7 Sobic.005G009700 expressed protein -
8 Sobic.001G539820 - -
9 Sobic.008G102850 - -
10 Sobic.004G080800 EF hand family protein, putative, expressed K13448: calcium-binding protein CML
11 Sobic.007G148233 - -
12 Sobic.005G000200 lipase, putative, expressed -
13 Sobic.001G539880 - -
14 Sobic.002G225800 paramyosin, putative, expressed -
15 Sobic.004G091000 pectate lyase precursor, putative, expressed K01728: pectate lyase
16 Sobic.001G139400 - -
17 Sobic.002G061300 OsFBX239 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.007G103000 FGGY family of carbohydrate kinases, putative, expressed K00864: glpK, glycerol kinase
19 Sobic.005G065300 methyltransferase, putative, expressed -
20 Sobic.003G114800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G172000 Sobic005G172000 Sobic003G191400 Sobic003G191400 Sobic005G172000--Sobic003G191400 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic005G172000--Sobic002G128700 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic005G172000--Sobic010G257800 Sobic010G190500 Sobic010G190500 Sobic005G172000--Sobic010G190500 Sobic006G173400 Sobic006G173400 Sobic005G172000--Sobic006G173400 Sobic010G271600 Sobic010G271600 Sobic005G172000--Sobic010G271600 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic005G172000--Sobic005G009700 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic005G172000--Sobic001G539820 Sobic008G102850 Sobic008G102850 Sobic005G172000--Sobic008G102850 Sobic003G191400--Sobic005G172000 Sobic010G191900 Sobic010G191900 Sobic003G191400--Sobic010G191900 Sobic008G168932 Sobic008G168932 Sobic003G191400--Sobic008G168932 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic003G191400--Sobic004G289900 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic003G191400--Sobic004G024800 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic003G191400--Sobic001G539880 Sobic005G185750 Sobic005G185750 Sobic003G191400--Sobic005G185750 Sobic003G191400--Sobic010G257800 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic003G191400--Sobic008G097800 Sobic002G128700--Sobic001G539820 Sobic002G128700--Sobic005G009700 Sobic005G000200 Sobic005G000200 Sobic002G128700--Sobic005G000200 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic002G128700--Sobic002G225800 Sobic002G128700--Sobic006G173400 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic002G128700--Sobic007G148233 Sobic001G139400 Sobic001G139400 Sobic002G128700--Sobic001G139400 Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic002G128700--Sobic001G364700 Sobic002G128700--Sobic001G539880 Sobic010G257800--Sobic010G271600 Sobic010G257800--Sobic006G173400 Sobic010G257800--Sobic002G128700 Sobic004G187400 Sobic004G187400 Sobic010G257800--Sobic004G187400 Sobic009G098400 Sobic009G098400 Sobic010G257800--Sobic009G098400 Sobic010G257800--Sobic008G102850 Sobic010G257800--Sobic010G190500 Sobic009G253700 Sobic009G253700 Sobic010G257800--Sobic009G253700 Sobic005G214700 Sobic005G214700 Sobic010G257800--Sobic005G214700 Sobic010G190500--Sobic005G214700 Sobic007G222200 Sobic007G222200 Sobic010G190500--Sobic007G222200 Sobic005G122100 Sobic005G122100 Sobic010G190500--Sobic005G122100 Sobic009G090400 Sobic009G090400 Sobic010G190500--Sobic009G090400 Sobic003G009600 Sobic003G009600 Sobic010G190500--Sobic003G009600 Sobic007G103000 Sobic007G103000 Sobic010G190500--Sobic007G103000 Sobic010G190500--Sobic010G271600 Sobic002G417401 Sobic002G417401 Sobic010G190500--Sobic002G417401 Sobic010G190500--Sobic008G102850 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic006G173400--Sobic003G114800 Sobic004G091000 Sobic004G091000 Sobic006G173400--Sobic004G091000 Sobic006G173400--Sobic005G000200 Sobic006G173400--Sobic002G128700 Sobic006G173400--Sobic008G102850 Sobic008G079200 Sobic008G079200 Sobic006G173400--Sobic008G079200 Sobic003G147700 Sobic003G147700 Sobic006G173400--Sobic003G147700 Sobic006G173400--Sobic007G103000 Sobic005G065300 Sobic005G065300 Sobic006G173400--Sobic005G065300 Sobic010G271600--Sobic009G098400 Sobic010G271600--Sobic004G187400 Sobic010G271600--Sobic005G214700 Sobic010G271600--Sobic010G190500 Sobic010G271600--Sobic008G102850 Sobic010G271600--Sobic006G173400 Sobic010G271600--Sobic005G065300 Sobic010G271600--Sobic007G103000 Sobic002G304300 Sobic002G304300 Sobic010G271600--Sobic002G304300 Sobic005G009700--Sobic001G539820 Sobic005G009700--Sobic005G000200 Sobic005G009700--Sobic002G128700 Sobic005G009700--Sobic002G225800 Sobic005G009700--Sobic001G139400 Sobic005G009700--Sobic004G091000 Sobic005G009700--Sobic003G114800 Sobic005G009700--Sobic001G364700 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic005G009700--Sobic004G158100 Sobic001G539820--Sobic005G009700 Sobic001G539820--Sobic005G000200 Sobic001G539820--Sobic002G128700 Sobic001G539820--Sobic001G364700 Sobic001G539820--Sobic002G225800 Sobic001G539820--Sobic004G091000 Sobic001G539820--Sobic001G139400 Sobic001G539820--Sobic004G158100 Sobic001G539820--Sobic007G148233 Sobic008G102850--Sobic007G103000 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic008G102850--Sobic007G134260 Sobic008G102850--Sobic005G214700 Sobic008G102850--Sobic005G122100 Sobic008G102850--Sobic005G065300 Sobic008G102850--Sobic003G147700 Sobic008G102850--Sobic004G091000 Sobic008G102850--Sobic003G114800 Sobic003G232100 Sobic003G232100 Sobic008G102850--Sobic003G232100
Octagon: transcription factors


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