Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G218100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q4N7
Pfam -
Panther DB PTHR34189 PTHR34189:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028694
Brachypodium KQK08686
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G304600 alpha-1,4-glucan-protein synthase, putative, expressed K13379: RGP, reversibly glycosylated polypeptide / UDP-arabinopyranose mutase
2 Sobic.003G394801 - -
3 Sobic.010G162700 reticuline oxidase-like protein precursor, putative, expressed -
4 Sobic.009G169500 DEFL4 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
5 Sobic.001G306200 expansin precursor, putative, expressed -
6 Sobic.006G236300 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@pectinesterase, putative, expressed -
7 Sobic.009G016900 expressed protein -
8 Sobic.005G204500 uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed -
9 Sobic.004G217200 Lung seven transmembrane receptor domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.005G110120 - -
11 Sobic.005G142400 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
12 Sobic.006G195000 purine permease, putative, expressed -
13 Sobic.008G154300 flavin monooxygenase, putative, expressed -
14 Sobic.005G009500 expressed protein -
15 Sobic.009G091300 - -
16 Sobic.006G142200 Lung seven transmembrane receptor domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.007G112400 polygalacturonase, putative, expressed -
18 Sobic.002G414150 - -
19 Sobic.001G269800 - -
20 Sobic.005G006300 TMS membrane protein/tumour differentially expressed protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G218100 Sobic003G218100 Sobic003G304600 Sobic003G304600 Sobic003G218100--Sobic003G304600 Sobic003G394801 Sobic003G394801 Sobic003G218100--Sobic003G394801 Sobic010G162700 Sobic010G162700 Sobic003G218100--Sobic010G162700 Sobic009G169500 Sobic009G169500 Sobic003G218100--Sobic009G169500 Sobic001G306200 Sobic001G306200 Sobic003G218100--Sobic001G306200 Sobic006G236300 Sobic006G236300 Sobic003G218100--Sobic006G236300 Sobic009G016900 Sobic009G016900 Sobic003G218100--Sobic009G016900 Sobic005G204500 Sobic005G204500 Sobic003G218100--Sobic005G204500 Sobic004G217200 Sobic004G217200 Sobic003G218100--Sobic004G217200 Sobic001G306400 Sobic001G306400 Sobic003G304600--Sobic001G306400 Sobic008G176500 Sobic008G176500 Sobic003G304600--Sobic008G176500 Sobic008G154300 Sobic008G154300 Sobic003G304600--Sobic008G154300 Sobic005G142400 Sobic005G142400 Sobic003G304600--Sobic005G142400 Sobic010G091800 Sobic010G091800 Sobic003G304600--Sobic010G091800 Sobic008G017500 Sobic008G017500 Sobic003G304600--Sobic008G017500 Sobic003G246500 Sobic003G246500 Sobic003G304600--Sobic003G246500 Sobic002G053800 Sobic002G053800 Sobic003G304600--Sobic002G053800 Sobic001G269800 Sobic001G269800 Sobic003G304600--Sobic001G269800 Sobic003G394801--Sobic001G306200 Sobic003G394801--Sobic009G169500 Sobic005G006300 Sobic005G006300 Sobic003G394801--Sobic005G006300 Sobic003G394801--Sobic008G154300 Sobic003G394801--Sobic005G204500 Sobic003G394801--Sobic005G142400 Sobic002G414150 Sobic002G414150 Sobic003G394801--Sobic002G414150 Sobic003G394801--Sobic010G091800 Sobic006G142200 Sobic006G142200 Sobic003G394801--Sobic006G142200 Sobic010G162700--Sobic006G236300 Sobic006G195000 Sobic006G195000 Sobic010G162700--Sobic006G195000 Sobic007G112400 Sobic007G112400 Sobic010G162700--Sobic007G112400 Sobic010G162700--Sobic009G169500 Sobic010G162700--Sobic001G306200 Sobic010G162700--Sobic005G204500 Sobic010G162700--Sobic005G142400 Sobic005G110120 Sobic005G110120 Sobic010G162700--Sobic005G110120 Sobic010G162700--Sobic008G154300 Sobic009G169500--Sobic001G306200 Sobic009G169500--Sobic003G394801 Sobic009G169500--Sobic005G204500 Sobic009G169500--Sobic005G110120 Sobic009G169500--Sobic005G142400 Sobic009G169500--Sobic008G154300 Sobic009G169500--Sobic010G162700 Sobic009G169500--Sobic006G195000 Sobic009G169500--Sobic005G006300 Sobic001G306200--Sobic009G169500 Sobic001G306200--Sobic003G394801 Sobic001G306200--Sobic005G142400 Sobic001G306200--Sobic008G154300 Sobic001G306200--Sobic005G204500 Sobic009G091300 Sobic009G091300 Sobic001G306200--Sobic009G091300 Sobic001G306200--Sobic010G162700 Sobic001G306200--Sobic005G110120 Sobic001G306200--Sobic005G006300 Sobic006G236300--Sobic010G162700 Sobic006G236300--Sobic007G112400 Sobic006G236300--Sobic006G195000 Sobic006G236300--Sobic009G169500 Sobic006G236300--Sobic005G142400 Sobic006G236300--Sobic001G306200 Sobic006G236300--Sobic005G110120 Sobic006G236300--Sobic005G204500 Sobic006G236300--Sobic008G154300 Sobic009G016900--Sobic004G217200 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic009G016900--Sobic001G409000 Sobic007G001800 Sobic007G001800 Sobic009G016900--Sobic007G001800 Sobic009G016900--Sobic003G394801 Sobic009G016900--Sobic005G204500 Sobic009G016900--Sobic006G142200 Sobic009G016900--Sobic005G006300 Sobic009G016900--Sobic006G195000 Sobic004G049300 Sobic004G049300 Sobic009G016900--Sobic004G049300 Sobic005G204500--Sobic006G142200 Sobic005G204500--Sobic005G006300 Sobic005G204500--Sobic009G169500 Sobic005G204500--Sobic006G195000 Sobic005G204500--Sobic001G306200 Sobic005G204500--Sobic003G394801 Sobic005G009500 Sobic005G009500 Sobic005G204500--Sobic005G009500 Sobic005G204500--Sobic005G110120 Sobic005G204500--Sobic010G162700 Sobic004G217200--Sobic005G006300 Sobic004G217200--Sobic002G414150 Sobic004G217200--Sobic006G142200 Sobic004G217200--Sobic003G394801 Sobic001G269400 Sobic001G269400 Sobic004G217200--Sobic001G269400 Sobic004G217200--Sobic005G009500 Sobic004G217200--Sobic005G204500 Sobic001G269600 Sobic001G269600 Sobic004G217200--Sobic001G269600 Sobic001G269700 Sobic001G269700 Sobic004G217200--Sobic001G269700
Octagon: transcription factors


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