Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G266300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q5H4
Pfam PF08137
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK09309
Barley -
Wheat -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G337100 nucleoside transporter, putative, expressed K15014: SLC29A1_2_3, solute carrier family 29 (equilibrative nucleoside transporter), member 1/2/3
2 Sobic.007G135100 - -
3 Sobic.005G046801 - -
4 Sobic.007G154100 aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed -
5 Sobic.004G228600 - -
6 Sobic.010G152500 glycosyltransferase, putative, expressed -
7 Sobic.010G268700 expansin precursor, putative, expressed -
8 Sobic.006G097900 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
9 Sobic.004G002901 - K02940: RP-L9e, large subunit ribosomal protein L9e
10 Sobic.003G255600 expressed protein -
11 Sobic.002G146000 "Localized in cytoplasm, involved in the process of drought defense"(PubMedID : 27231650)@dehydrogenase, putative, expressed K09753: cinnamoyl-CoA reductase
12 Sobic.005G206000 dirigent, putative, expressed -
13 Sobic.007G111800 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -
14 Sobic.001G343766 - -
15 Sobic.002G391900 peroxidase precursor, putative, expressed -
16 Sobic.006G209000 Protein transferase (Os)(PubMedID : 27208977)@transferase family domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G181600 dehydrogenase/reductase, putative, expressed -
18 Sobic.004G009200 transporter, major facilitator family, putative, expressed K02575: NRT, narK, nrtP, MFS transporter, NNP family, nitrate/nitrite transporter
19 Sobic.005G069500 OsWAK92 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
20 Sobic.005G197500 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G266300 Sobic003G266300 Sobic002G337100 Sobic002G337100 Sobic003G266300--Sobic002G337100 Sobic007G135100 Sobic007G135100 Sobic003G266300--Sobic007G135100 Sobic005G046801 Sobic005G046801 Sobic003G266300--Sobic005G046801 Sobic007G154100 Sobic007G154100 Sobic003G266300--Sobic007G154100 Sobic004G228600 Sobic004G228600 Sobic003G266300--Sobic004G228600 Sobic010G152500 Sobic010G152500 Sobic003G266300--Sobic010G152500 Sobic010G268700 Sobic010G268700 Sobic003G266300--Sobic010G268700 Sobic006G097900 Sobic006G097900 Sobic003G266300--Sobic006G097900 Sobic004G002901 Sobic004G002901 Sobic003G266300--Sobic004G002901 Sobic002G337100--Sobic003G266300 Sobic002G337100--Sobic005G046801 Sobic001G343766 Sobic001G343766 Sobic002G337100--Sobic001G343766 Sobic005G067300 Sobic005G067300 Sobic002G337100--Sobic005G067300 Sobic009G071300 Sobic009G071300 Sobic002G337100--Sobic009G071300 Sobic002G337100--Sobic007G135100 Sobic006G209000 Sobic006G209000 Sobic002G337100--Sobic006G209000 Sobic010G115600 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Sobic003G443700 Sobic004G002901--Sobic003G443700
Octagon: transcription factors


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