Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G303200.1
Synonym Sb03g035210, ROPGEF8, ATROPGEF8
Functional annotation ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed
UniProt A0A1W0VZN6
Pfam PF03759
Panther DB PTHR33101 PTHR33101:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005089; Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G13240 : RHO guanyl-nucleotide exchange factor 9
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g55520.1 : ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036591 , Zm00025a027489 , Zm00025a028071 , Zm00025a039980
Brachypodium KQK09839 , KQJ94354 , PNT61636 , PNT72892 , PNT72893
Barley HORVU3Hr1G073200.10 , HORVU3Hr1G073200.1 , HORVU3Hr1G073200.3 , HORVU3Hr1G073200.2 , HORVU3Hr1G073200.5 , HORVU3Hr1G073200.4 , HORVU3Hr1G073200.7 , HORVU3Hr1G073200.6 , HORVU3Hr1G073200.9 , HORVU3Hr1G073200.8
Wheat TraesCS3A02G305500 , TraesCS3A02G305500 , TraesCS2A02G408100 , TraesCS3D02G296400 , TraesCS3A02G270400 , TraesCS3A02G270400 , TraesCS2D02G405400 , TraesCS3B02G331000 , TraesCS2B02G426300
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G434100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G303200 Sobic003G303200 Sobic005G067200 Sobic005G067200 Sobic003G303200--Sobic005G067200 Sobic004G289100 Sobic004G289100 Sobic003G303200--Sobic004G289100 Sobic001G444900 Sobic001G444900 Sobic003G303200--Sobic001G444900 Sobic004G281500 Sobic004G281500 Sobic003G303200--Sobic004G281500 Sobic002G284500 Sobic002G284500 Sobic003G303200--Sobic002G284500 Sobic007G136000 Sobic007G136000 Sobic003G303200--Sobic007G136000 Sobic009G030001 Sobic009G030001 Sobic003G303200--Sobic009G030001 Sobic010G279600 Sobic010G279600 Sobic003G303200--Sobic010G279600 Sobic001G121800 Sobic001G121800 Sobic003G303200--Sobic001G121800 Sobic003G403000 Sobic003G403000 Sobic005G067200--Sobic003G403000 Sobic005G067200--Sobic007G136000 Sobic002G068701 Sobic002G068701 Sobic005G067200--Sobic002G068701 Sobic009G044200 Sobic009G044200 Sobic005G067200--Sobic009G044200 Sobic004G218200 Sobic004G218200 Sobic005G067200--Sobic004G218200 Sobic005G067200--Sobic004G281500 Sobic001G407300 Sobic001G407300 Sobic005G067200--Sobic001G407300 Sobic005G067200--Sobic010G279600 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic005G067200--Sobic004G200100 Sobic001G152800 Sobic001G152800 Sobic004G289100--Sobic001G152800 Sobic007G166500 Sobic007G166500 Sobic004G289100--Sobic007G166500 Sobic003G434100 Sobic003G434100 Sobic004G289100--Sobic003G434100 Sobic002G029000 Sobic002G029000 Sobic004G289100--Sobic002G029000 Sobic004G289100--Sobic004G281500 Sobic001G445400 Sobic001G445400 Sobic004G289100--Sobic001G445400 Sobic004G008500 Sobic004G008500 Sobic004G289100--Sobic004G008500 Sobic009G072600 Sobic009G072600 Sobic004G289100--Sobic009G072600 Sobic004G289100--Sobic010G279600 Sobic001G444900--Sobic001G121800 Sobic001G405100 Sobic001G405100 Sobic001G444900--Sobic001G405100 Sobic005G209600 Sobic005G209600 Sobic001G444900--Sobic005G209600 Sobic003G236000 Sobic003G236000 Sobic001G444900--Sobic003G236000 Sobic004G336800 Sobic004G336800 Sobic001G444900--Sobic004G336800 Sobic001G024250 Sobic001G024250 Sobic001G444900--Sobic001G024250 Sobic009G096433 Sobic009G096433 Sobic001G444900--Sobic009G096433 Sobic003G356800 Sobic003G356800 Sobic001G444900--Sobic003G356800 Sobic007G146300 Sobic007G146300 Sobic001G444900--Sobic007G146300 Sobic004G281500--Sobic004G289100 Sobic004G281500--Sobic009G072600 Sobic004G281500--Sobic007G166500 Sobic004G281500--Sobic001G152800 Sobic004G281500--Sobic003G434100 Sobic004G281500--Sobic002G029000 Sobic004G281500--Sobic010G279600 Sobic005G199800 Sobic005G199800 Sobic004G281500--Sobic005G199800 Sobic002G323200 Sobic002G323200 Sobic004G281500--Sobic002G323200 Sobic001G160900 Sobic001G160900 Sobic002G284500--Sobic001G160900 Sobic005G098100 Sobic005G098100 Sobic002G284500--Sobic005G098100 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic002G284500--Sobic008G131300 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic002G284500--Sobic002G102600 Sobic002G160200 Sobic002G160200 Sobic002G284500--Sobic002G160200 Sobic002G083100 Sobic002G083100 Sobic002G284500--Sobic002G083100 Sobic007G204800 Sobic007G204800 Sobic002G284500--Sobic007G204800 Sobic005G001200 Sobic005G001200 Sobic002G284500--Sobic005G001200 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic002G284500--Sobic003G400700 Sobic009G170900 Sobic009G170900 Sobic007G136000--Sobic009G170900 Sobic005G160801 Sobic005G160801 Sobic007G136000--Sobic005G160801 Sobic007G136000--Sobic004G200100 Sobic007G136000--Sobic005G067200 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic007G136000--Sobic003G078000 Sobic006G189600 Sobic006G189600 Sobic007G136000--Sobic006G189600 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic007G136000--Sobic003G406060 Sobic005G198600 Sobic005G198600 Sobic007G136000--Sobic005G198600 Sobic003G394000 Sobic003G394000 Sobic007G136000--Sobic003G394000 Sobic009G030001--Sobic004G289100 Sobic009G030001--Sobic004G281500 Sobic009G030001--Sobic009G072600 Sobic009G030001--Sobic005G199800 Sobic009G030001--Sobic003G434100 Sobic009G030001--Sobic007G166500 Sobic009G030001--Sobic002G029000 Sobic009G030001--Sobic002G323200 Sobic009G030001--Sobic001G152800 Sobic010G279600--Sobic004G008500 Sobic010G063700 Sobic010G063700 Sobic010G279600--Sobic010G063700 Sobic010G279600--Sobic001G152800 Sobic010G261900 Sobic010G261900 Sobic010G279600--Sobic010G261900 Sobic010G279600--Sobic007G166500 Sobic010G016100 Sobic010G016100 Sobic010G279600--Sobic010G016100 Sobic010G279600--Sobic001G445400 Sobic010G279600--Sobic002G029000 Sobic010G279600--Sobic004G289100 Sobic005G023600 Sobic005G023600 Sobic001G121800--Sobic005G023600 Sobic001G121800--Sobic007G146300 Sobic004G080000 Sobic004G080000 Sobic001G121800--Sobic004G080000 Sobic001G121800--Sobic001G445400 Sobic010G276200 Sobic010G276200 Sobic001G121800--Sobic010G276200 Sobic001G121800--Sobic001G024250 Sobic006G193700 Sobic006G193700 Sobic001G121800--Sobic006G193700 Sobic004G041800 Sobic004G041800 Sobic001G121800--Sobic004G041800 Sobic001G121800--Sobic002G029000
Octagon: transcription factors


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