Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G339800.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W078
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g39860.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027036
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G025000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@receptor like protein kinase, putative, expressed -
2 Sobic.009G111800 OsFBO5 - F-box and other domain containing protein, expressed -
3 Sobic.003G097701 - -
4 Sobic.007G149750 - -
5 Sobic.005G166900 cytochrome P450 71D10, putative, expressed -
6 Sobic.006G121600 cytochrome P450, putative, expressed -
7 Sobic.007G141300 - -
8 Sobic.010G107901 - K13104: ZNF830, zinc finger protein 830
9 Sobic.003G172450 - -
10 Sobic.004G234766 - -
11 Sobic.002G397700 - -
12 Sobic.006G093550 - -
13 Sobic.002G322101 - -
14 Sobic.003G337200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat-containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G321700 dehydration response related protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G421600 - -
17 Sobic.003G325000 expressed protein -
18 Sobic.001G249900 - -
19 Sobic.007G123700 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
20 Sobic.010G133225 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G339800 Sobic003G339800 Sobic002G025000 Sobic002G025000 Sobic003G339800--Sobic002G025000 Sobic009G111800 Sobic009G111800 Sobic003G339800--Sobic009G111800 Sobic003G097701 Sobic003G097701 Sobic003G339800--Sobic003G097701 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic003G339800--Sobic007G149750 Sobic005G166900 Sobic005G166900 Sobic003G339800--Sobic005G166900 Sobic006G121600 Sobic006G121600 Sobic003G339800--Sobic006G121600 Sobic007G141300 Sobic007G141300 Sobic003G339800--Sobic007G141300 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic003G339800--Sobic010G107901 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic003G339800--Sobic003G172450 Sobic002G025000--Sobic007G149750 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic002G025000--Sobic002G322101 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic002G025000--Sobic004G234766 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic002G025000--Sobic010G173600 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic002G025000--Sobic006G093550 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic002G025000--Sobic003G169400 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic002G025000--Sobic001G249900 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic002G025000--Sobic006G147350 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic002G025000--Sobic003G255850 Sobic009G111800--Sobic002G025000 Sobic004G109100 Sobic004G109100 Sobic009G111800--Sobic004G109100 Sobic004G106200 Sobic004G106200 Sobic009G111800--Sobic004G106200 Sobic001G321700 Sobic001G321700 Sobic009G111800--Sobic001G321700 Sobic005G008101 Sobic005G008101 Sobic009G111800--Sobic005G008101 Sobic009G111800--Sobic007G149750 Sobic010G091100 Sobic010G091100 Sobic009G111800--Sobic010G091100 Sobic003G325000 Sobic003G325000 Sobic009G111800--Sobic003G325000 Sobic004G138400 Sobic004G138400 Sobic009G111800--Sobic004G138400 Sobic003G097701--Sobic005G166900 Sobic005G167100 Sobic005G167100 Sobic003G097701--Sobic005G167100 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic003G097701--Sobic001G054050 Sobic010G107601 Sobic010G107601 Sobic003G097701--Sobic010G107601 Sobic003G097701--Sobic002G025000 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic003G097701--Sobic003G172400 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic003G097701--Sobic010G225400 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic003G097701--Sobic008G140050 Sobic007G141650 Sobic007G141650 Sobic003G097701--Sobic007G141650 Sobic007G149750--Sobic002G322101 Sobic007G149750--Sobic010G173600 Sobic007G149750--Sobic006G147350 Sobic007G149750--Sobic006G093550 Sobic007G149750--Sobic003G255850 Sobic007G149750--Sobic001G249900 Sobic007G149750--Sobic004G234766 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic007G149750--Sobic005G093600 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic007G149750--Sobic003G128575 Sobic005G166900--Sobic003G097701 Sobic005G166900--Sobic010G225400 Sobic005G166900--Sobic007G141650 Sobic005G166900--Sobic005G167100 Sobic005G166900--Sobic010G107601 Sobic010G201266 Sobic010G201266 Sobic005G166900--Sobic010G201266 Sobic005G166900--Sobic001G054050 Sobic002G278100 Sobic002G278100 Sobic005G166900--Sobic002G278100 Sobic005G166900--Sobic003G172400 Sobic002G394433 Sobic002G394433 Sobic006G121600--Sobic002G394433 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic006G121600--Sobic001G365332 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic006G121600--Sobic003G168350 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic006G121600--Sobic006G020350 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic006G121600--Sobic005G183450 Sobic006G121600--Sobic003G128575 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic006G121600--Sobic008G157700 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic006G121600--Sobic009G069450 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic006G121600--Sobic006G017266 Sobic007G028200 Sobic007G028200 Sobic007G141300--Sobic007G028200 Sobic007G141300--Sobic003G097701 Sobic007G141300--Sobic005G166900 Sobic007G141300--Sobic002G025000 Sobic007G141300--Sobic007G141650 Sobic007G141300--Sobic010G225400 Sobic001G011600 Sobic001G011600 Sobic007G141300--Sobic001G011600 Sobic005G096450 Sobic005G096450 Sobic007G141300--Sobic005G096450 Sobic007G141300--Sobic010G107901 Sobic002G397700 Sobic002G397700 Sobic010G107901--Sobic002G397700 Sobic010G107901--Sobic004G234766 Sobic010G107901--Sobic003G172450 Sobic010G107901--Sobic006G093550 Sobic010G107901--Sobic002G322101 Sobic010G133225 Sobic010G133225 Sobic010G107901--Sobic010G133225 Sobic008G024900 Sobic008G024900 Sobic010G107901--Sobic008G024900 Sobic003G337200 Sobic003G337200 Sobic010G107901--Sobic003G337200 Sobic010G107901--Sobic001G249900 Sobic003G172450--Sobic010G107901 Sobic006G139200 Sobic006G139200 Sobic003G172450--Sobic006G139200 Sobic003G172450--Sobic002G397700 Sobic002G040550 Sobic002G040550 Sobic003G172450--Sobic002G040550 Sobic003G172450--Sobic004G234766 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic003G172450--Sobic002G390200 Sobic003G172450--Sobic006G093550 Sobic003G172450--Sobic008G024900 Sobic003G172450--Sobic010G225400
Octagon: transcription factors


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