Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G005300.3,Sobic.004G005300.5,Sobic.004G005300.2,Sobic.004G005300.4
Synonym Sb04g000660
Functional annotation serine/threonine-protein kinase At1g18390 precursor, putative, expressed
UniProt C5XRK7
Pfam PF07714
Panther DB PTHR27003 PTHR27003:SF35
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G33260 : Protein kinase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g01730.1 : serine/threonine-protein kinase At1g18390 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018654
Brachypodium KQJ92833
Barley HORVU6Hr1G004270.4 , HORVU6Hr1G004270.3 , HORVU6Hr1G004270.2 , HORVU6Hr1G004270.1
Wheat TraesCS6A02G024700 , TraesCS6D02G028100 , TraesCS6B02G033600
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G005300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G118700 -(PubMedID : 28944535)@CESA3 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
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20 Sobic.001G183600 galactosyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G005300 Sobic004G005300 Sobic002G118700 Sobic002G118700 Sobic004G005300--Sobic002G118700 Sobic009G063400 Sobic009G063400 Sobic004G005300--Sobic009G063400 Sobic009G026101 Sobic009G026101 Sobic004G005300--Sobic009G026101 Sobic002G082300 Sobic002G082300 Sobic004G005300--Sobic002G082300 Sobic001G072600 Sobic001G072600 Sobic004G005300--Sobic001G072600 Sobic001G534532 Sobic001G534532 Sobic004G005300--Sobic001G534532 Sobic004G051300 Sobic004G051300 Sobic004G005300--Sobic004G051300 Sobic006G162000 Sobic006G162000 Sobic004G005300--Sobic006G162000 Sobic009G125900 Sobic009G125900 Sobic004G005300--Sobic009G125900 Sobic002G118700--Sobic009G063400 Sobic002G118700--Sobic009G125900 Sobic002G075500 Sobic002G075500 Sobic002G118700--Sobic002G075500 Sobic001G099100 Sobic001G099100 Sobic002G118700--Sobic001G099100 Sobic002G118700--Sobic004G051300 Sobic002G118700--Sobic009G026101 Sobic010G090500 Sobic010G090500 Sobic002G118700--Sobic010G090500 Sobic007G180900 Sobic007G180900 Sobic002G118700--Sobic007G180900 Sobic002G276600 Sobic002G276600 Sobic002G118700--Sobic002G276600 Sobic009G063400--Sobic009G125900 Sobic009G063400--Sobic002G075500 Sobic009G063400--Sobic009G026101 Sobic009G063400--Sobic002G118700 Sobic010G096100 Sobic010G096100 Sobic009G063400--Sobic010G096100 Sobic001G334900 Sobic001G334900 Sobic009G063400--Sobic001G334900 Sobic009G063400--Sobic010G090500 Sobic001G208600 Sobic001G208600 Sobic009G063400--Sobic001G208600 Sobic006G075000 Sobic006G075000 Sobic009G063400--Sobic006G075000 Sobic001G133900 Sobic001G133900 Sobic009G026101--Sobic001G133900 Sobic009G026101--Sobic009G063400 Sobic009G026101--Sobic009G125900 Sobic009G246700 Sobic009G246700 Sobic009G026101--Sobic009G246700 Sobic009G206500 Sobic009G206500 Sobic009G026101--Sobic009G206500 Sobic009G026101--Sobic002G075500 Sobic009G026101--Sobic006G075000 Sobic003G254700 Sobic003G254700 Sobic009G026101--Sobic003G254700 Sobic009G026101--Sobic010G096100 Sobic001G336700 Sobic001G336700 Sobic002G082300--Sobic001G336700 Sobic003G220000 Sobic003G220000 Sobic002G082300--Sobic003G220000 Sobic006G226200 Sobic006G226200 Sobic002G082300--Sobic006G226200 Sobic002G082300--Sobic003G254700 Sobic002G082300--Sobic009G246700 Sobic003G112200 Sobic003G112200 Sobic002G082300--Sobic003G112200 Sobic002G082300--Sobic002G118700 Sobic002G164600 Sobic002G164600 Sobic002G082300--Sobic002G164600 Sobic010G232500 Sobic010G232500 Sobic002G082300--Sobic010G232500 Sobic002G167600 Sobic002G167600 Sobic001G072600--Sobic002G167600 Sobic002G218900 Sobic002G218900 Sobic001G072600--Sobic002G218900 Sobic007G119500 Sobic007G119500 Sobic001G072600--Sobic007G119500 Sobic001G360700 Sobic001G360700 Sobic001G072600--Sobic001G360700 Sobic004G047600 Sobic004G047600 Sobic001G072600--Sobic004G047600 Sobic006G144600 Sobic006G144600 Sobic001G072600--Sobic006G144600 Sobic001G072600--Sobic009G246700 Sobic007G047300 Sobic007G047300 Sobic001G072600--Sobic007G047300 Sobic009G170500 Sobic009G170500 Sobic001G072600--Sobic009G170500 Sobic003G386200 Sobic003G386200 Sobic001G534532--Sobic003G386200 Sobic002G072200 Sobic002G072200 Sobic001G534532--Sobic002G072200 Sobic009G226900 Sobic009G226900 Sobic001G534532--Sobic009G226900 Sobic003G062000 Sobic003G062000 Sobic001G534532--Sobic003G062000 Sobic009G032600 Sobic009G032600 Sobic001G534532--Sobic009G032600 Sobic003G427900 Sobic003G427900 Sobic001G534532--Sobic003G427900 Sobic004G344200 Sobic004G344200 Sobic001G534532--Sobic004G344200 Sobic009G162500 Sobic009G162500 Sobic001G534532--Sobic009G162500 Sobic006G001000 Sobic006G001000 Sobic001G534532--Sobic006G001000 Sobic004G051300--Sobic001G099100 Sobic004G051300--Sobic002G118700 Sobic004G051300--Sobic009G125900 Sobic004G051300--Sobic002G075500 Sobic004G051300--Sobic009G026101 Sobic004G051300--Sobic002G276600 Sobic009G079100 Sobic009G079100 Sobic004G051300--Sobic009G079100 Sobic004G051300--Sobic010G090500 Sobic004G051300--Sobic009G063400 Sobic006G162000--Sobic002G276600 Sobic002G374400 Sobic002G374400 Sobic006G162000--Sobic002G374400 Sobic009G061000 Sobic009G061000 Sobic006G162000--Sobic009G061000 Sobic006G267500 Sobic006G267500 Sobic006G162000--Sobic006G267500 Sobic001G437500 Sobic001G437500 Sobic006G162000--Sobic001G437500 Sobic006G162000--Sobic009G026101 Sobic010G199700 Sobic010G199700 Sobic006G162000--Sobic010G199700 Sobic008G174900 Sobic008G174900 Sobic006G162000--Sobic008G174900 Sobic006G162000--Sobic010G090500 Sobic009G125900--Sobic009G063400 Sobic009G125900--Sobic009G026101 Sobic009G125900--Sobic002G075500 Sobic009G125900--Sobic002G118700 Sobic009G125900--Sobic010G090500 Sobic004G265600 Sobic004G265600 Sobic009G125900--Sobic004G265600 Sobic009G125900--Sobic010G096100 Sobic009G125900--Sobic004G051300 Sobic009G125900--Sobic003G254700
Octagon: transcription factors


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