Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G023600.1
Synonym Sb04g002096
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RKS3
Pfam PF07893
Panther DB PTHR33085 PTHR33085:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g32920.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G397550 - -
2 Sobic.004G199100 - -
3 Sobic.006G261650 - -
4 Sobic.003G169700 - -
5 Sobic.003G327950 - -
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9 Sobic.003G163000 - -
10 Sobic.005G154600 - -
11 Sobic.001G175200 expressed protein -
12 Sobic.004G332200 - -
13 Sobic.004G061100 - -
14 Sobic.001G137900 cytochrome P450, putative, expressed -
15 Sobic.001G413300 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
16 Sobic.002G109700 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
17 Sobic.004G224733 - -
18 Sobic.002G121201 - -
19 Sobic.005G019250 - -
20 Sobic.003G143600 pectinesterase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G023600 Sobic004G023600 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic004G023600--Sobic001G397550 Sobic004G199100 Sobic004G199100 Sobic004G023600--Sobic004G199100 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic004G023600--Sobic006G261650 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic004G023600--Sobic003G169700 Sobic003G327950 Sobic003G327950 Sobic004G023600--Sobic003G327950 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic004G023600--Sobic007G028300 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic004G023600--Sobic002G033550 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic004G023600--Sobic004G303900 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic004G023600--Sobic003G163000 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic001G397550--Sobic004G224733 Sobic001G397550--Sobic007G028300 Sobic001G397550--Sobic003G327950 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic001G397550--Sobic004G078200 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic001G397550--Sobic004G332200 Sobic001G397550--Sobic004G303900 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic001G397550--Sobic006G100150 Sobic001G397550--Sobic003G163000 Sobic001G397550--Sobic004G199100 Sobic003G143600 Sobic003G143600 Sobic004G199100--Sobic003G143600 Sobic001G137900 Sobic001G137900 Sobic004G199100--Sobic001G137900 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic004G199100--Sobic005G166200 Sobic008G123700 Sobic008G123700 Sobic004G199100--Sobic008G123700 Sobic004G252250 Sobic004G252250 Sobic004G199100--Sobic004G252250 Sobic004G199100--Sobic001G397550 Sobic004G199100--Sobic002G033550 Sobic004G199100--Sobic003G327950 Sobic004G199100--Sobic007G028300 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic006G261650--Sobic005G154600 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic006G261650--Sobic004G276600 Sobic002G337400 Sobic002G337400 Sobic006G261650--Sobic002G337400 Sobic006G261650--Sobic003G169700 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic006G261650--Sobic002G154450 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic006G261650--Sobic007G190600 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic006G261650--Sobic001G420150 Sobic007G085400 Sobic007G085400 Sobic006G261650--Sobic007G085400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic006G261650--Sobic007G127200 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic003G169700--Sobic001G093400 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic003G169700--Sobic009G260550 Sobic003G169700--Sobic001G420150 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic003G169700--Sobic007G116300 Sobic003G169700--Sobic004G303900 Sobic003G169700--Sobic006G100150 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic003G169700--Sobic003G208200 Sobic003G169700--Sobic004G276600 Sobic003G169700--Sobic007G085400 Sobic003G327950--Sobic001G397550 Sobic003G327950--Sobic004G224733 Sobic003G327950--Sobic007G028300 Sobic003G327950--Sobic003G163000 Sobic003G327950--Sobic004G332200 Sobic003G327950--Sobic004G199100 Sobic010G203400 Sobic010G203400 Sobic003G327950--Sobic010G203400 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic003G327950--Sobic005G045250 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic003G327950--Sobic006G219400 Sobic007G028300--Sobic004G078200 Sobic007G028300--Sobic006G100150 Sobic007G028300--Sobic004G303900 Sobic007G028300--Sobic001G397550 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic007G028300--Sobic006G206600 Sobic002G088300 Sobic002G088300 Sobic007G028300--Sobic002G088300 Sobic007G028300--Sobic004G224733 Sobic007G028300--Sobic003G169700 Sobic007G028300--Sobic006G219400 Sobic002G033550--Sobic001G137900 Sobic001G413300 Sobic001G413300 Sobic002G033550--Sobic001G413300 Sobic002G033550--Sobic004G199100 Sobic006G279600 Sobic006G279600 Sobic002G033550--Sobic006G279600 Sobic002G033550--Sobic003G143600 Sobic002G033550--Sobic003G169700 Sobic002G033550--Sobic003G208200 Sobic009G106601 Sobic009G106601 Sobic002G033550--Sobic009G106601 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic002G033550--Sobic005G019250 Sobic004G303900--Sobic006G100150 Sobic004G303900--Sobic007G028300 Sobic004G303900--Sobic004G078200 Sobic004G303900--Sobic009G260550 Sobic004G303900--Sobic003G169700 Sobic004G252600 Sobic004G252600 Sobic004G303900--Sobic004G252600 Sobic004G303900--Sobic003G163000 Sobic004G303900--Sobic006G206600 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic004G303900--Sobic004G207800 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic003G163000--Sobic001G202450 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic003G163000--Sobic002G214000 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic003G163000--Sobic001G373850 Sobic003G163000--Sobic003G169700 Sobic003G163000--Sobic004G332200 Sobic001G422432 Sobic001G422432 Sobic003G163000--Sobic001G422432 Sobic003G163000--Sobic005G045250 Sobic003G163000--Sobic004G276600 Sobic003G163000--Sobic004G303900
Octagon: transcription factors


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