Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G065800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YN20
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G194100 DEFL6 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
2 Sobic.004G071050 - -
3 Sobic.004G339900 expressed protein -
4 Sobic.003G062101 - -
5 Sobic.009G033500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
6 Sobic.002G420400 - -
7 Sobic.007G041200 cytochrome P450, putative, expressed -
8 Sobic.001G485200 AP2 domain containing protein, expressed K09285: OVM, AP2-like factor, ANT lineage
9 Sobic.010G106601 - K09422: transcription factor MYB, plant
10 Sobic.007G091200 wax synthase isoform 1, putative, expressed -
11 Sobic.004G262100 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, putative, expressed K00021: hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (NADPH)
12 Sobic.001G425900 EDM2, putative, expressed -
13 Sobic.010G152000 powdery mildew resistant protein 5, putative, expressed -
14 Sobic.002G104300 FAS1, putative, expressed K10750: chromatin assembly factor 1 subunit A
15 Sobic.009G253800 aspartic proteinase, putative, expressed -
16 Sobic.001G088600 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.004G163700 "1,4-alpha-glucan-branching enzyme 2"(PubMedID : 26186930)@"1,4-alpha-glucan branching enzyme IIB (Zm)"(PubMedID : 27208977)@Starch synthesis(PubMedID : 31624872)@"SbeIIb(Ortholog in maize:Jiang et al., 2013)"(PubMedID : 31659883)@1,4-alpha-glucan-branching enzyme, chloroplast precursor, putative, expressed K00700: GBE1, 1,4-alpha-glucan branching enzyme
18 Sobic.003G214650 - -
19 Sobic.008G116100 bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase,chloroplast precursor, putative, expressed K13832: aroDE, 3-dehydroquinate dehydratase / shikimate dehydrogenase
20 Sobic.003G042200 uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G065800 Sobic004G065800 Sobic001G194100 Sobic001G194100 Sobic004G065800--Sobic001G194100 Sobic004G071050 Sobic004G071050 Sobic004G065800--Sobic004G071050 Sobic004G339900 Sobic004G339900 Sobic004G065800--Sobic004G339900 Sobic003G062101 Sobic003G062101 Sobic004G065800--Sobic003G062101 Sobic009G033500 Sobic009G033500 Sobic004G065800--Sobic009G033500 Sobic002G420400 Sobic002G420400 Sobic004G065800--Sobic002G420400 Sobic007G041200 Sobic007G041200 Sobic004G065800--Sobic007G041200 Sobic001G485200 Sobic001G485200 Sobic004G065800--Sobic001G485200 Sobic010G106601 Sobic010G106601 Sobic004G065800--Sobic010G106601 Sobic001G194100--Sobic003G062101 Sobic004G163700 Sobic004G163700 Sobic001G194100--Sobic004G163700 Sobic003G042200 Sobic003G042200 Sobic001G194100--Sobic003G042200 Sobic001G194100--Sobic004G065800 Sobic008G174500 Sobic008G174500 Sobic001G194100--Sobic008G174500 Sobic004G262100 Sobic004G262100 Sobic001G194100--Sobic004G262100 Sobic001G194100--Sobic004G339900 Sobic001G194100--Sobic002G420400 Sobic002G354800 Sobic002G354800 Sobic001G194100--Sobic002G354800 Sobic004G071050--Sobic001G485200 Sobic004G071050--Sobic010G106601 Sobic004G071050--Sobic002G420400 Sobic004G071050--Sobic004G339900 Sobic004G071050--Sobic009G033500 Sobic009G253800 Sobic009G253800 Sobic004G071050--Sobic009G253800 Sobic004G071050--Sobic004G065800 Sobic006G107900 Sobic006G107900 Sobic004G071050--Sobic006G107900 Sobic007G091200 Sobic007G091200 Sobic004G071050--Sobic007G091200 Sobic004G339900--Sobic002G420400 Sobic004G339900--Sobic004G071050 Sobic004G339900--Sobic001G485200 Sobic004G339900--Sobic001G194100 Sobic010G152000 Sobic010G152000 Sobic004G339900--Sobic010G152000 Sobic004G339900--Sobic007G041200 Sobic008G116100 Sobic008G116100 Sobic004G339900--Sobic008G116100 Sobic004G339900--Sobic004G065800 Sobic004G339900--Sobic004G163700 Sobic003G062101--Sobic008G174500 Sobic003G062101--Sobic001G194100 Sobic003G062101--Sobic003G042200 Sobic003G062101--Sobic004G262100 Sobic003G062101--Sobic004G065800 Sobic009G156200 Sobic009G156200 Sobic003G062101--Sobic009G156200 Sobic010G223500 Sobic010G223500 Sobic003G062101--Sobic010G223500 Sobic003G062101--Sobic004G339900 Sobic003G062101--Sobic004G071050 Sobic009G033500--Sobic007G091200 Sobic009G033500--Sobic007G041200 Sobic010G060100 Sobic010G060100 Sobic009G033500--Sobic010G060100 Sobic001G425900 Sobic001G425900 Sobic009G033500--Sobic001G425900 Sobic010G118200 Sobic010G118200 Sobic009G033500--Sobic010G118200 Sobic010G084800 Sobic010G084800 Sobic009G033500--Sobic010G084800 Sobic007G205400 Sobic007G205400 Sobic009G033500--Sobic007G205400 Sobic004G133600 Sobic004G133600 Sobic009G033500--Sobic004G133600 Sobic001G518700 Sobic001G518700 Sobic009G033500--Sobic001G518700 Sobic002G420400--Sobic004G339900 Sobic002G420400--Sobic004G071050 Sobic005G036200 Sobic005G036200 Sobic002G420400--Sobic005G036200 Sobic004G242200 Sobic004G242200 Sobic002G420400--Sobic004G242200 Sobic002G420400--Sobic001G485200 Sobic003G379900 Sobic003G379900 Sobic002G420400--Sobic003G379900 Sobic001G375800 Sobic001G375800 Sobic002G420400--Sobic001G375800 Sobic002G420400--Sobic010G152000 Sobic002G420400--Sobic001G194100 Sobic007G041200--Sobic008G116100 Sobic007G041200--Sobic009G033500 Sobic007G041200--Sobic010G084800 Sobic010G047300 Sobic010G047300 Sobic007G041200--Sobic010G047300 Sobic002G097601 Sobic002G097601 Sobic007G041200--Sobic002G097601 Sobic006G186300 Sobic006G186300 Sobic007G041200--Sobic006G186300 Sobic007G041200--Sobic007G091200 Sobic008G109600 Sobic008G109600 Sobic007G041200--Sobic008G109600 Sobic007G041200--Sobic010G060100 Sobic001G485200--Sobic006G107900 Sobic003G400400 Sobic003G400400 Sobic001G485200--Sobic003G400400 Sobic001G485200--Sobic004G071050 Sobic002G391100 Sobic002G391100 Sobic001G485200--Sobic002G391100 Sobic001G017500 Sobic001G017500 Sobic001G485200--Sobic001G017500 Sobic001G485200--Sobic004G339900 Sobic001G485200--Sobic010G106601 Sobic001G485200--Sobic002G420400 Sobic002G302300 Sobic002G302300 Sobic001G485200--Sobic002G302300 Sobic001G088600 Sobic001G088600 Sobic010G106601--Sobic001G088600 Sobic010G106601--Sobic002G302300 Sobic010G106601--Sobic004G071050 Sobic002G111400 Sobic002G111400 Sobic010G106601--Sobic002G111400 Sobic007G075250 Sobic007G075250 Sobic010G106601--Sobic007G075250 Sobic009G209400 Sobic009G209400 Sobic010G106601--Sobic009G209400 Sobic009G191801 Sobic009G191801 Sobic010G106601--Sobic009G191801 Sobic010G106601--Sobic001G485200 Sobic010G106601--Sobic006G107900
Octagon: transcription factors


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