Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G114300.1
Synonym Sb04g009340
Functional annotation "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence." (PubMedID : 27586543)
-
UniProt A0A1Z5RLV6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G091800 12-oxophytodienoate reductase, putative, expressed K05894: 12-oxophytodienoic acid reductase
2 Sobic.005G178400 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
3 Sobic.007G110366 - -
4 Sobic.006G104700 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
5 Sobic.002G238600 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@- -
6 Sobic.001G065900 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
7 Sobic.004G172800 expressed protein -
8 Sobic.003G303400 CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.25 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
9 Sobic.007G094300 tetraspanin family protein, putative, expressed -
10 Sobic.005G110406 - K16223: protein FLOWERING LOCUS T
11 Sobic.006G072201 - -
12 Sobic.002G390000 dirigent, putative, expressed -
13 Sobic.002G100832 - -
14 Sobic.004G083401 - -
15 Sobic.002G102132 - -
16 Sobic.004G263100 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@hsp20/alpha crystallin family protein, putative, expressed K13993: HSP20 family protein
17 Sobic.003G112400 expressed protein -
18 Sobic.002G099451 - -
19 Sobic.010G135100 expressed protein -
20 Sobic.002G216200 cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G114300 Sobic004G114300 Sobic006G091800 Sobic006G091800 Sobic004G114300--Sobic006G091800 Sobic005G178400 Sobic005G178400 Sobic004G114300--Sobic005G178400 Sobic007G110366 Sobic007G110366 Sobic004G114300--Sobic007G110366 Sobic006G104700 Sobic006G104700 Sobic004G114300--Sobic006G104700 Sobic002G238600 Sobic002G238600 Sobic004G114300--Sobic002G238600 Sobic001G065900 Sobic001G065900 Sobic004G114300--Sobic001G065900 Sobic004G172800 Sobic004G172800 Sobic004G114300--Sobic004G172800 Sobic003G303400 Sobic003G303400 Sobic004G114300--Sobic003G303400 Sobic007G094300 Sobic007G094300 Sobic004G114300--Sobic007G094300 Sobic006G057500 Sobic006G057500 Sobic006G091800--Sobic006G057500 Sobic002G100832 Sobic002G100832 Sobic006G091800--Sobic002G100832 Sobic006G091800--Sobic001G065900 Sobic004G165800 Sobic004G165800 Sobic006G091800--Sobic004G165800 Sobic008G054150 Sobic008G054150 Sobic006G091800--Sobic008G054150 Sobic004G341000 Sobic004G341000 Sobic006G091800--Sobic004G341000 Sobic004G263100 Sobic004G263100 Sobic006G091800--Sobic004G263100 Sobic002G102132 Sobic002G102132 Sobic006G091800--Sobic002G102132 Sobic007G169500 Sobic007G169500 Sobic006G091800--Sobic007G169500 Sobic005G178400--Sobic001G065900 Sobic001G381400 Sobic001G381400 Sobic005G178400--Sobic001G381400 Sobic005G171001 Sobic005G171001 Sobic005G178400--Sobic005G171001 Sobic002G388800 Sobic002G388800 Sobic005G178400--Sobic002G388800 Sobic004G094900 Sobic004G094900 Sobic005G178400--Sobic004G094900 Sobic002G090100 Sobic002G090100 Sobic005G178400--Sobic002G090100 Sobic004G092800 Sobic004G092800 Sobic007G110366--Sobic004G092800 Sobic002G390000 Sobic002G390000 Sobic007G110366--Sobic002G390000 Sobic007G110366--Sobic002G238600 Sobic007G110366--Sobic004G263100 Sobic007G110366--Sobic002G102132 Sobic007G110366--Sobic001G065900 Sobic007G159100 Sobic007G159100 Sobic007G110366--Sobic007G159100 Sobic007G110366--Sobic004G341000 Sobic007G110366--Sobic002G100832 Sobic006G104700--Sobic002G238600 Sobic003G112400 Sobic003G112400 Sobic006G104700--Sobic003G112400 Sobic006G104700--Sobic002G390000 Sobic003G060100 Sobic003G060100 Sobic006G104700--Sobic003G060100 Sobic006G277800 Sobic006G277800 Sobic006G104700--Sobic006G277800 Sobic006G072201 Sobic006G072201 Sobic006G104700--Sobic006G072201 Sobic006G104700--Sobic001G065900 Sobic005G110406 Sobic005G110406 Sobic006G104700--Sobic005G110406 Sobic010G135100 Sobic010G135100 Sobic006G104700--Sobic010G135100 Sobic002G238600--Sobic002G390000 Sobic002G238600--Sobic001G381400 Sobic005G180500 Sobic005G180500 Sobic002G238600--Sobic005G180500 Sobic002G238600--Sobic006G104700 Sobic002G238600--Sobic002G388800 Sobic002G238600--Sobic001G065900 Sobic002G238600--Sobic004G263100 Sobic002G238600--Sobic003G060100 Sobic002G238600--Sobic004G094900 Sobic001G065900--Sobic004G263100 Sobic001G065900--Sobic004G165800 Sobic001G065900--Sobic002G100832 Sobic001G065900--Sobic002G102132 Sobic001G065900--Sobic004G092800 Sobic001G065900--Sobic006G057500 Sobic004G251800 Sobic004G251800 Sobic001G065900--Sobic004G251800 Sobic001G065900--Sobic002G388800 Sobic001G065900--Sobic004G341000 Sobic007G100032 Sobic007G100032 Sobic004G172800--Sobic007G100032 Sobic001G195500 Sobic001G195500 Sobic004G172800--Sobic001G195500 Sobic001G197300 Sobic001G197300 Sobic004G172800--Sobic001G197300 Sobic004G172800--Sobic005G178400 Sobic004G172800--Sobic004G094900 Sobic004G172800--Sobic001G065900 Sobic004G172800--Sobic001G381400 Sobic010G136400 Sobic010G136400 Sobic004G172800--Sobic010G136400 Sobic006G063400 Sobic006G063400 Sobic004G172800--Sobic006G063400 Sobic003G303400--Sobic002G100832 Sobic003G303400--Sobic006G057500 Sobic003G303400--Sobic002G102132 Sobic003G303400--Sobic004G263100 Sobic003G303400--Sobic007G159100 Sobic003G303400--Sobic004G165800 Sobic010G179400 Sobic010G179400 Sobic003G303400--Sobic010G179400 Sobic003G303400--Sobic002G238600 Sobic001G102150 Sobic001G102150 Sobic003G303400--Sobic001G102150 Sobic004G121700 Sobic004G121700 Sobic007G094300--Sobic004G121700 Sobic008G148200 Sobic008G148200 Sobic007G094300--Sobic008G148200 Sobic007G094300--Sobic006G277800 Sobic007G094300--Sobic005G110406 Sobic007G094300--Sobic006G072201 Sobic010G088800 Sobic010G088800 Sobic007G094300--Sobic010G088800 Sobic002G099451 Sobic002G099451 Sobic007G094300--Sobic002G099451 Sobic006G277500 Sobic006G277500 Sobic007G094300--Sobic006G277500 Sobic009G052800 Sobic009G052800 Sobic007G094300--Sobic009G052800
Octagon: transcription factors


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