Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G135700.2,Sobic.004G135700.1,Sobic.004G135700.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YPG9 , A0A194YQM2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G044301 - -
2 Sobic.005G169100 cytochrome P450, putative, expressed -
3 Sobic.010G204100 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450 71D7, putative, expressed -
4 Sobic.002G182500 nucleic acid binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G114550 - -
6 Sobic.006G074400 - -
7 Sobic.009G009400 expressed protein -
8 Sobic.006G036500 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, chloroplast precursor, putative, expressed -
9 Sobic.006G002100 phosphoglycerate mutase, putative, expressed -
10 Sobic.010G035700 expressed protein -
11 Sobic.001G342700 protein phosphotase protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G043700 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
13 Sobic.008G068166 - -
14 Sobic.007G015800 - -
15 Sobic.007G066908 - -
16 Sobic.006G206900 60S ribosomal protein L7, putative, expressed -
17 Sobic.001G319700 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
18 Sobic.010G102300 expressed protein -
19 Sobic.001G343601 - K07748: NSDHL, sterol-4alpha-carboxylate 3-dehydrogenase (decarboxylating)
20 Sobic.007G067350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G135700 Sobic004G135700 Sobic006G044301 Sobic006G044301 Sobic004G135700--Sobic006G044301 Sobic005G169100 Sobic005G169100 Sobic004G135700--Sobic005G169100 Sobic010G204100 Sobic010G204100 Sobic004G135700--Sobic010G204100 Sobic002G182500 Sobic002G182500 Sobic004G135700--Sobic002G182500 Sobic001G114550 Sobic001G114550 Sobic004G135700--Sobic001G114550 Sobic006G074400 Sobic006G074400 Sobic004G135700--Sobic006G074400 Sobic009G009400 Sobic009G009400 Sobic004G135700--Sobic009G009400 Sobic006G036500 Sobic006G036500 Sobic004G135700--Sobic006G036500 Sobic006G002100 Sobic006G002100 Sobic004G135700--Sobic006G002100 Sobic006G044301--Sobic004G135700 Sobic006G044301--Sobic006G036500 Sobic006G044301--Sobic002G182500 Sobic006G044301--Sobic006G074400 Sobic006G044301--Sobic006G002100 Sobic006G044301--Sobic009G009400 Sobic001G409850 Sobic001G409850 Sobic006G044301--Sobic001G409850 Sobic002G183100 Sobic002G183100 Sobic006G044301--Sobic002G183100 Sobic006G044301--Sobic005G169100 Sobic007G067300 Sobic007G067300 Sobic005G169100--Sobic007G067300 Sobic001G342700 Sobic001G342700 Sobic005G169100--Sobic001G342700 Sobic007G015800 Sobic007G015800 Sobic005G169100--Sobic007G015800 Sobic007G066908 Sobic007G066908 Sobic005G169100--Sobic007G066908 Sobic006G206900 Sobic006G206900 Sobic005G169100--Sobic006G206900 Sobic010G102300 Sobic010G102300 Sobic005G169100--Sobic010G102300 Sobic005G169100--Sobic002G182500 Sobic010G035700 Sobic010G035700 Sobic005G169100--Sobic010G035700 Sobic001G319700 Sobic001G319700 Sobic005G169100--Sobic001G319700 Sobic001G231600 Sobic001G231600 Sobic010G204100--Sobic001G231600 Sobic007G067350 Sobic007G067350 Sobic010G204100--Sobic007G067350 Sobic010G204100--Sobic006G074400 Sobic010G204100--Sobic010G102300 Sobic010G204100--Sobic010G035700 Sobic007G067600 Sobic007G067600 Sobic010G204100--Sobic007G067600 Sobic002G104900 Sobic002G104900 Sobic010G204100--Sobic002G104900 Sobic007G066932 Sobic007G066932 Sobic010G204100--Sobic007G066932 Sobic010G204100--Sobic001G319700 Sobic004G128400 Sobic004G128400 Sobic002G182500--Sobic004G128400 Sobic002G182500--Sobic001G342700 Sobic001G343601 Sobic001G343601 Sobic002G182500--Sobic001G343601 Sobic002G182400 Sobic002G182400 Sobic002G182500--Sobic002G182400 Sobic002G182500--Sobic009G009400 Sobic002G182500--Sobic005G169100 Sobic002G182500--Sobic006G036500 Sobic002G182500--Sobic002G183100 Sobic001G260000 Sobic001G260000 Sobic002G182500--Sobic001G260000 Sobic001G114550--Sobic007G015800 Sobic010G102200 Sobic010G102200 Sobic001G114550--Sobic010G102200 Sobic001G114550--Sobic004G135700 Sobic002G024650 Sobic002G024650 Sobic001G114550--Sobic002G024650 Sobic001G121850 Sobic001G121850 Sobic001G114550--Sobic001G121850 Sobic006G074400--Sobic009G009400 Sobic006G074400--Sobic010G204100 Sobic006G074400--Sobic001G342700 Sobic002G383000 Sobic002G383000 Sobic006G074400--Sobic002G383000 Sobic009G043700 Sobic009G043700 Sobic006G074400--Sobic009G043700 Sobic006G074400--Sobic001G343601 Sobic006G074400--Sobic002G182500 Sobic006G074400--Sobic005G169100 Sobic009G011901 Sobic009G011901 Sobic006G074400--Sobic009G011901 Sobic009G009400--Sobic001G343601 Sobic007G169500 Sobic007G169500 Sobic009G009400--Sobic007G169500 Sobic008G054150 Sobic008G054150 Sobic009G009400--Sobic008G054150 Sobic009G009400--Sobic001G342700 Sobic009G009400--Sobic009G043700 Sobic004G115500 Sobic004G115500 Sobic009G009400--Sobic004G115500 Sobic009G009400--Sobic001G260000 Sobic002G146100 Sobic002G146100 Sobic009G009400--Sobic002G146100 Sobic009G009400--Sobic002G182500 Sobic006G038800 Sobic006G038800 Sobic006G036500--Sobic006G038800 Sobic002G156900 Sobic002G156900 Sobic006G036500--Sobic002G156900 Sobic006G036500--Sobic002G182500 Sobic004G189301 Sobic004G189301 Sobic006G036500--Sobic004G189301 Sobic006G036500--Sobic002G183100 Sobic006G036500--Sobic006G002100 Sobic010G110266 Sobic010G110266 Sobic006G036500--Sobic010G110266 Sobic002G018500 Sobic002G018500 Sobic006G036500--Sobic002G018500 Sobic005G089500 Sobic005G089500 Sobic006G036500--Sobic005G089500 Sobic006G002100--Sobic002G183100 Sobic007G016100 Sobic007G016100 Sobic006G002100--Sobic007G016100 Sobic006G002100--Sobic006G036500 Sobic006G107200 Sobic006G107200 Sobic006G002100--Sobic006G107200 Sobic006G002100--Sobic006G038800 Sobic004G037000 Sobic004G037000 Sobic006G002100--Sobic004G037000 Sobic001G248500 Sobic001G248500 Sobic006G002100--Sobic001G248500 Sobic006G002100--Sobic002G156900 Sobic001G348700 Sobic001G348700 Sobic006G002100--Sobic001G348700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.