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Transcriptome id Sobic.006G074400.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1B6PKS8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G009400 expressed protein -
2 Sobic.010G204100 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450 71D7, putative, expressed -
3 Sobic.001G342700 protein phosphotase protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G383000 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
5 Sobic.009G043700 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
6 Sobic.001G343601 - K07748: NSDHL, sterol-4alpha-carboxylate 3-dehydrogenase (decarboxylating)
7 Sobic.002G182500 nucleic acid binding protein, putative, expressed -
8 Sobic.005G169100 cytochrome P450, putative, expressed -
9 Sobic.009G011901 - -
10 Sobic.007G169500 expressed high in San Chi San (an efficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@Ribosomal protein L1p/L10e family("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@L1P family of ribosomal proteins domain containing protein, expressed K02865: RP-L10Ae, large subunit ribosomal protein L10Ae
11 Sobic.008G068166 - -
12 Sobic.008G054150 - -
13 Sobic.007G067300 Cupin domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G146100 - -
15 Sobic.001G260000 SAP domain containing protein, expressed -
16 Sobic.004G115500 expressed protein -
17 Sobic.007G158700 expressed high in San Chi San (an efficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@phospholipase A("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@patatin, putative, expressed -
18 Sobic.009G012000 expressed protein -
19 Sobic.004G028966 - -
20 Sobic.001G495148 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G074400 Sobic006G074400 Sobic009G009400 Sobic009G009400 Sobic006G074400--Sobic009G009400 Sobic010G204100 Sobic010G204100 Sobic006G074400--Sobic010G204100 Sobic001G342700 Sobic001G342700 Sobic006G074400--Sobic001G342700 Sobic002G383000 Sobic002G383000 Sobic006G074400--Sobic002G383000 Sobic009G043700 Sobic009G043700 Sobic006G074400--Sobic009G043700 Sobic001G343601 Sobic001G343601 Sobic006G074400--Sobic001G343601 Sobic002G182500 Sobic002G182500 Sobic006G074400--Sobic002G182500 Sobic005G169100 Sobic005G169100 Sobic006G074400--Sobic005G169100 Sobic009G011901 Sobic009G011901 Sobic006G074400--Sobic009G011901 Sobic009G009400--Sobic001G343601 Sobic007G169500 Sobic007G169500 Sobic009G009400--Sobic007G169500 Sobic008G054150 Sobic008G054150 Sobic009G009400--Sobic008G054150 Sobic009G009400--Sobic001G342700 Sobic009G009400--Sobic009G043700 Sobic004G115500 Sobic004G115500 Sobic009G009400--Sobic004G115500 Sobic001G260000 Sobic001G260000 Sobic009G009400--Sobic001G260000 Sobic002G146100 Sobic002G146100 Sobic009G009400--Sobic002G146100 Sobic009G009400--Sobic002G182500 Sobic001G231600 Sobic001G231600 Sobic010G204100--Sobic001G231600 Sobic007G067350 Sobic007G067350 Sobic010G204100--Sobic007G067350 Sobic010G204100--Sobic006G074400 Sobic010G102300 Sobic010G102300 Sobic010G204100--Sobic010G102300 Sobic010G035700 Sobic010G035700 Sobic010G204100--Sobic010G035700 Sobic007G067600 Sobic007G067600 Sobic010G204100--Sobic007G067600 Sobic002G104900 Sobic002G104900 Sobic010G204100--Sobic002G104900 Sobic007G066932 Sobic007G066932 Sobic010G204100--Sobic007G066932 Sobic001G319700 Sobic001G319700 Sobic010G204100--Sobic001G319700 Sobic007G067300 Sobic007G067300 Sobic001G342700--Sobic007G067300 Sobic001G342700--Sobic001G343601 Sobic001G342700--Sobic009G009400 Sobic001G342700--Sobic005G169100 Sobic001G342700--Sobic002G146100 Sobic006G033260 Sobic006G033260 Sobic001G342700--Sobic006G033260 Sobic001G342700--Sobic002G182500 Sobic008G068166 Sobic008G068166 Sobic001G342700--Sobic008G068166 Sobic001G342700--Sobic008G054150 Sobic002G382950 Sobic002G382950 Sobic002G383000--Sobic002G382950 Sobic002G383000--Sobic009G011901 Sobic002G383000--Sobic006G074400 Sobic009G012000 Sobic009G012000 Sobic002G383000--Sobic009G012000 Sobic005G118100 Sobic005G118100 Sobic002G383000--Sobic005G118100 Sobic005G018300 Sobic005G018300 Sobic002G383000--Sobic005G018300 Sobic003G181400 Sobic003G181400 Sobic002G383000--Sobic003G181400 Sobic004G311750 Sobic004G311750 Sobic002G383000--Sobic004G311750 Sobic001G354000 Sobic001G354000 Sobic002G383000--Sobic001G354000 Sobic009G043700--Sobic009G009400 Sobic009G043700--Sobic004G115500 Sobic009G043700--Sobic007G169500 Sobic009G043700--Sobic001G343601 Sobic009G043700--Sobic008G054150 Sobic001G357100 Sobic001G357100 Sobic009G043700--Sobic001G357100 Sobic009G043700--Sobic001G342700 Sobic001G495148 Sobic001G495148 Sobic009G043700--Sobic001G495148 Sobic009G043700--Sobic008G068166 Sobic001G343601--Sobic009G009400 Sobic001G343601--Sobic008G054150 Sobic001G343601--Sobic001G342700 Sobic001G343601--Sobic001G260000 Sobic001G343601--Sobic007G169500 Sobic001G343601--Sobic002G146100 Sobic001G343601--Sobic004G115500 Sobic001G343601--Sobic006G033260 Sobic007G158700 Sobic007G158700 Sobic001G343601--Sobic007G158700 Sobic004G128400 Sobic004G128400 Sobic002G182500--Sobic004G128400 Sobic002G182500--Sobic001G342700 Sobic002G182500--Sobic001G343601 Sobic002G182400 Sobic002G182400 Sobic002G182500--Sobic002G182400 Sobic002G182500--Sobic009G009400 Sobic002G182500--Sobic005G169100 Sobic006G036500 Sobic006G036500 Sobic002G182500--Sobic006G036500 Sobic002G183100 Sobic002G183100 Sobic002G182500--Sobic002G183100 Sobic002G182500--Sobic001G260000 Sobic005G169100--Sobic007G067300 Sobic005G169100--Sobic001G342700 Sobic007G015800 Sobic007G015800 Sobic005G169100--Sobic007G015800 Sobic007G066908 Sobic007G066908 Sobic005G169100--Sobic007G066908 Sobic006G206900 Sobic006G206900 Sobic005G169100--Sobic006G206900 Sobic005G169100--Sobic010G102300 Sobic005G169100--Sobic002G182500 Sobic005G169100--Sobic010G035700 Sobic005G169100--Sobic001G319700 Sobic009G011901--Sobic009G012000 Sobic009G011901--Sobic002G383000 Sobic009G011901--Sobic006G074400 Sobic009G011901--Sobic003G181400 Sobic009G011901--Sobic002G382950 Sobic005G047800 Sobic005G047800 Sobic009G011901--Sobic005G047800 Sobic009G011901--Sobic005G118100 Sobic003G311200 Sobic003G311200 Sobic009G011901--Sobic003G311200 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic009G011901--Sobic003G266700
Octagon: transcription factors


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