Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G012000.1
Synonym Sb09g001200
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P612
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g54759.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037254 , Zm00025a037255 , Zm00025a037280
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G011901 - -
2 Sobic.002G383000 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
3 Sobic.003G181400 - -
4 Sobic.006G074400 - -
5 Sobic.002G382950 - -
6 Sobic.005G047800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
7 Sobic.005G118100 STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 8 precursor, putative, expressed K13436: pto-interacting protein 1
8 Sobic.009G214000 expressed protein -
9 Sobic.004G127300 - -
10 Sobic.005G221550 - -
11 Sobic.010G204100 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450 71D7, putative, expressed -
12 Sobic.007G070500 OsFBL41 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
13 Sobic.003G266700 expressed protein -
14 Sobic.005G134501 - -
15 Sobic.001G513300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@protein-methionine-S-oxide reductase, putative, expressed -
16 Sobic.002G080000 - -
17 Sobic.003G311200 - -
18 Sobic.006G038901 - -
19 Sobic.001G515500 LYM2 lysm domain GPI-anchored protein 2 precursor("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@lysM domain-containing GPI-anchored protein precursor, putative, expressed K13473: chitin elicitor-binding protein
20 Sobic.005G018300 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed K14641: apyrase


Gene co-expression network
sample Sobic009G012000 Sobic009G012000 Sobic009G011901 Sobic009G011901 Sobic009G012000--Sobic009G011901 Sobic002G383000 Sobic002G383000 Sobic009G012000--Sobic002G383000 Sobic003G181400 Sobic003G181400 Sobic009G012000--Sobic003G181400 Sobic006G074400 Sobic006G074400 Sobic009G012000--Sobic006G074400 Sobic002G382950 Sobic002G382950 Sobic009G012000--Sobic002G382950 Sobic005G047800 Sobic005G047800 Sobic009G012000--Sobic005G047800 Sobic005G118100 Sobic005G118100 Sobic009G012000--Sobic005G118100 Sobic009G214000 Sobic009G214000 Sobic009G012000--Sobic009G214000 Sobic004G127300 Sobic004G127300 Sobic009G012000--Sobic004G127300 Sobic009G011901--Sobic009G012000 Sobic009G011901--Sobic002G383000 Sobic009G011901--Sobic006G074400 Sobic009G011901--Sobic003G181400 Sobic009G011901--Sobic002G382950 Sobic009G011901--Sobic005G047800 Sobic009G011901--Sobic005G118100 Sobic003G311200 Sobic003G311200 Sobic009G011901--Sobic003G311200 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic009G011901--Sobic003G266700 Sobic002G383000--Sobic002G382950 Sobic002G383000--Sobic009G011901 Sobic002G383000--Sobic006G074400 Sobic002G383000--Sobic009G012000 Sobic002G383000--Sobic005G118100 Sobic005G018300 Sobic005G018300 Sobic002G383000--Sobic005G018300 Sobic002G383000--Sobic003G181400 Sobic004G311750 Sobic004G311750 Sobic002G383000--Sobic004G311750 Sobic001G354000 Sobic001G354000 Sobic002G383000--Sobic001G354000 Sobic003G181400--Sobic009G011901 Sobic003G181400--Sobic003G266700 Sobic003G181400--Sobic009G012000 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic003G181400--Sobic008G106400 Sobic005G134501 Sobic005G134501 Sobic003G181400--Sobic005G134501 Sobic006G038901 Sobic006G038901 Sobic003G181400--Sobic006G038901 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic003G181400--Sobic005G221550 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic003G181400--Sobic006G249200 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic003G181400--Sobic005G079700 Sobic009G009400 Sobic009G009400 Sobic006G074400--Sobic009G009400 Sobic010G204100 Sobic010G204100 Sobic006G074400--Sobic010G204100 Sobic001G342700 Sobic001G342700 Sobic006G074400--Sobic001G342700 Sobic006G074400--Sobic002G383000 Sobic009G043700 Sobic009G043700 Sobic006G074400--Sobic009G043700 Sobic001G343601 Sobic001G343601 Sobic006G074400--Sobic001G343601 Sobic002G182500 Sobic002G182500 Sobic006G074400--Sobic002G182500 Sobic005G169100 Sobic005G169100 Sobic006G074400--Sobic005G169100 Sobic006G074400--Sobic009G011901 Sobic002G382950--Sobic002G383000 Sobic002G382950--Sobic009G011901 Sobic010G193400 Sobic010G193400 Sobic002G382950--Sobic010G193400 Sobic002G382950--Sobic009G012000 Sobic003G107400 Sobic003G107400 Sobic002G382950--Sobic003G107400 Sobic002G382950--Sobic006G074400 Sobic001G515500 Sobic001G515500 Sobic002G382950--Sobic001G515500 Sobic008G106800 Sobic008G106800 Sobic002G382950--Sobic008G106800 Sobic002G382950--Sobic005G047800 Sobic005G047800--Sobic009G011901 Sobic005G047800--Sobic003G266700 Sobic005G047800--Sobic005G221550 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G047800--Sobic005G142200 Sobic005G047800--Sobic003G311200 Sobic002G305500 Sobic002G305500 Sobic005G047800--Sobic002G305500 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic005G047800--Sobic005G170800 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic005G047800--Sobic004G121000 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic005G047800--Sobic003G436900 Sobic004G169966 Sobic004G169966 Sobic005G118100--Sobic004G169966 Sobic003G389900 Sobic003G389900 Sobic005G118100--Sobic003G389900 Sobic005G118100--Sobic009G011901 Sobic005G118100--Sobic004G311750 Sobic005G132066 Sobic005G132066 Sobic005G118100--Sobic005G132066 Sobic004G165800 Sobic004G165800 Sobic005G118100--Sobic004G165800 Sobic004G229300 Sobic004G229300 Sobic005G118100--Sobic004G229300 Sobic002G100832 Sobic002G100832 Sobic005G118100--Sobic002G100832 Sobic002G102132 Sobic002G102132 Sobic005G118100--Sobic002G102132 Sobic009G214000--Sobic009G012000 Sobic001G341300 Sobic001G341300 Sobic009G214000--Sobic001G341300 Sobic004G152400 Sobic004G152400 Sobic009G214000--Sobic004G152400 Sobic009G214000--Sobic009G011901 Sobic009G214000--Sobic001G354000 Sobic009G214000--Sobic003G107400 Sobic004G152700 Sobic004G152700 Sobic009G214000--Sobic004G152700 Sobic006G159400 Sobic006G159400 Sobic009G214000--Sobic006G159400 Sobic002G119800 Sobic002G119800 Sobic009G214000--Sobic002G119800 Sobic006G252400 Sobic006G252400 Sobic004G127300--Sobic006G252400 Sobic007G192400 Sobic007G192400 Sobic004G127300--Sobic007G192400 Sobic004G016100 Sobic004G016100 Sobic004G127300--Sobic004G016100 Sobic007G082200 Sobic007G082200 Sobic004G127300--Sobic007G082200 Sobic006G239700 Sobic006G239700 Sobic004G127300--Sobic006G239700 Sobic010G260900 Sobic010G260900 Sobic004G127300--Sobic010G260900 Sobic004G259300 Sobic004G259300 Sobic004G127300--Sobic004G259300 Sobic003G353700 Sobic003G353700 Sobic004G127300--Sobic003G353700 Sobic008G006000 Sobic008G006000 Sobic004G127300--Sobic008G006000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.