Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G168432.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RNP9
Pfam PF07893
Panther DB PTHR33085
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g02230.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G041600 - -
2 Sobic.007G120301 - -
3 Sobic.001G305300 ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed -
4 Sobic.001G173700 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G246300 expressed protein -
6 Sobic.003G052100 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
7 Sobic.009G210400 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
8 Sobic.005G231300 thaumatin, putative, expressed -
9 Sobic.006G014500 expressed protein -
10 Sobic.002G016400 monocopper oxidase, putative, expressed -
11 Sobic.003G296500 leucine rich repeat family protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G132500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@subtilisin-like protease, putative, expressed -
13 Sobic.010G220300 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.008G114000 expressed protein -
15 Sobic.003G385900 lipoxygenase, putative, expressed K15718: linoleate 9S-lipoxygenase
16 Sobic.002G082700 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.007G208100 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
18 Sobic.002G034301 - -
19 Sobic.005G121700 expressed protein -
20 Sobic.001G514300 Glutathione S-transferase("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase


Gene co-expression network
sample Sobic004G168432 Sobic004G168432 Sobic007G041600 Sobic007G041600 Sobic004G168432--Sobic007G041600 Sobic007G120301 Sobic007G120301 Sobic004G168432--Sobic007G120301 Sobic001G305300 Sobic001G305300 Sobic004G168432--Sobic001G305300 Sobic001G173700 Sobic001G173700 Sobic004G168432--Sobic001G173700 Sobic003G246300 Sobic003G246300 Sobic004G168432--Sobic003G246300 Sobic003G052100 Sobic003G052100 Sobic004G168432--Sobic003G052100 Sobic009G210400 Sobic009G210400 Sobic004G168432--Sobic009G210400 Sobic005G231300 Sobic005G231300 Sobic004G168432--Sobic005G231300 Sobic006G014500 Sobic006G014500 Sobic004G168432--Sobic006G014500 Sobic007G041600--Sobic001G173700 Sobic007G041600--Sobic003G052100 Sobic010G220300 Sobic010G220300 Sobic007G041600--Sobic010G220300 Sobic004G126500 Sobic004G126500 Sobic007G041600--Sobic004G126500 Sobic001G238500 Sobic001G238500 Sobic007G041600--Sobic001G238500 Sobic009G015166 Sobic009G015166 Sobic007G041600--Sobic009G015166 Sobic003G153100 Sobic003G153100 Sobic007G041600--Sobic003G153100 Sobic009G079900 Sobic009G079900 Sobic007G041600--Sobic009G079900 Sobic007G172500 Sobic007G172500 Sobic007G041600--Sobic007G172500 Sobic007G120301--Sobic001G305300 Sobic002G016400 Sobic002G016400 Sobic007G120301--Sobic002G016400 Sobic005G098400 Sobic005G098400 Sobic007G120301--Sobic005G098400 Sobic007G050500 Sobic007G050500 Sobic007G120301--Sobic007G050500 Sobic007G120301--Sobic007G041600 Sobic007G120301--Sobic005G231300 Sobic006G149300 Sobic006G149300 Sobic007G120301--Sobic006G149300 Sobic007G208100 Sobic007G208100 Sobic007G120301--Sobic007G208100 Sobic002G283500 Sobic002G283500 Sobic007G120301--Sobic002G283500 Sobic001G305300--Sobic005G098400 Sobic001G305300--Sobic002G016400 Sobic001G305300--Sobic007G120301 Sobic001G345200 Sobic001G345200 Sobic001G305300--Sobic001G345200 Sobic005G121700 Sobic005G121700 Sobic001G305300--Sobic005G121700 Sobic001G305300--Sobic007G050500 Sobic005G010300 Sobic005G010300 Sobic001G305300--Sobic005G010300 Sobic007G225400 Sobic007G225400 Sobic001G305300--Sobic007G225400 Sobic001G310200 Sobic001G310200 Sobic001G305300--Sobic001G310200 Sobic001G464300 Sobic001G464300 Sobic001G173700--Sobic001G464300 Sobic001G173700--Sobic004G126500 Sobic005G104200 Sobic005G104200 Sobic001G173700--Sobic005G104200 Sobic001G173700--Sobic007G041600 Sobic004G248500 Sobic004G248500 Sobic001G173700--Sobic004G248500 Sobic001G348800 Sobic001G348800 Sobic001G173700--Sobic001G348800 Sobic002G019100 Sobic002G019100 Sobic001G173700--Sobic002G019100 Sobic001G173700--Sobic001G238500 Sobic005G115300 Sobic005G115300 Sobic001G173700--Sobic005G115300 Sobic003G246300--Sobic001G173700 Sobic003G246300--Sobic009G210400 Sobic002G391200 Sobic002G391200 Sobic003G246300--Sobic002G391200 Sobic001G301400 Sobic001G301400 Sobic003G246300--Sobic001G301400 Sobic010G176800 Sobic010G176800 Sobic003G246300--Sobic010G176800 Sobic003G246300--Sobic003G052100 Sobic010G115000 Sobic010G115000 Sobic003G246300--Sobic010G115000 Sobic006G171300 Sobic006G171300 Sobic003G246300--Sobic006G171300 Sobic003G385900 Sobic003G385900 Sobic003G246300--Sobic003G385900 Sobic001G402400 Sobic001G402400 Sobic003G052100--Sobic001G402400 Sobic003G052100--Sobic007G041600 Sobic002G275500 Sobic002G275500 Sobic003G052100--Sobic002G275500 Sobic003G052100--Sobic010G220300 Sobic006G009500 Sobic006G009500 Sobic003G052100--Sobic006G009500 Sobic003G052100--Sobic009G079900 Sobic003G296500 Sobic003G296500 Sobic003G052100--Sobic003G296500 Sobic003G052100--Sobic005G231300 Sobic004G271500 Sobic004G271500 Sobic003G052100--Sobic004G271500 Sobic007G020100 Sobic007G020100 Sobic009G210400--Sobic007G020100 Sobic006G030200 Sobic006G030200 Sobic009G210400--Sobic006G030200 Sobic001G314000 Sobic001G314000 Sobic009G210400--Sobic001G314000 Sobic009G210400--Sobic003G246300 Sobic004G323000 Sobic004G323000 Sobic009G210400--Sobic004G323000 Sobic006G119000 Sobic006G119000 Sobic009G210400--Sobic006G119000 Sobic009G210400--Sobic005G231300 Sobic009G210400--Sobic010G176800 Sobic006G135500 Sobic006G135500 Sobic009G210400--Sobic006G135500 Sobic001G514300 Sobic001G514300 Sobic005G231300--Sobic001G514300 Sobic003G083600 Sobic003G083600 Sobic005G231300--Sobic003G083600 Sobic005G231300--Sobic009G079900 Sobic008G099100 Sobic008G099100 Sobic005G231300--Sobic008G099100 Sobic005G231300--Sobic007G208100 Sobic005G231300--Sobic006G030200 Sobic005G231300--Sobic001G314000 Sobic008G077300 Sobic008G077300 Sobic005G231300--Sobic008G077300 Sobic003G151900 Sobic003G151900 Sobic005G231300--Sobic003G151900 Sobic006G014500--Sobic001G345200 Sobic001G267100 Sobic001G267100 Sobic006G014500--Sobic001G267100 Sobic001G145200 Sobic001G145200 Sobic006G014500--Sobic001G145200 Sobic006G014500--Sobic005G098400 Sobic006G014500--Sobic007G050500 Sobic005G091000 Sobic005G091000 Sobic006G014500--Sobic005G091000 Sobic007G111700 Sobic007G111700 Sobic006G014500--Sobic007G111700 Sobic001G381100 Sobic001G381100 Sobic006G014500--Sobic001G381100 Sobic006G074900 Sobic006G074900 Sobic006G014500--Sobic006G074900
Octagon: transcription factors


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