Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G185400.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RN44
Pfam -
Panther DB PTHR33573 PTHR33573:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G188000 histone H3, putative, expressed K11253: histone H3
2 Sobic.002G190200 ZOS9-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
3 Sobic.004G122300 - -
4 Sobic.002G103100 - -
5 Sobic.001G317300 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
6 Sobic.003G170400 - -
7 Sobic.007G043100 cycloartenol synthase, putative, expressed -
8 Sobic.002G071350 - -
9 Sobic.002G071350 - -
10 Sobic.002G071350 - -
11 Sobic.002G071350 - -
12 Sobic.003G388500 - -
13 Sobic.002G173700 expressed protein -
14 Sobic.004G213900 trafficking protein particle complex subunit, putative, expressed -
15 Sobic.005G170900 OsFBDUF64 - F-box and DUF domain containing protein -
16 Sobic.002G428501 - -
17 Sobic.003G418733 - -
18 Sobic.001G227900 -(PubMedID : 21930910)@-(PubMedID : 24884377)@two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
19 Sobic.005G156400 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
20 Sobic.003G164950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G185400 Sobic004G185400 Sobic004G188000 Sobic004G188000 Sobic004G185400--Sobic004G188000 Sobic002G190200 Sobic002G190200 Sobic004G185400--Sobic002G190200 Sobic004G122300 Sobic004G122300 Sobic004G185400--Sobic004G122300 Sobic002G103100 Sobic002G103100 Sobic004G185400--Sobic002G103100 Sobic001G317300 Sobic001G317300 Sobic004G185400--Sobic001G317300 Sobic003G170400 Sobic003G170400 Sobic004G185400--Sobic003G170400 Sobic007G043100 Sobic007G043100 Sobic004G185400--Sobic007G043100 Sobic002G071350 Sobic002G071350 Sobic004G185400--Sobic002G071350 Sobic003G164950 Sobic003G164950 Sobic004G188000--Sobic003G164950 Sobic004G213900 Sobic004G213900 Sobic004G188000--Sobic004G213900 Sobic004G188000--Sobic002G103100 Sobic004G188000--Sobic004G185400 Sobic002G237900 Sobic002G237900 Sobic004G188000--Sobic002G237900 Sobic002G173700 Sobic002G173700 Sobic004G188000--Sobic002G173700 Sobic004G188000--Sobic004G122300 Sobic009G098200 Sobic009G098200 Sobic004G188000--Sobic009G098200 Sobic002G022100 Sobic002G022100 Sobic004G188000--Sobic002G022100 Sobic002G190200--Sobic002G071350 Sobic010G126200 Sobic010G126200 Sobic002G190200--Sobic010G126200 Sobic002G428501 Sobic002G428501 Sobic002G190200--Sobic002G428501 Sobic002G190200--Sobic007G043100 Sobic002G059932 Sobic002G059932 Sobic002G190200--Sobic002G059932 Sobic001G283900 Sobic001G283900 Sobic002G190200--Sobic001G283900 Sobic004G122300--Sobic003G170400 Sobic002G148000 Sobic002G148000 Sobic004G122300--Sobic002G148000 Sobic003G388500 Sobic003G388500 Sobic004G122300--Sobic003G388500 Sobic004G122300--Sobic004G188000 Sobic004G122300--Sobic004G185400 Sobic003G285300 Sobic003G285300 Sobic004G122300--Sobic003G285300 Sobic006G007800 Sobic006G007800 Sobic004G122300--Sobic006G007800 Sobic004G122100 Sobic004G122100 Sobic004G122300--Sobic004G122100 Sobic009G012900 Sobic009G012900 Sobic004G122300--Sobic009G012900 Sobic002G103100--Sobic003G164950 Sobic008G089800 Sobic008G089800 Sobic002G103100--Sobic008G089800 Sobic007G198400 Sobic007G198400 Sobic002G103100--Sobic007G198400 Sobic003G418733 Sobic003G418733 Sobic002G103100--Sobic003G418733 Sobic002G103100--Sobic002G022100 Sobic002G103100--Sobic004G188000 Sobic002G118101 Sobic002G118101 Sobic002G103100--Sobic002G118101 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic002G103100--Sobic007G202300 Sobic002G408100 Sobic002G408100 Sobic002G103100--Sobic002G408100 Sobic001G317300--Sobic002G103100 Sobic001G317300--Sobic003G418733 Sobic003G127001 Sobic003G127001 Sobic001G317300--Sobic003G127001 Sobic001G037300 Sobic001G037300 Sobic001G317300--Sobic001G037300 Sobic001G000300 Sobic001G000300 Sobic001G317300--Sobic001G000300 Sobic007G061100 Sobic007G061100 Sobic001G317300--Sobic007G061100 Sobic001G317300--Sobic007G202300 Sobic001G317300--Sobic007G043100 Sobic001G062900 Sobic001G062900 Sobic001G317300--Sobic001G062900 Sobic003G170400--Sobic004G122300 Sobic003G170400--Sobic004G185400 Sobic002G150100 Sobic002G150100 Sobic003G170400--Sobic002G150100 Sobic003G344050 Sobic003G344050 Sobic003G170400--Sobic003G344050 Sobic002G220800 Sobic002G220800 Sobic003G170400--Sobic002G220800 Sobic003G249050 Sobic003G249050 Sobic003G170400--Sobic003G249050 Sobic007G108200 Sobic007G108200 Sobic003G170400--Sobic007G108200 Sobic007G043100--Sobic002G071350 Sobic007G043100--Sobic010G126200 Sobic007G043100--Sobic002G428501 Sobic007G043100--Sobic002G190200 Sobic007G043100--Sobic001G283900 Sobic002G044700 Sobic002G044700 Sobic007G043100--Sobic002G044700 Sobic002G071350--Sobic002G071350 Sobic002G071350--Sobic010G126200 Sobic002G071350--Sobic002G428501 Sobic002G071350--Sobic007G043100 Sobic002G071350--Sobic002G190200 Sobic002G071350--Sobic001G283900 Sobic001G130800 Sobic001G130800 Sobic002G071350--Sobic001G130800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.