Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G326900.4,Sobic.004G326900.3,Sobic.004G326900.2
Synonym GAE1, Sb04g035630
Functional annotation UDP-glucuronate 4-epimerase, putative, expressed
UniProt C5XUD2
Pfam PF01073
Panther DB PTHR10366 PTHR10366:SF396
NCBI CDD KOG1371; UDP-glucose 4-epimerase/UDP-sulfoquinovose synthase
KEGG Orthology K08679; UDP-glucuronate 4-epimerase
Gene Ontology GO:0016616; oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor GO:0006694steroid biosynthetic process GO:00038543-beta-hydroxy-delta5-steroid dehydrogenase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G30440 : UDP-D-glucuronate 4-epimerase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g54890.1 : UDP-glucuronate 4-epimerase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022434 , Zm00025a042419 , Zm00025a047551 , Zm00025a049735 , Zm00025a043603 , Zm00025a030385 , Zm00025a021747 , Zm00025a005229 , Zm00025a042686 , Zm00025a032956
Brachypodium KQJ99081 , KQK19214 , KQK01095
Barley HORVU5Hr1G060660.1 , HORVU5Hr1G060660.3 , HORVU5Hr1G060660.2 , HORVU7Hr1G031270.1 , HORVU5Hr1G075660.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G326900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.002G417500 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein


Gene co-expression network
sample Sobic004G326900 Sobic004G326900 Sobic008G000900 Sobic008G000900 Sobic004G326900--Sobic008G000900 Sobic003G174800 Sobic003G174800 Sobic004G326900--Sobic003G174800 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic004G326900--Sobic008G091671 Sobic003G006800 Sobic003G006800 Sobic004G326900--Sobic003G006800 Sobic008G060150 Sobic008G060150 Sobic004G326900--Sobic008G060150 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic004G326900--Sobic003G159450 Sobic010G253000 Sobic010G253000 Sobic004G326900--Sobic010G253000 Sobic008G105900 Sobic008G105900 Sobic004G326900--Sobic008G105900 Sobic002G095900 Sobic002G095900 Sobic004G326900--Sobic002G095900 Sobic008G000900--Sobic003G174800 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic008G000900--Sobic008G125600 Sobic010G143200 Sobic010G143200 Sobic008G000900--Sobic010G143200 Sobic004G062800 Sobic004G062800 Sobic008G000900--Sobic004G062800 Sobic008G125501 Sobic008G125501 Sobic008G000900--Sobic008G125501 Sobic006G214400 Sobic006G214400 Sobic008G000900--Sobic006G214400 Sobic001G087100 Sobic001G087100 Sobic008G000900--Sobic001G087100 Sobic008G000900--Sobic003G159450 Sobic008G000900--Sobic008G091671 Sobic003G174800--Sobic008G000900 Sobic003G174800--Sobic001G087100 Sobic003G174800--Sobic006G214400 Sobic003G174800--Sobic010G143200 Sobic007G043900 Sobic007G043900 Sobic003G174800--Sobic007G043900 Sobic004G175600 Sobic004G175600 Sobic003G174800--Sobic004G175600 Sobic001G485600 Sobic001G485600 Sobic003G174800--Sobic001G485600 Sobic001G043400 Sobic001G043400 Sobic003G174800--Sobic001G043400 Sobic010G268300 Sobic010G268300 Sobic003G174800--Sobic010G268300 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic008G091671--Sobic009G197200 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic008G091671--Sobic006G068400 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic008G091671--Sobic007G112900 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic008G091671--Sobic002G212800 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic008G091671--Sobic004G291800 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic008G091671--Sobic009G067501 Sobic008G091671--Sobic003G159450 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic008G091671--Sobic005G099150 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic008G091671--Sobic010G139301 Sobic001G497200 Sobic001G497200 Sobic003G006800--Sobic001G497200 Sobic003G357600 Sobic003G357600 Sobic003G006800--Sobic003G357600 Sobic003G006800--Sobic004G062800 Sobic003G006800--Sobic008G105900 Sobic005G077400 Sobic005G077400 Sobic003G006800--Sobic005G077400 Sobic005G001800 Sobic005G001800 Sobic003G006800--Sobic005G001800 Sobic003G357500 Sobic003G357500 Sobic003G006800--Sobic003G357500 Sobic003G006800--Sobic008G091671 Sobic003G178700 Sobic003G178700 Sobic003G006800--Sobic003G178700 Sobic004G144700 Sobic004G144700 Sobic008G060150--Sobic004G144700 Sobic002G215000 Sobic002G215000 Sobic008G060150--Sobic002G215000 Sobic001G201966 Sobic001G201966 Sobic008G060150--Sobic001G201966 Sobic008G060150--Sobic008G105900 Sobic003G074700 Sobic003G074700 Sobic008G060150--Sobic003G074700 Sobic003G114100 Sobic003G114100 Sobic008G060150--Sobic003G114100 Sobic009G010700 Sobic009G010700 Sobic008G060150--Sobic009G010700 Sobic008G131700 Sobic008G131700 Sobic008G060150--Sobic008G131700 Sobic005G063700 Sobic005G063700 Sobic008G060150--Sobic005G063700 Sobic003G159450--Sobic007G112900 Sobic003G159450--Sobic010G143200 Sobic003G159450--Sobic002G212800 Sobic003G159450--Sobic008G125600 Sobic003G159450--Sobic008G091671 Sobic003G159450--Sobic009G067501 Sobic003G159450--Sobic004G291800 Sobic003G159450--Sobic002G095900 Sobic005G007700 Sobic005G007700 Sobic003G159450--Sobic005G007700 Sobic010G253000--Sobic003G174800 Sobic010G279300 Sobic010G279300 Sobic010G253000--Sobic010G279300 Sobic004G218500 Sobic004G218500 Sobic010G253000--Sobic004G218500 Sobic010G253000--Sobic008G000900 Sobic006G225100 Sobic006G225100 Sobic010G253000--Sobic006G225100 Sobic010G253000--Sobic008G060150 Sobic001G063800 Sobic001G063800 Sobic010G253000--Sobic001G063800 Sobic002G420300 Sobic002G420300 Sobic010G253000--Sobic002G420300 Sobic010G253000--Sobic004G326900 Sobic008G105900--Sobic005G063700 Sobic007G130100 Sobic007G130100 Sobic008G105900--Sobic007G130100 Sobic001G269300 Sobic001G269300 Sobic008G105900--Sobic001G269300 Sobic006G180432 Sobic006G180432 Sobic008G105900--Sobic006G180432 Sobic008G105900--Sobic002G420300 Sobic008G105900--Sobic001G497200 Sobic006G048775 Sobic006G048775 Sobic008G105900--Sobic006G048775 Sobic007G052900 Sobic007G052900 Sobic008G105900--Sobic007G052900 Sobic004G315800 Sobic004G315800 Sobic008G105900--Sobic004G315800 Sobic002G095900--Sobic003G159450 Sobic002G095900--Sobic008G125600 Sobic002G095900--Sobic009G197200 Sobic001G225500 Sobic001G225500 Sobic002G095900--Sobic001G225500 Sobic002G095900--Sobic010G143200 Sobic003G061000 Sobic003G061000 Sobic002G095900--Sobic003G061000 Sobic007G179750 Sobic007G179750 Sobic002G095900--Sobic007G179750 Sobic002G095900--Sobic009G067501 Sobic001G191200 Sobic001G191200 Sobic002G095900--Sobic001G191200
Octagon: transcription factors


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