Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G006800.1
Synonym Sb03g000780
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XJM6
Pfam PF04195
Panther DB PTHR33026 PTHR33026:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g45660.1 : retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G497200 expressed protein -
2 Sobic.003G357600 laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
3 Sobic.004G062800 - -
4 Sobic.008G105900 - -
5 Sobic.005G077400 - -
6 Sobic.005G001800 - -
7 Sobic.003G357500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
8 Sobic.008G091671 - -
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10 Sobic.006G048775 - -
11 Sobic.006G039900 - -
12 Sobic.006G046000 - -
13 Sobic.001G272000 - -
14 Sobic.005G046500 protein kinase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.003G006833 - -
16 Sobic.008G125600 - -
17 Sobic.010G144100 - -
18 Sobic.008G000900 - -
19 Sobic.007G112900 - -
20 Sobic.009G002500 polygalacturonase inhibitor precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G006800 Sobic003G006800 Sobic001G497200 Sobic001G497200 Sobic003G006800--Sobic001G497200 Sobic003G357600 Sobic003G357600 Sobic003G006800--Sobic003G357600 Sobic004G062800 Sobic004G062800 Sobic003G006800--Sobic004G062800 Sobic008G105900 Sobic008G105900 Sobic003G006800--Sobic008G105900 Sobic005G077400 Sobic005G077400 Sobic003G006800--Sobic005G077400 Sobic005G001800 Sobic005G001800 Sobic003G006800--Sobic005G001800 Sobic003G357500 Sobic003G357500 Sobic003G006800--Sobic003G357500 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic003G006800--Sobic008G091671 Sobic003G178700 Sobic003G178700 Sobic003G006800--Sobic003G178700 Sobic001G497200--Sobic005G001800 Sobic010G202000 Sobic010G202000 Sobic001G497200--Sobic010G202000 Sobic006G180432 Sobic006G180432 Sobic001G497200--Sobic006G180432 Sobic007G054000 Sobic007G054000 Sobic001G497200--Sobic007G054000 Sobic007G052900 Sobic007G052900 Sobic001G497200--Sobic007G052900 Sobic006G046000 Sobic006G046000 Sobic001G497200--Sobic006G046000 Sobic001G162300 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Octagon: transcription factors


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