Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G046500.2,Sobic.005G046500.3,Sobic.005G046500.1
Synonym Sb05g003840
Functional annotation protein kinase family protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RH41 , A0A1B6PQ54 , A0A1Z5RGP1
Pfam PF01842 PF07714
Panther DB PTHR23257 PTHR23257:SF471
NCBI CDD KOG0192; Tyrosine kinase specific for activated (GTP-bound) p21cdc42Hs
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016597; amino acid binding GO:0008152metabolic process GO:0006468protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G38470 : ACT-like protein tyrosine kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g06670.1 : protein kinase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034160
Brachypodium PNT70122 , PNT70123 , PNT70124 , PNT70125
Barley -
Wheat TraesCS5B02G124400 , TraesCS5D02G132600 , TraesCS5D02G132600 , TraesCS5B02G124400
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G046500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic005G046500 Sobic005G046500 Sobic003G178700 Sobic003G178700 Sobic005G046500--Sobic003G178700 Sobic009G085400 Sobic009G085400 Sobic005G046500--Sobic009G085400 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic005G046500--Sobic009G004700 Sobic006G214400 Sobic006G214400 Sobic005G046500--Sobic006G214400 Sobic006G180432 Sobic006G180432 Sobic005G046500--Sobic006G180432 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic005G046500--Sobic009G045700 Sobic001G497200 Sobic001G497200 Sobic005G046500--Sobic001G497200 Sobic009G078500 Sobic009G078500 Sobic005G046500--Sobic009G078500 Sobic009G002500 Sobic009G002500 Sobic005G046500--Sobic009G002500 Sobic008G015300 Sobic008G015300 Sobic003G178700--Sobic008G015300 Sobic003G163500 Sobic003G163500 Sobic003G178700--Sobic003G163500 Sobic003G178700--Sobic005G046500 Sobic003G178700--Sobic009G002500 Sobic008G101500 Sobic008G101500 Sobic003G178700--Sobic008G101500 Sobic008G118000 Sobic008G118000 Sobic003G178700--Sobic008G118000 Sobic005G076000 Sobic005G076000 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Octagon: transcription factors


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