Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G052600.2,Sobic.003G052600.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q1F6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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cDNA sequences
Sobic.003G052600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G532700 WD repeat-containing protein 44, putative, expressed -
2 Sobic.005G096000 resistance protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G112400 OsFBX361 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.004G175600 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
5 Sobic.008G125100 Mur ligase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G420300 RNA-binding zinc finger protein, putative, expressed -
7 Sobic.003G245900 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G317800 BNR/Asp-box repeat family protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G192500 ES43 protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G174800 - -
11 Sobic.002G137601 - -
12 Sobic.002G133100 prephenate dehydratase domain containing protein, expressed K05359: ADT, arogenate/prephenate dehydratase
13 Sobic.001G296400 palmitoyl-protein thioesterase 1 precursor, putative, expressed K01074: palmitoyl-protein thioesterase
14 Sobic.010G015000 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
15 Sobic.010G050700 protein kinase, putative, expressed -
16 Sobic.004G104800 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.001G047200 carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed -
18 Sobic.004G178400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K19039: E3 ubiquitin-protein ligase ATL7/58/59
19 Sobic.001G428000 uncharacterized TPR repeat-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G048933 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G052600 Sobic003G052600 Sobic001G532700 Sobic001G532700 Sobic003G052600--Sobic001G532700 Sobic005G096000 Sobic005G096000 Sobic003G052600--Sobic005G096000 Sobic009G112400 Sobic009G112400 Sobic003G052600--Sobic009G112400 Sobic004G175600 Sobic004G175600 Sobic003G052600--Sobic004G175600 Sobic008G125100 Sobic008G125100 Sobic003G052600--Sobic008G125100 Sobic002G420300 Sobic002G420300 Sobic003G052600--Sobic002G420300 Sobic003G245900 Sobic003G245900 Sobic003G052600--Sobic003G245900 Sobic002G317800 Sobic002G317800 Sobic003G052600--Sobic002G317800 Sobic002G192500 Sobic002G192500 Sobic003G052600--Sobic002G192500 Sobic005G084100 Sobic005G084100 Sobic001G532700--Sobic005G084100 Sobic006G059200 Sobic006G059200 Sobic001G532700--Sobic006G059200 Sobic008G136200 Sobic008G136200 Sobic001G532700--Sobic008G136200 Sobic001G253200 Sobic001G253200 Sobic001G532700--Sobic001G253200 Sobic001G036800 Sobic001G036800 Sobic001G532700--Sobic001G036800 Sobic001G360900 Sobic001G360900 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Octagon: transcription factors


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