Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G175600.2,Sobic.004G175600.1
Synonym Sb04g022570
Functional annotation tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed
UniProt A0A194YQ89 , C5XU81
Pfam PF00515 PF13414
Panther DB PTHR15544 PTHR15544:SF0
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G77230 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g34830.1 : tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031595
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G063800 ML domain protein, putative, expressed -
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18 Sobic.003G052600 - -
19 Sobic.007G201400 pentatricopeptide, putative, expressed -
20 Sobic.001G495300 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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