Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G017400.1
Synonym CHX15, Sb05g001490, ATCHX15
Functional annotation ATCHX, putative, expressed
UniProt C5Y3L0
Pfam PF00999
Panther DB PTHR32468 PTHR32468:SF21
NCBI CDD KOG1650; Predicted K+/H+-antiporter
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane GO:0015299solute:proton antiporter activity GO:0006812cation transport


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G13620 : cation/hydrogen exchanger 15
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g02840.1 : ATCHX, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013153
Brachypodium KQJ94885 , KQJ92501 , KQK05704
Barley HORVU1Hr1G069170.2 , HORVU1Hr1G069170.3 , HORVU1Hr1G069170.1 , HORVU1Hr1G069170.6 , HORVU1Hr1G069170.7 , HORVU1Hr1G069170.4 , HORVU1Hr1G069170.5 , HORVU6Hr1G076610.1 , HORVU6Hr1G076610.2 , HORVU6Hr1G076610.3
Wheat TraesCS1B02G314100 , TraesCS6A02G310700 , TraesCS1D02G303200 , TraesCS1D02G303200 , TraesCS6D02G290000 , TraesCS6B02G340700
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic005G017400 Sobic005G017400 Sobic001G332400 Sobic001G332400 Sobic005G017400--Sobic001G332400 Sobic002G061732 Sobic002G061732 Sobic005G017400--Sobic002G061732 Sobic005G199800 Sobic005G199800 Sobic005G017400--Sobic005G199800 Sobic009G072600 Sobic009G072600 Sobic005G017400--Sobic009G072600 Sobic004G057000 Sobic004G057000 Sobic005G017400--Sobic004G057000 Sobic010G158050 Sobic010G158050 Sobic005G017400--Sobic010G158050 Sobic002G323200 Sobic002G323200 Sobic005G017400--Sobic002G323200 Sobic005G192000 Sobic005G192000 Sobic005G017400--Sobic005G192000 Sobic010G157900 Sobic010G157900 Sobic005G017400--Sobic010G157900 Sobic008G191900 Sobic008G191900 Sobic001G332400--Sobic008G191900 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic001G332400--Sobic004G031900 Sobic006G115800 Sobic006G115800 Sobic001G332400--Sobic006G115800 Sobic002G359100 Sobic002G359100 Sobic001G332400--Sobic002G359100 Sobic009G176200 Sobic009G176200 Sobic001G332400--Sobic009G176200 Sobic010G187800 Sobic010G187800 Sobic001G332400--Sobic010G187800 Sobic002G405300 Sobic002G405300 Sobic001G332400--Sobic002G405300 Sobic003G061600 Sobic003G061600 Sobic001G332400--Sobic003G061600 Sobic009G249400 Sobic009G249400 Sobic001G332400--Sobic009G249400 Sobic002G061732--Sobic009G072600 Sobic002G061732--Sobic002G323200 Sobic002G061732--Sobic005G192000 Sobic003G434100 Sobic003G434100 Sobic002G061732--Sobic003G434100 Sobic002G210150 Sobic002G210150 Sobic002G061732--Sobic002G210150 Sobic002G061732--Sobic005G199800 Sobic002G029000 Sobic002G029000 Sobic002G061732--Sobic002G029000 Sobic005G181500 Sobic005G181500 Sobic002G061732--Sobic005G181500 Sobic005G209300 Sobic005G209300 Sobic002G061732--Sobic005G209300 Sobic005G199800--Sobic004G057000 Sobic005G199800--Sobic010G158050 Sobic005G199800--Sobic009G072600 Sobic005G199800--Sobic010G157900 Sobic005G199800--Sobic002G061732 Sobic005G199800--Sobic002G323200 Sobic005G199800--Sobic005G192000 Sobic010G014850 Sobic010G014850 Sobic005G199800--Sobic010G014850 Sobic005G199800--Sobic002G210150 Sobic009G072600--Sobic002G323200 Sobic009G072600--Sobic002G061732 Sobic009G072600--Sobic005G192000 Sobic009G072600--Sobic003G434100 Sobic009G072600--Sobic002G029000 Sobic009G072600--Sobic005G199800 Sobic007G166500 Sobic007G166500 Sobic009G072600--Sobic007G166500 Sobic009G072600--Sobic002G210150 Sobic009G072600--Sobic005G209300 Sobic004G057000--Sobic010G158050 Sobic004G057000--Sobic010G157900 Sobic004G057000--Sobic005G199800 Sobic004G057000--Sobic010G014850 Sobic004G075250 Sobic004G075250 Sobic004G057000--Sobic004G075250 Sobic004G057000--Sobic002G210150 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic004G057000--Sobic002G223650 Sobic004G057000--Sobic005G192000 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic004G057000--Sobic001G467400 Sobic010G158050--Sobic004G057000 Sobic010G158050--Sobic010G014850 Sobic010G158050--Sobic010G157900 Sobic010G158050--Sobic005G199800 Sobic010G158050--Sobic004G075250 Sobic010G158050--Sobic002G223650 Sobic010G158050--Sobic001G467400 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic010G158050--Sobic003G075300 SobicK028900 SobicK028900 Sobic010G158050--SobicK028900 Sobic002G323200--Sobic009G072600 Sobic002G323200--Sobic005G192000 Sobic002G323200--Sobic002G029000 Sobic002G323200--Sobic005G209300 Sobic002G323200--Sobic003G434100 Sobic002G323200--Sobic002G210150 Sobic002G323200--Sobic002G061732 Sobic002G323200--Sobic007G166500 Sobic002G323200--Sobic005G181500 Sobic005G192000--Sobic002G210150 Sobic005G192000--Sobic002G323200 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic005G192000--Sobic010G034200 Sobic002G429000 Sobic002G429000 Sobic005G192000--Sobic002G429000 Sobic009G166000 Sobic009G166000 Sobic005G192000--Sobic009G166000 Sobic009G227500 Sobic009G227500 Sobic005G192000--Sobic009G227500 Sobic004G331500 Sobic004G331500 Sobic005G192000--Sobic004G331500 Sobic001G400400 Sobic001G400400 Sobic005G192000--Sobic001G400400 Sobic005G192000--Sobic005G209300 Sobic010G157900--Sobic004G057000 Sobic010G157900--Sobic010G158050 Sobic004G168150 Sobic004G168150 Sobic010G157900--Sobic004G168150 Sobic010G157900--Sobic004G075250 Sobic010G157900--Sobic002G223650 Sobic010G157900--Sobic005G199800 Sobic010G157900--Sobic002G210150 Sobic010G157900--Sobic005G192000 Sobic003G274100 Sobic003G274100 Sobic010G157900--Sobic003G274100
Octagon: transcription factors


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