Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G044900.1
Synonym Sb05g003720
Functional annotation tetratricopeptide-like helical, putative, expressed
UniProt C5Y547
Pfam PF13812 PF01535
Panther DB PTHR24015
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G13770 : Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g05980.1 : tetratricopeptide-like helical, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034138
Brachypodium PNT64142
Barley -
Wheat TraesCSU02G068400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.007G099300 - -
18 Sobic.004G019700 expressed protein -
19 Sobic.001G006900 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
20 Sobic.009G177901 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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