Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G049475.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PQ78
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G078500 - -
2 Sobic.004G220600 phenylalanine ammonia-lyase, putative, expressed K10775: phenylalanine ammonia-lyase
3 Sobic.006G168000 AP2 domain containing protein, expressed K09286: EREBP-like factor
4 Sobic.008G085350 - -
5 Sobic.003G138400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@WRKY9, expressed -
6 Sobic.010G273700 no apical meristem protein, putative, expressed -
7 Sobic.003G423200 NAM, putative, expressed -
8 Sobic.003G378301 - K17362: acyl-coenzyme A thioesterase 13
9 Sobic.003G366100 expressed protein -
10 Sobic.004G092000 expressed protein -
11 Sobic.003G109832 - -
12 Sobic.005G045200 homeobox domain containing protein, expressed -
13 Sobic.K044407 - -
14 Sobic.010G214200 OsFBK17 - F-box domain and kelch repeat containing protein, expressed -
15 Sobic.008G181801 - -
16 Sobic.005G218500 Jacalin-like lectin domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G376200 expressed protein -
18 Sobic.003G248901 - -
19 Sobic.009G241500 expressed protein -
20 Sobic.007G025900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@amino acid transporter, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G049475 Sobic005G049475 Sobic010G078500 Sobic010G078500 Sobic005G049475--Sobic010G078500 Sobic004G220600 Sobic004G220600 Sobic005G049475--Sobic004G220600 Sobic006G168000 Sobic006G168000 Sobic005G049475--Sobic006G168000 Sobic008G085350 Sobic008G085350 Sobic005G049475--Sobic008G085350 Sobic003G138400 Sobic003G138400 Sobic005G049475--Sobic003G138400 Sobic010G273700 Sobic010G273700 Sobic005G049475--Sobic010G273700 Sobic003G423200 Sobic003G423200 Sobic005G049475--Sobic003G423200 Sobic003G378301 Sobic003G378301 Sobic005G049475--Sobic003G378301 Sobic003G366100 Sobic003G366100 Sobic005G049475--Sobic003G366100 Sobic010G078500--Sobic005G049475 Sobic010G078500--Sobic008G085350 Sobic010G078500--Sobic003G366100 Sobic005G045200 Sobic005G045200 Sobic010G078500--Sobic005G045200 Sobic004G122100 Sobic004G122100 Sobic010G078500--Sobic004G122100 Sobic010G078500--Sobic003G378301 SobicK044407 SobicK044407 Sobic010G078500--SobicK044407 Sobic003G310200 Sobic003G310200 Sobic010G078500--Sobic003G310200 Sobic007G025900 Sobic007G025900 Sobic010G078500--Sobic007G025900 Sobic002G216500 Sobic002G216500 Sobic004G220600--Sobic002G216500 Sobic004G220600--Sobic006G168000 Sobic005G218500 Sobic005G218500 Sobic004G220600--Sobic005G218500 Sobic004G220600--Sobic003G378301 Sobic004G220600--Sobic003G138400 Sobic003G376200 Sobic003G376200 Sobic004G220600--Sobic003G376200 Sobic008G181801 Sobic008G181801 Sobic004G220600--Sobic008G181801 Sobic009G241500 Sobic009G241500 Sobic004G220600--Sobic009G241500 Sobic008G075400 Sobic008G075400 Sobic004G220600--Sobic008G075400 Sobic006G246200 Sobic006G246200 Sobic006G168000--Sobic006G246200 Sobic006G168000--Sobic009G241500 Sobic005G082700 Sobic005G082700 Sobic006G168000--Sobic005G082700 Sobic006G168000--Sobic004G220600 Sobic005G133166 Sobic005G133166 Sobic006G168000--Sobic005G133166 Sobic006G168000--Sobic008G181801 Sobic010G210700 Sobic010G210700 Sobic006G168000--Sobic010G210700 Sobic001G136300 Sobic001G136300 Sobic006G168000--Sobic001G136300 Sobic009G241400 Sobic009G241400 Sobic006G168000--Sobic009G241400 Sobic008G085350--SobicK044407 Sobic008G085350--Sobic003G378301 Sobic006G045000 Sobic006G045000 Sobic008G085350--Sobic006G045000 Sobic001G012000 Sobic001G012000 Sobic008G085350--Sobic001G012000 Sobic001G056400 Sobic001G056400 Sobic008G085350--Sobic001G056400 Sobic008G085350--Sobic005G133166 Sobic008G085350--Sobic008G181801 Sobic002G423600 Sobic002G423600 Sobic008G085350--Sobic002G423600 Sobic001G233200 Sobic001G233200 Sobic008G085350--Sobic001G233200 Sobic003G138400--Sobic010G273700 Sobic003G138400--Sobic004G220600 Sobic004G006500 Sobic004G006500 Sobic003G138400--Sobic004G006500 Sobic001G339600 Sobic001G339600 Sobic003G138400--Sobic001G339600 Sobic009G227800 Sobic009G227800 Sobic003G138400--Sobic009G227800 Sobic004G169900 Sobic004G169900 Sobic003G138400--Sobic004G169900 Sobic004G092000 Sobic004G092000 Sobic003G138400--Sobic004G092000 Sobic003G138400--Sobic002G216500 Sobic009G010400 Sobic009G010400 Sobic003G138400--Sobic009G010400 Sobic010G273700--Sobic009G227800 Sobic010G273700--Sobic003G138400 Sobic003G109832 Sobic003G109832 Sobic010G273700--Sobic003G109832 Sobic010G273700--Sobic007G025900 Sobic007G215500 Sobic007G215500 Sobic010G273700--Sobic007G215500 Sobic010G273700--Sobic004G006500 Sobic010G273700--Sobic003G376200 Sobic010G273700--Sobic004G220600 Sobic001G314300 Sobic001G314300 Sobic010G273700--Sobic001G314300 Sobic003G423200--Sobic007G025900 Sobic003G423200--Sobic010G273700 Sobic003G423200--Sobic003G109832 Sobic003G423200--Sobic004G092000 Sobic001G044800 Sobic001G044800 Sobic003G423200--Sobic001G044800 Sobic003G423200--Sobic005G049475 Sobic002G137800 Sobic002G137800 Sobic003G423200--Sobic002G137800 Sobic003G423200--Sobic009G227800 Sobic003G423200--Sobic003G376200 Sobic003G378301--Sobic001G056400 Sobic003G378301--SobicK044407 Sobic003G378301--Sobic001G012000 Sobic003G378301--Sobic002G423600 Sobic004G217700 Sobic004G217700 Sobic003G378301--Sobic004G217700 Sobic005G182701 Sobic005G182701 Sobic003G378301--Sobic005G182701 Sobic003G378301--Sobic003G310200 Sobic003G378301--Sobic006G045000 Sobic007G055600 Sobic007G055600 Sobic003G378301--Sobic007G055600 Sobic008G060300 Sobic008G060300 Sobic003G366100--Sobic008G060300 Sobic003G366100--Sobic003G310200 Sobic007G089300 Sobic007G089300 Sobic003G366100--Sobic007G089300 Sobic002G173900 Sobic002G173900 Sobic003G366100--Sobic002G173900 Sobic005G193600 Sobic005G193600 Sobic003G366100--Sobic005G193600 Sobic002G202700 Sobic002G202700 Sobic003G366100--Sobic002G202700 Sobic003G366100--Sobic001G012000 Sobic003G366100--Sobic003G378301 Sobic010G130800 Sobic010G130800 Sobic003G366100--Sobic010G130800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.