Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G071700.1
Synonym Sb05g005910, RPS3, RPM1
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y6R2
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF621
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology K13457; RPM1, disease resistance protein RPM1
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G07040 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) ChrUn.fgenesh.mRNA.29 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G222600 RGH1A, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
2 Sobic.008G077900 exostosin family domain containing protein, expressed -
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8 Sobic.002G239700 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
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10 Sobic.010G152300 glycosyltransferase, putative, expressed -
11 Sobic.006G009700 expressed protein -
12 Sobic.002G411000 AP2 domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G506600 exostosin family domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G003400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
15 Sobic.006G205500 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
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17 Sobic.002G118900 auxin-induced protein 5NG4, putative, expressed -
18 Sobic.003G079100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@muconate cycloisomerase, putative, expressed -
19 Sobic.007G090600 CSLC3 - cellulose synthase-like family C, expressed -
20 Sobic.002G076700 IPP transferase, putative, expressed K10760: adenylate dimethylallyltransferase (cytokinin synthase)


Gene co-expression network
sample Sobic005G071700 Sobic005G071700 Sobic005G222600 Sobic005G222600 Sobic005G071700--Sobic005G222600 Sobic008G077900 Sobic008G077900 Sobic005G071700--Sobic008G077900 Sobic009G060700 Sobic009G060700 Sobic005G071700--Sobic009G060700 Sobic003G001300 Sobic003G001300 Sobic005G071700--Sobic003G001300 Sobic008G138700 Sobic008G138700 Sobic005G071700--Sobic008G138700 Sobic003G140200 Sobic003G140200 Sobic005G071700--Sobic003G140200 Sobic002G019100 Sobic002G019100 Sobic005G071700--Sobic002G019100 Sobic002G239700 Sobic002G239700 Sobic005G071700--Sobic002G239700 Sobic001G232000 Sobic001G232000 Sobic005G071700--Sobic001G232000 Sobic005G222600--Sobic009G060700 Sobic005G222600--Sobic003G001300 Sobic005G222600--Sobic008G077900 Sobic005G222600--Sobic008G138700 Sobic005G222600--Sobic005G071700 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic005G222600--Sobic010G213600 Sobic010G152300 Sobic010G152300 Sobic005G222600--Sobic010G152300 Sobic006G092100 Sobic006G092100 Sobic005G222600--Sobic006G092100 Sobic009G058400 Sobic009G058400 Sobic005G222600--Sobic009G058400 Sobic008G077900--Sobic003G001300 Sobic008G077900--Sobic005G222600 Sobic008G077900--Sobic003G140200 Sobic004G322000 Sobic004G322000 Sobic008G077900--Sobic004G322000 Sobic008G077900--Sobic002G239700 Sobic008G077900--Sobic009G060700 Sobic006G205500 Sobic006G205500 Sobic008G077900--Sobic006G205500 Sobic007G090600 Sobic007G090600 Sobic008G077900--Sobic007G090600 Sobic008G077900--Sobic005G071700 Sobic009G060700--Sobic008G138700 Sobic009G060700--Sobic010G152300 Sobic009G060700--Sobic005G222600 Sobic009G060700--Sobic003G001300 Sobic009G060700--Sobic010G213600 Sobic009G060700--Sobic002G019100 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic009G060700--Sobic006G009700 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic009G060700--Sobic003G079100 Sobic004G008600 Sobic004G008600 Sobic009G060700--Sobic004G008600 Sobic003G001300--Sobic008G077900 Sobic003G001300--Sobic009G060700 Sobic003G001300--Sobic005G222600 Sobic010G152500 Sobic010G152500 Sobic003G001300--Sobic010G152500 Sobic003G001300--Sobic008G138700 Sobic003G001300--Sobic006G092100 Sobic007G154100 Sobic007G154100 Sobic003G001300--Sobic007G154100 Sobic003G001300--Sobic004G322000 Sobic003G001300--Sobic010G152300 Sobic008G138700--Sobic006G009700 Sobic008G138700--Sobic009G060700 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic008G138700--Sobic005G066500 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic008G138700--Sobic005G065700 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic008G138700--Sobic005G110511 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic008G138700--Sobic005G071900 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic008G138700--Sobic004G312500 Sobic008G138700--Sobic006G092100 Sobic008G138700--Sobic010G213600 Sobic003G282300 Sobic003G282300 Sobic003G140200--Sobic003G282300 Sobic003G140200--Sobic004G322000 Sobic003G140200--Sobic007G090600 Sobic006G031100 Sobic006G031100 Sobic003G140200--Sobic006G031100 Sobic006G085700 Sobic006G085700 Sobic003G140200--Sobic006G085700 Sobic008G035800 Sobic008G035800 Sobic003G140200--Sobic008G035800 Sobic003G140200--Sobic008G077900 Sobic001G263300 Sobic001G263300 Sobic003G140200--Sobic001G263300 Sobic003G215300 Sobic003G215300 Sobic003G140200--Sobic003G215300 Sobic002G019100--Sobic006G009700 Sobic005G104200 Sobic005G104200 Sobic002G019100--Sobic005G104200 Sobic002G019100--Sobic009G060700 Sobic006G108300 Sobic006G108300 Sobic002G019100--Sobic006G108300 Sobic002G019100--Sobic008G138700 Sobic008G084900 Sobic008G084900 Sobic002G019100--Sobic008G084900 Sobic001G506600 Sobic001G506600 Sobic002G019100--Sobic001G506600 Sobic001G506700 Sobic001G506700 Sobic002G019100--Sobic001G506700 Sobic002G029600 Sobic002G029600 Sobic002G019100--Sobic002G029600 Sobic002G239700--Sobic008G077900 Sobic002G239700--Sobic005G222600 Sobic002G239700--Sobic006G205500 Sobic002G239700--Sobic001G232000 Sobic002G239700--Sobic005G071700 Sobic003G419300 Sobic003G419300 Sobic002G239700--Sobic003G419300 Sobic002G239700--Sobic003G001300 Sobic003G419400 Sobic003G419400 Sobic002G239700--Sobic003G419400 Sobic002G239700--Sobic009G060700 Sobic002G003400 Sobic002G003400 Sobic001G232000--Sobic002G003400 Sobic001G232000--Sobic008G035800 Sobic001G232000--Sobic003G419300 Sobic001G232000--Sobic007G090600 Sobic001G232000--Sobic003G282300 Sobic001G232000--Sobic008G077900 Sobic002G118900 Sobic002G118900 Sobic001G232000--Sobic002G118900 Sobic001G232000--Sobic001G263300 Sobic009G208700 Sobic009G208700 Sobic001G232000--Sobic009G208700
Octagon: transcription factors


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