Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G088300.1
Synonym Sb05g007190
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y851
Pfam PF04398
Panther DB PTHR31676 PTHR31676:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G02360 : Protein of unknown function, DUF538
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g13720.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029533 , Zm00025a025661
Brachypodium KQJ91909
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G261460 - -
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12 Sobic.003G321400 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.001G455100 expressed protein -
14 Sobic.003G121100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
15 Sobic.001G514300 Glutathione S-transferase("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
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17 Sobic.003G115200 expressed protein -
18 Sobic.004G050700 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
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20 Sobic.005G061200 dirigent, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G088300 Sobic005G088300 Sobic001G261460 Sobic001G261460 Sobic005G088300--Sobic001G261460 Sobic010G047600 Sobic010G047600 Sobic005G088300--Sobic010G047600 Sobic003G121000 Sobic003G121000 Sobic005G088300--Sobic003G121000 Sobic008G005100 Sobic008G005100 Sobic005G088300--Sobic008G005100 Sobic001G514200 Sobic001G514200 Sobic005G088300--Sobic001G514200 Sobic008G055100 Sobic008G055100 Sobic005G088300--Sobic008G055100 Sobic010G096400 Sobic010G096400 Sobic005G088300--Sobic010G096400 Sobic001G046800 Sobic001G046800 Sobic005G088300--Sobic001G046800 Sobic008G135300 Sobic008G135300 Sobic005G088300--Sobic008G135300 Sobic001G261460--Sobic010G047600 Sobic001G261460--Sobic001G514200 Sobic001G261460--Sobic001G046800 Sobic009G221800 Sobic009G221800 Sobic001G261460--Sobic009G221800 Sobic003G000200 Sobic003G000200 Sobic001G261460--Sobic003G000200 Sobic003G321400 Sobic003G321400 Sobic001G261460--Sobic003G321400 Sobic005G061200 Sobic005G061200 Sobic001G261460--Sobic005G061200 Sobic003G115200 Sobic003G115200 Sobic001G261460--Sobic003G115200 Sobic010G014400 Sobic010G014400 Sobic001G261460--Sobic010G014400 Sobic010G047600--Sobic001G261460 Sobic010G047600--Sobic001G046800 Sobic010G047600--Sobic003G321400 Sobic010G047600--Sobic009G221800 Sobic010G047600--Sobic001G514200 Sobic003G078900 Sobic003G078900 Sobic010G047600--Sobic003G078900 Sobic010G047600--Sobic003G000200 Sobic010G047600--Sobic003G115200 Sobic004G050700 Sobic004G050700 Sobic010G047600--Sobic004G050700 Sobic002G154600 Sobic002G154600 Sobic003G121000--Sobic002G154600 Sobic003G121000--Sobic001G514200 Sobic003G121000--Sobic008G135300 Sobic003G121100 Sobic003G121100 Sobic003G121000--Sobic003G121100 Sobic003G183300 Sobic003G183300 Sobic003G121000--Sobic003G183300 Sobic003G408900 Sobic003G408900 Sobic003G121000--Sobic003G408900 Sobic003G121000--Sobic010G047600 Sobic003G121000--Sobic001G261460 Sobic007G090460 Sobic007G090460 Sobic003G121000--Sobic007G090460 Sobic010G085800 Sobic010G085800 Sobic008G005100--Sobic010G085800 Sobic001G310300 Sobic001G310300 Sobic008G005100--Sobic001G310300 Sobic008G005100--Sobic002G154600 Sobic001G059700 Sobic001G059700 Sobic008G005100--Sobic001G059700 Sobic008G005100--Sobic001G514200 Sobic009G109000 Sobic009G109000 Sobic008G005100--Sobic009G109000 Sobic009G088900 Sobic009G088900 Sobic008G005100--Sobic009G088900 Sobic003G053400 Sobic003G053400 Sobic008G005100--Sobic003G053400 Sobic006G203700 Sobic006G203700 Sobic008G005100--Sobic006G203700 Sobic001G514200--Sobic008G055100 Sobic001G514200--Sobic010G047600 Sobic001G514200--Sobic001G261460 Sobic001G514200--Sobic001G310300 Sobic010G138300 Sobic010G138300 Sobic001G514200--Sobic010G138300 Sobic001G514200--Sobic009G221800 Sobic001G514200--Sobic005G061200 Sobic007G176000 Sobic007G176000 Sobic001G514200--Sobic007G176000 Sobic001G514200--Sobic002G154600 Sobic008G055100--Sobic009G088900 Sobic008G055100--Sobic001G514200 Sobic008G055100--Sobic009G109000 Sobic007G218800 Sobic007G218800 Sobic008G055100--Sobic007G218800 Sobic008G055100--Sobic010G096400 Sobic001G049900 Sobic001G049900 Sobic008G055100--Sobic001G049900 Sobic008G055100--Sobic007G176000 Sobic007G178900 Sobic007G178900 Sobic008G055100--Sobic007G178900 Sobic008G055100--Sobic002G154600 Sobic010G096400--Sobic008G055100 Sobic004G139300 Sobic004G139300 Sobic010G096400--Sobic004G139300 Sobic002G365550 Sobic002G365550 Sobic010G096400--Sobic002G365550 Sobic002G365801 Sobic002G365801 Sobic010G096400--Sobic002G365801 Sobic009G088500 Sobic009G088500 Sobic010G096400--Sobic009G088500 Sobic002G216100 Sobic002G216100 Sobic010G096400--Sobic002G216100 Sobic001G360500 Sobic001G360500 Sobic010G096400--Sobic001G360500 Sobic002G368300 Sobic002G368300 Sobic010G096400--Sobic002G368300 Sobic010G096400--Sobic007G176000 Sobic001G046800--Sobic010G047600 Sobic001G046800--Sobic001G261460 Sobic010G106700 Sobic010G106700 Sobic001G046800--Sobic010G106700 Sobic002G053900 Sobic002G053900 Sobic001G046800--Sobic002G053900 Sobic009G008800 Sobic009G008800 Sobic001G046800--Sobic009G008800 Sobic001G484000 Sobic001G484000 Sobic001G046800--Sobic001G484000 Sobic001G046800--Sobic010G014400 Sobic001G046800--Sobic003G321400 Sobic003G250700 Sobic003G250700 Sobic001G046800--Sobic003G250700 Sobic008G135300--Sobic003G183300 Sobic001G455100 Sobic001G455100 Sobic008G135300--Sobic001G455100 Sobic008G099100 Sobic008G099100 Sobic008G135300--Sobic008G099100 Sobic008G135300--Sobic003G121000 Sobic006G201000 Sobic006G201000 Sobic008G135300--Sobic006G201000 Sobic001G522700 Sobic001G522700 Sobic008G135300--Sobic001G522700 Sobic007G154200 Sobic007G154200 Sobic008G135300--Sobic007G154200 Sobic006G003100 Sobic006G003100 Sobic008G135300--Sobic006G003100 Sobic008G102800 Sobic008G102800 Sobic008G135300--Sobic008G102800
Octagon: transcription factors


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