Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G102300.1
Synonym Sb05g008910
Functional annotation dirigent, putative, expressed
UniProt C5Y1W5
Pfam PF03018
Panther DB PTHR21495 PTHR21495:SF54
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G42510 : Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g10850.1 : dirigent, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G138900 AAT1, putative, expressed -
2 Sobic.005G101900 O-methyltransferase, putative, expressed -
3 Sobic.009G144800 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
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5 Sobic.008G156500 ankyrin-1, putative, expressed -
6 Sobic.009G144900 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
7 Sobic.010G137366 - -
8 Sobic.001G195300 cytochrome P450, putative, expressed -
9 Sobic.005G110454 - -
10 Sobic.008G164201 - -
11 Sobic.010G072100 Cinnamyl alcohol dehydrogenase(PubMedID : 28606901)@Cinnamyl alcohol dehydrogenase(PubMedID : 19087955)@dehydrogenase, putative, expressed K00083: cinnamyl-alcohol dehydrogenase
12 Sobic.005G110451 - -
13 Sobic.008G158100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Interacting factor of CBLs(PubMedID : 19860013)@CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.17 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
14 Sobic.010G016850 - -
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16 Sobic.001G242000 CSLF7 - cellulose synthase-like family F@ beta1,3@1,4 glucan synthase, expressed -
17 Sobic.002G369400 Sulfotransferase family protein (At)(PubMedID : 27208977)@sulfotransferase domain containing protein, expressed -
18 Sobic.005G070200 OsWAK91 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
19 Sobic.005G069800 OsWAK124 - OsWAK receptor-like protein OsWAK-RLP, expressed -
20 Sobic.005G011900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G102300 Sobic005G102300 Sobic004G138900 Sobic004G138900 Sobic005G102300--Sobic004G138900 Sobic005G101900 Sobic005G101900 Sobic005G102300--Sobic005G101900 Sobic009G144800 Sobic009G144800 Sobic005G102300--Sobic009G144800 Sobic006G010100 Sobic006G010100 Sobic005G102300--Sobic006G010100 Sobic008G156500 Sobic008G156500 Sobic005G102300--Sobic008G156500 Sobic009G144900 Sobic009G144900 Sobic005G102300--Sobic009G144900 Sobic010G137366 Sobic010G137366 Sobic005G102300--Sobic010G137366 Sobic001G195300 Sobic001G195300 Sobic005G102300--Sobic001G195300 Sobic005G110454 Sobic005G110454 Sobic005G102300--Sobic005G110454 Sobic004G138900--Sobic005G102300 Sobic004G138900--Sobic005G101900 Sobic004G138900--Sobic009G144800 Sobic010G016850 Sobic010G016850 Sobic004G138900--Sobic010G016850 Sobic004G138900--Sobic008G156500 Sobic002G150866 Sobic002G150866 Sobic004G138900--Sobic002G150866 Sobic004G138900--Sobic006G010100 Sobic001G242000 Sobic001G242000 Sobic004G138900--Sobic001G242000 Sobic010G223800 Sobic010G223800 Sobic004G138900--Sobic010G223800 Sobic005G101900--Sobic005G102300 Sobic005G101900--Sobic009G144800 Sobic005G101900--Sobic004G138900 Sobic002G369400 Sobic002G369400 Sobic005G101900--Sobic002G369400 Sobic005G101900--Sobic009G144900 Sobic005G101900--Sobic006G010100 Sobic005G101900--Sobic001G242000 Sobic005G070200 Sobic005G070200 Sobic005G101900--Sobic005G070200 Sobic005G011900 Sobic005G011900 Sobic005G101900--Sobic005G011900 Sobic009G144800--Sobic009G144900 Sobic005G177600 Sobic005G177600 Sobic009G144800--Sobic005G177600 Sobic001G114900 Sobic001G114900 Sobic009G144800--Sobic001G114900 Sobic009G144800--Sobic005G070200 Sobic002G010900 Sobic002G010900 Sobic009G144800--Sobic002G010900 Sobic008G022000 Sobic008G022000 Sobic009G144800--Sobic008G022000 Sobic009G144800--Sobic005G101900 Sobic009G144800--Sobic002G369400 Sobic009G144800--Sobic005G110454 Sobic006G235000 Sobic006G235000 Sobic006G010100--Sobic006G235000 Sobic001G185450 Sobic001G185450 Sobic006G010100--Sobic001G185450 Sobic002G063800 Sobic002G063800 Sobic006G010100--Sobic002G063800 Sobic004G245700 Sobic004G245700 Sobic006G010100--Sobic004G245700 Sobic009G145600 Sobic009G145600 Sobic006G010100--Sobic009G145600 Sobic010G062300 Sobic010G062300 Sobic006G010100--Sobic010G062300 Sobic003G043500 Sobic003G043500 Sobic006G010100--Sobic003G043500 Sobic009G145500 Sobic009G145500 Sobic006G010100--Sobic009G145500 Sobic004G315200 Sobic004G315200 Sobic006G010100--Sobic004G315200 Sobic008G156500--Sobic004G138900 Sobic008G156500--Sobic005G102300 Sobic007G215600 Sobic007G215600 Sobic008G156500--Sobic007G215600 Sobic008G156500--Sobic005G101900 Sobic008G156500--Sobic006G010100 Sobic004G240100 Sobic004G240100 Sobic008G156500--Sobic004G240100 Sobic005G101600 Sobic005G101600 Sobic008G156500--Sobic005G101600 Sobic010G072100 Sobic010G072100 Sobic008G156500--Sobic010G072100 Sobic008G158100 Sobic008G158100 Sobic008G156500--Sobic008G158100 Sobic009G144900--Sobic009G144800 Sobic009G144900--Sobic005G177600 Sobic009G144900--Sobic005G070200 Sobic009G144900--Sobic010G016850 Sobic004G189500 Sobic004G189500 Sobic009G144900--Sobic004G189500 Sobic004G169300 Sobic004G169300 Sobic009G144900--Sobic004G169300 Sobic001G400900 Sobic001G400900 Sobic009G144900--Sobic001G400900 Sobic006G121500 Sobic006G121500 Sobic009G144900--Sobic006G121500 Sobic005G069800 Sobic005G069800 Sobic009G144900--Sobic005G069800 Sobic010G137366--Sobic005G102300 Sobic010G137366--Sobic004G138900 Sobic010G036800 Sobic010G036800 Sobic010G137366--Sobic010G036800 Sobic003G423500 Sobic003G423500 Sobic010G137366--Sobic003G423500 Sobic001G449100 Sobic001G449100 Sobic010G137366--Sobic001G449100 Sobic010G137366--Sobic005G101900 Sobic010G137366--Sobic009G144800 Sobic010G137366--Sobic006G121500 Sobic010G137366--Sobic005G011900 Sobic001G195300--Sobic005G110454 Sobic005G110451 Sobic005G110451 Sobic001G195300--Sobic005G110451 Sobic001G401000 Sobic001G401000 Sobic001G195300--Sobic001G401000 Sobic005G224000 Sobic005G224000 Sobic001G195300--Sobic005G224000 Sobic005G071100 Sobic005G071100 Sobic001G195300--Sobic005G071100 Sobic001G195300--Sobic009G144800 Sobic001G195300--Sobic008G158100 Sobic001G195300--Sobic002G010900 Sobic003G417700 Sobic003G417700 Sobic001G195300--Sobic003G417700 Sobic005G110454--Sobic005G110451 Sobic005G110454--Sobic001G195300 Sobic005G110454--Sobic002G010900 Sobic005G110454--Sobic001G401000 Sobic005G110454--Sobic001G114900 Sobic005G110454--Sobic005G224000 Sobic005G110454--Sobic009G144800 Sobic010G211600 Sobic010G211600 Sobic005G110454--Sobic010G211600 Sobic008G158332 Sobic008G158332 Sobic005G110454--Sobic008G158332
Octagon: transcription factors


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