Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G110900.1
Synonym Sb05g012520
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y268
Pfam -
Panther DB PTHR36760 PTHR36760:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G25130 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g26990.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012632
Brachypodium PNT63651
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G012600 BTBA6 - Bric-a-Brac,Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Ankyrin repeat region, expressed K14508: regulatory protein NPR1
2 Sobic.001G266100 POEI14 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
3 Sobic.003G382400 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
4 Sobic.002G353100 expressed protein -
5 Sobic.005G218000 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed -
6 Sobic.006G160800 YABBY domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.006G005800 expressed protein -
8 Sobic.003G090650 - -
9 Sobic.002G183800 L-ascorbate oxidase precursor, putative, expressed -
10 Sobic.010G049600 expressed protein -
11 Sobic.008G114200 AGAP002737-PA, putative, expressed -
12 Sobic.006G005900 OsSCP18 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K09646: serine carboxypeptidase 1
13 Sobic.009G254500 protein kinase, putative, expressed -
14 Sobic.008G013400 nodulin, putative, expressed -
15 Sobic.001G491400 cytochrome P450, putative, expressed -
16 Sobic.006G237800 jp18, putative, expressed -
17 Sobic.006G092300 ZOS4-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
18 Sobic.009G037300 transferase family protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G312200 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@"GLW7(Ortholog in rice:Si et al., 2016)"(PubMedID : 31659860)@SQUAMOSA promoter binding-like transcription factor(PubMedID : 27016024)@OsSPL13 - SBP-box gene family member, expressed -
20 Sobic.001G152400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G110900 Sobic005G110900 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic005G110900--Sobic008G012600 Sobic001G266100 Sobic001G266100 Sobic005G110900--Sobic001G266100 Sobic003G382400 Sobic003G382400 Sobic005G110900--Sobic003G382400 Sobic002G353100 Sobic002G353100 Sobic005G110900--Sobic002G353100 Sobic005G218000 Sobic005G218000 Sobic005G110900--Sobic005G218000 Sobic006G160800 Sobic006G160800 Sobic005G110900--Sobic006G160800 Sobic006G005800 Sobic006G005800 Sobic005G110900--Sobic006G005800 Sobic003G090650 Sobic003G090650 Sobic005G110900--Sobic003G090650 Sobic002G183800 Sobic002G183800 Sobic005G110900--Sobic002G183800 Sobic008G012600--Sobic006G160800 Sobic008G012600--Sobic001G266100 Sobic008G012600--Sobic005G110900 Sobic010G049600 Sobic010G049600 Sobic008G012600--Sobic010G049600 Sobic001G491400 Sobic001G491400 Sobic008G012600--Sobic001G491400 Sobic008G012600--Sobic005G218000 Sobic010G215700 Sobic010G215700 Sobic008G012600--Sobic010G215700 Sobic008G004200 Sobic008G004200 Sobic008G012600--Sobic008G004200 Sobic009G254500 Sobic009G254500 Sobic008G012600--Sobic009G254500 Sobic001G266100--Sobic010G049600 Sobic001G266100--Sobic001G491400 Sobic005G200700 Sobic005G200700 Sobic001G266100--Sobic005G200700 Sobic007G049100 Sobic007G049100 Sobic001G266100--Sobic007G049100 Sobic004G118100 Sobic004G118100 Sobic001G266100--Sobic004G118100 Sobic001G334501 Sobic001G334501 Sobic001G266100--Sobic001G334501 Sobic001G266100--Sobic008G012600 Sobic002G399600 Sobic002G399600 Sobic001G266100--Sobic002G399600 Sobic001G266100--Sobic010G215700 Sobic003G382400--Sobic001G266100 Sobic003G382400--Sobic005G110900 Sobic003G382400--Sobic005G218000 Sobic003G382400--Sobic004G118100 Sobic003G382400--Sobic010G049600 Sobic003G382400--Sobic001G491400 Sobic008G013400 Sobic008G013400 Sobic003G382400--Sobic008G013400 Sobic003G382400--Sobic008G012600 Sobic003G382400--Sobic006G160800 Sobic002G353100--Sobic003G090650 Sobic002G353100--Sobic006G005800 Sobic002G353100--Sobic005G110900 Sobic002G353100--Sobic001G266100 Sobic002G353100--Sobic003G382400 Sobic002G248300 Sobic002G248300 Sobic002G353100--Sobic002G248300 Sobic006G042500 Sobic006G042500 Sobic002G353100--Sobic006G042500 Sobic005G006500 Sobic005G006500 Sobic002G353100--Sobic005G006500 Sobic006G005900 Sobic006G005900 Sobic002G353100--Sobic006G005900 Sobic007G076100 Sobic007G076100 Sobic005G218000--Sobic007G076100 Sobic001G341700 Sobic001G341700 Sobic005G218000--Sobic001G341700 Sobic002G312200 Sobic002G312200 Sobic005G218000--Sobic002G312200 Sobic006G092300 Sobic006G092300 Sobic005G218000--Sobic006G092300 Sobic004G318800 Sobic004G318800 Sobic005G218000--Sobic004G318800 Sobic006G079500 Sobic006G079500 Sobic005G218000--Sobic006G079500 Sobic005G218000--Sobic001G491400 Sobic005G218000--Sobic001G266100 Sobic005G218000--Sobic010G049600 Sobic006G160800--Sobic008G012600 Sobic006G160800--Sobic010G215700 Sobic006G160800--Sobic010G049600 Sobic006G160800--Sobic001G266100 Sobic006G160800--Sobic001G491400 Sobic010G050100 Sobic010G050100 Sobic006G160800--Sobic010G050100 Sobic006G151800 Sobic006G151800 Sobic006G160800--Sobic006G151800 Sobic007G029900 Sobic007G029900 Sobic006G160800--Sobic007G029900 Sobic001G152400 Sobic001G152400 Sobic006G160800--Sobic001G152400 Sobic006G005800--Sobic002G353100 Sobic006G005800--Sobic003G090650 Sobic008G154900 Sobic008G154900 Sobic006G005800--Sobic008G154900 Sobic006G005800--Sobic005G110900 Sobic006G005800--Sobic006G005900 Sobic006G005800--Sobic001G266100 Sobic006G005800--Sobic003G382400 Sobic006G005800--Sobic005G218000 Sobic003G011700 Sobic003G011700 Sobic006G005800--Sobic003G011700 Sobic003G090650--Sobic002G353100 Sobic003G090650--Sobic006G005800 Sobic003G090650--Sobic002G248300 Sobic003G090650--Sobic005G110900 Sobic003G090650--Sobic006G042500 Sobic004G309700 Sobic004G309700 Sobic003G090650--Sobic004G309700 Sobic003G090650--Sobic006G005900 Sobic003G090650--Sobic005G006500 Sobic003G090650--Sobic002G183800 Sobic002G183800--Sobic005G110900 Sobic002G183800--Sobic003G382400 Sobic009G037300 Sobic009G037300 Sobic002G183800--Sobic009G037300 Sobic002G183800--Sobic001G266100 Sobic002G183800--Sobic002G353100 Sobic002G183800--Sobic008G012600 Sobic002G183800--Sobic003G090650 Sobic002G183800--Sobic006G042500 Sobic002G023700 Sobic002G023700 Sobic002G183800--Sobic002G023700
Octagon: transcription factors


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