Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G353100.1
Synonym Sb02g037490
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XCF4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g39100.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G090650 - -
2 Sobic.006G005800 expressed protein -
3 Sobic.005G110900 expressed protein -
4 Sobic.001G266100 POEI14 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
5 Sobic.003G382400 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
6 Sobic.002G248300 polygalacturonase inhibitor 1 precursor, putative, expressed -
7 Sobic.006G042500 U-box domain-containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.005G006500 - -
9 Sobic.006G005900 OsSCP18 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K09646: serine carboxypeptidase 1
10 Sobic.002G183800 L-ascorbate oxidase precursor, putative, expressed -
11 Sobic.008G012600 BTBA6 - Bric-a-Brac,Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Ankyrin repeat region, expressed K14508: regulatory protein NPR1
12 Sobic.008G013400 nodulin, putative, expressed -
13 Sobic.010G049600 expressed protein -
14 Sobic.009G153900 DUF623 domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G491400 cytochrome P450, putative, expressed -
16 Sobic.002G129800 LTPL61 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, putative, expressed -
17 Sobic.004G309700 OsMan03 - Endo-Beta-Mannanase, expressed K19355: mannan endo-1,4-beta-mannosidase
18 Sobic.008G114200 AGAP002737-PA, putative, expressed -
19 Sobic.004G118100 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G218000 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G353100 Sobic002G353100 Sobic003G090650 Sobic003G090650 Sobic002G353100--Sobic003G090650 Sobic006G005800 Sobic006G005800 Sobic002G353100--Sobic006G005800 Sobic005G110900 Sobic005G110900 Sobic002G353100--Sobic005G110900 Sobic001G266100 Sobic001G266100 Sobic002G353100--Sobic001G266100 Sobic003G382400 Sobic003G382400 Sobic002G353100--Sobic003G382400 Sobic002G248300 Sobic002G248300 Sobic002G353100--Sobic002G248300 Sobic006G042500 Sobic006G042500 Sobic002G353100--Sobic006G042500 Sobic005G006500 Sobic005G006500 Sobic002G353100--Sobic005G006500 Sobic006G005900 Sobic006G005900 Sobic002G353100--Sobic006G005900 Sobic003G090650--Sobic002G353100 Sobic003G090650--Sobic006G005800 Sobic003G090650--Sobic002G248300 Sobic003G090650--Sobic005G110900 Sobic003G090650--Sobic006G042500 Sobic004G309700 Sobic004G309700 Sobic003G090650--Sobic004G309700 Sobic003G090650--Sobic006G005900 Sobic003G090650--Sobic005G006500 Sobic002G183800 Sobic002G183800 Sobic003G090650--Sobic002G183800 Sobic006G005800--Sobic002G353100 Sobic006G005800--Sobic003G090650 Sobic008G154900 Sobic008G154900 Sobic006G005800--Sobic008G154900 Sobic006G005800--Sobic005G110900 Sobic006G005800--Sobic006G005900 Sobic006G005800--Sobic001G266100 Sobic006G005800--Sobic003G382400 Sobic005G218000 Sobic005G218000 Sobic006G005800--Sobic005G218000 Sobic003G011700 Sobic003G011700 Sobic006G005800--Sobic003G011700 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic005G110900--Sobic008G012600 Sobic005G110900--Sobic001G266100 Sobic005G110900--Sobic003G382400 Sobic005G110900--Sobic002G353100 Sobic005G110900--Sobic005G218000 Sobic006G160800 Sobic006G160800 Sobic005G110900--Sobic006G160800 Sobic005G110900--Sobic006G005800 Sobic005G110900--Sobic003G090650 Sobic005G110900--Sobic002G183800 Sobic010G049600 Sobic010G049600 Sobic001G266100--Sobic010G049600 Sobic001G491400 Sobic001G491400 Sobic001G266100--Sobic001G491400 Sobic005G200700 Sobic005G200700 Sobic001G266100--Sobic005G200700 Sobic007G049100 Sobic007G049100 Sobic001G266100--Sobic007G049100 Sobic004G118100 Sobic004G118100 Sobic001G266100--Sobic004G118100 Sobic001G334501 Sobic001G334501 Sobic001G266100--Sobic001G334501 Sobic001G266100--Sobic008G012600 Sobic002G399600 Sobic002G399600 Sobic001G266100--Sobic002G399600 Sobic010G215700 Sobic010G215700 Sobic001G266100--Sobic010G215700 Sobic003G382400--Sobic001G266100 Sobic003G382400--Sobic005G110900 Sobic003G382400--Sobic005G218000 Sobic003G382400--Sobic004G118100 Sobic003G382400--Sobic010G049600 Sobic003G382400--Sobic001G491400 Sobic008G013400 Sobic008G013400 Sobic003G382400--Sobic008G013400 Sobic003G382400--Sobic008G012600 Sobic003G382400--Sobic006G160800 Sobic002G248300--Sobic005G006500 Sobic002G129800 Sobic002G129800 Sobic002G248300--Sobic002G129800 Sobic005G164000 Sobic005G164000 Sobic002G248300--Sobic005G164000 Sobic002G248300--Sobic003G090650 Sobic002G248300--Sobic002G353100 Sobic002G248300--Sobic006G005800 Sobic002G248300--Sobic004G309700 Sobic003G140100 Sobic003G140100 Sobic002G248300--Sobic003G140100 Sobic002G248300--Sobic005G110900 Sobic006G042500--Sobic003G090650 Sobic006G042500--Sobic002G353100 Sobic006G042500--Sobic003G382400 Sobic006G042500--Sobic002G183800 Sobic006G042500--Sobic005G110900 Sobic006G042500--Sobic006G005800 Sobic006G042500--Sobic001G266100 Sobic001G447800 Sobic001G447800 Sobic006G042500--Sobic001G447800 Sobic006G042500--Sobic002G248300 Sobic005G006500--Sobic002G248300 Sobic005G006500--Sobic005G164000 Sobic005G006500--Sobic002G129800 Sobic005G006500--Sobic002G353100 Sobic005G006500--Sobic003G090650 Sobic005G006500--Sobic003G140100 Sobic004G346500 Sobic004G346500 Sobic005G006500--Sobic004G346500 Sobic005G006500--Sobic006G005800 Sobic005G006500--Sobic001G266100 Sobic006G005900--Sobic006G005800 Sobic009G023900 Sobic009G023900 Sobic006G005900--Sobic009G023900 Sobic006G005900--Sobic003G090650 Sobic006G005900--Sobic005G110900 Sobic006G005900--Sobic002G353100 Sobic004G324500 Sobic004G324500 Sobic006G005900--Sobic004G324500 Sobic006G005900--Sobic001G447800 Sobic006G005900--Sobic003G382400 Sobic006G005900--Sobic005G218000
Octagon: transcription factors


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