Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G006500.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RH58
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G248300 polygalacturonase inhibitor 1 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.005G164000 glucan endo-1,3-beta-glucosidase precursor, putative, expressed -
3 Sobic.002G129800 LTPL61 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, putative, expressed -
4 Sobic.002G353100 expressed protein -
5 Sobic.003G090650 - -
6 Sobic.003G140100 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G346500 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
8 Sobic.006G005800 expressed protein -
9 Sobic.001G266100 POEI14 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
10 Sobic.009G153900 DUF623 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G110900 expressed protein -
12 Sobic.009G052300 suppressor of Mek, putative, expressed K17491: SMEK, protein phosphatase 4 regulatory subunit 3
13 Sobic.001G152400 expressed protein -
14 Sobic.003G382400 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
15 Sobic.010G049600 expressed protein -
16 Sobic.006G042500 U-box domain-containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.008G013400 nodulin, putative, expressed -
18 Sobic.005G226600 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
19 Sobic.008G012600 BTBA6 - Bric-a-Brac,Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Ankyrin repeat region, expressed K14508: regulatory protein NPR1
20 Sobic.006G005900 OsSCP18 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K09646: serine carboxypeptidase 1


Gene co-expression network
sample Sobic005G006500 Sobic005G006500 Sobic002G248300 Sobic002G248300 Sobic005G006500--Sobic002G248300 Sobic005G164000 Sobic005G164000 Sobic005G006500--Sobic005G164000 Sobic002G129800 Sobic002G129800 Sobic005G006500--Sobic002G129800 Sobic002G353100 Sobic002G353100 Sobic005G006500--Sobic002G353100 Sobic003G090650 Sobic003G090650 Sobic005G006500--Sobic003G090650 Sobic003G140100 Sobic003G140100 Sobic005G006500--Sobic003G140100 Sobic004G346500 Sobic004G346500 Sobic005G006500--Sobic004G346500 Sobic006G005800 Sobic006G005800 Sobic005G006500--Sobic006G005800 Sobic001G266100 Sobic001G266100 Sobic005G006500--Sobic001G266100 Sobic002G248300--Sobic005G006500 Sobic002G248300--Sobic002G129800 Sobic002G248300--Sobic005G164000 Sobic002G248300--Sobic003G090650 Sobic002G248300--Sobic002G353100 Sobic002G248300--Sobic006G005800 Sobic004G309700 Sobic004G309700 Sobic002G248300--Sobic004G309700 Sobic002G248300--Sobic003G140100 Sobic005G110900 Sobic005G110900 Sobic002G248300--Sobic005G110900 Sobic005G164000--Sobic005G006500 Sobic005G164000--Sobic002G248300 Sobic005G164000--Sobic003G140100 Sobic005G164000--Sobic002G129800 Sobic002G157400 Sobic002G157400 Sobic005G164000--Sobic002G157400 Sobic004G223100 Sobic004G223100 Sobic005G164000--Sobic004G223100 Sobic010G053500 Sobic010G053500 Sobic005G164000--Sobic010G053500 Sobic005G226600 Sobic005G226600 Sobic005G164000--Sobic005G226600 Sobic001G152400 Sobic001G152400 Sobic005G164000--Sobic001G152400 Sobic002G129800--Sobic002G248300 Sobic002G129800--Sobic005G006500 Sobic002G129800--Sobic005G164000 Sobic002G129800--Sobic002G353100 Sobic002G129800--Sobic003G140100 Sobic002G129800--Sobic001G266100 Sobic002G129800--Sobic003G090650 Sobic002G129800--Sobic001G152400 Sobic010G049600 Sobic010G049600 Sobic002G129800--Sobic010G049600 Sobic002G353100--Sobic003G090650 Sobic002G353100--Sobic006G005800 Sobic002G353100--Sobic005G110900 Sobic002G353100--Sobic001G266100 Sobic003G382400 Sobic003G382400 Sobic002G353100--Sobic003G382400 Sobic002G353100--Sobic002G248300 Sobic006G042500 Sobic006G042500 Sobic002G353100--Sobic006G042500 Sobic002G353100--Sobic005G006500 Sobic006G005900 Sobic006G005900 Sobic002G353100--Sobic006G005900 Sobic003G090650--Sobic002G353100 Sobic003G090650--Sobic006G005800 Sobic003G090650--Sobic002G248300 Sobic003G090650--Sobic005G110900 Sobic003G090650--Sobic006G042500 Sobic003G090650--Sobic004G309700 Sobic003G090650--Sobic006G005900 Sobic003G090650--Sobic005G006500 Sobic002G183800 Sobic002G183800 Sobic003G090650--Sobic002G183800 Sobic003G140100--Sobic002G157400 Sobic003G140100--Sobic010G053500 Sobic007G049600 Sobic007G049600 Sobic003G140100--Sobic007G049600 Sobic001G428300 Sobic001G428300 Sobic003G140100--Sobic001G428300 Sobic003G140100--Sobic005G164000 Sobic002G360801 Sobic002G360801 Sobic003G140100--Sobic002G360801 Sobic003G140100--Sobic005G226600 Sobic008G016500 Sobic008G016500 Sobic003G140100--Sobic008G016500 Sobic003G140100--Sobic004G223100 Sobic004G346500--Sobic005G006500 Sobic006G117900 Sobic006G117900 Sobic004G346500--Sobic006G117900 Sobic006G184000 Sobic006G184000 Sobic004G346500--Sobic006G184000 Sobic004G346500--Sobic006G005800 Sobic009G153900 Sobic009G153900 Sobic004G346500--Sobic009G153900 Sobic004G346500--Sobic001G152400 Sobic004G346500--Sobic005G164000 Sobic004G346500--Sobic002G248300 Sobic007G115400 Sobic007G115400 Sobic004G346500--Sobic007G115400 Sobic006G005800--Sobic002G353100 Sobic006G005800--Sobic003G090650 Sobic008G154900 Sobic008G154900 Sobic006G005800--Sobic008G154900 Sobic006G005800--Sobic005G110900 Sobic006G005800--Sobic006G005900 Sobic006G005800--Sobic001G266100 Sobic006G005800--Sobic003G382400 Sobic005G218000 Sobic005G218000 Sobic006G005800--Sobic005G218000 Sobic003G011700 Sobic003G011700 Sobic006G005800--Sobic003G011700 Sobic001G266100--Sobic010G049600 Sobic001G491400 Sobic001G491400 Sobic001G266100--Sobic001G491400 Sobic005G200700 Sobic005G200700 Sobic001G266100--Sobic005G200700 Sobic007G049100 Sobic007G049100 Sobic001G266100--Sobic007G049100 Sobic004G118100 Sobic004G118100 Sobic001G266100--Sobic004G118100 Sobic001G334501 Sobic001G334501 Sobic001G266100--Sobic001G334501 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic001G266100--Sobic008G012600 Sobic002G399600 Sobic002G399600 Sobic001G266100--Sobic002G399600 Sobic010G215700 Sobic010G215700 Sobic001G266100--Sobic010G215700
Octagon: transcription factors


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